More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0429 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0983  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  88.8 
 
 
384 aa  640    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0429  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  100 
 
 
386 aa  758    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413343  normal  0.160769 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1143  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  58.51 
 
 
388 aa  400  9.999999999999999e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.525995  hitchhiker  0.000104524 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3870  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  58.01 
 
 
384 aa  375  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  40.78 
 
 
388 aa  274  2.0000000000000002e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  41.09 
 
 
388 aa  273  3e-72  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  40.57 
 
 
390 aa  272  8.000000000000001e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  41.45 
 
 
387 aa  269  8e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  42.38 
 
 
386 aa  267  2e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  40.52 
 
 
388 aa  266  4e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  41.39 
 
 
390 aa  264  2e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0765  acetyl-CoA acetyltransferase  42.7 
 
 
388 aa  264  2e-69  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.155191  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  39.28 
 
 
387 aa  255  8e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  40.93 
 
 
387 aa  248  2e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0527  acetyl-CoA acetyltransferase  38.42 
 
 
392 aa  228  1e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.191077  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0021  acetyl-CoA acetyltransferase  36.13 
 
 
394 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1460  acetyl-CoA acetyltransferase  38.17 
 
 
392 aa  219  7e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0459  acetyl-CoA acetyltransferase  37.91 
 
 
392 aa  219  8.999999999999998e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221902  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0378  acetyl-CoA acetyltransferase  37.91 
 
 
392 aa  217  4e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.855021  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0597  Thiolase  39.58 
 
 
387 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4195  Thiolase  35.05 
 
 
390 aa  203  3e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0815171  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1926  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.99 
 
 
392 aa  201  9.999999999999999e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0596  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.73 
 
 
392 aa  199  9e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4354  thiolase  34.38 
 
 
387 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4020  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.47 
 
 
392 aa  197  2.0000000000000003e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.469452  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4421  Thiolase  34.1 
 
 
394 aa  197  3e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0806685  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2505  thiolase  36.06 
 
 
387 aa  197  3e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.675059 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1631  propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.42 
 
 
387 aa  196  5.000000000000001e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4153  thiolase family protein  35.77 
 
 
387 aa  193  5e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526384  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3781  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  36.18 
 
 
388 aa  192  1e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000395838  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2477  3-ketoacyl-CoA thiolase  35.05 
 
 
388 aa  185  1.0000000000000001e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4151  thiolase  34.11 
 
 
386 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0423188  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1084  acetyl-CoA C-acyltransferase  34.93 
 
 
368 aa  182  1e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0837  acetyl-CoA acetyltransferase  34.1 
 
 
390 aa  178  1e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0896  Thiolase  34.37 
 
 
388 aa  178  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1006  Thiolase  36.86 
 
 
388 aa  179  1e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.63654  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2284  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.36 
 
 
383 aa  177  2e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0131646  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0457  acetyl-CoA acetyltransferase  34.1 
 
 
391 aa  177  3e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0795  acetyl-CoA C-acyltransferase  33.06 
 
 
369 aa  176  5e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3319  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.94 
 
 
384 aa  176  7e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.16037  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1711  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.63 
 
 
386 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2810  Thiolase  36.55 
 
 
388 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0349733  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0396  acetyl-CoA acetyltransferase  34.29 
 
 
396 aa  172  7.999999999999999e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1358  acetyl-CoA C-acyltransferase  31.33 
 
 
368 aa  171  2e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3523  3-ketoacyl-CoA thiolase  32.2 
 
 
384 aa  171  3e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0675  Beta-ketoacyl synthase  33.07 
 
 
395 aa  170  4e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2713  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.44 
 
 
394 aa  169  5e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00447624  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1437  acetyl-CoA acetyltransferase  34.03 
 
 
392 aa  169  6e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0544817  normal  0.0152215 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2242  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.9 
 
 
389 aa  169  9e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0813  acetyl-CoA C-acyltransferase  32.89 
 
 
368 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000183957 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2744  thiolase  32.93 
 
 
412 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569153  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1242  acetyl-CoA C-acyltransferase  30.61 
 
 
380 aa  163  4.0000000000000004e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0529567  normal  0.0106911 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1277  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.14 
 
 
397 aa  162  6e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1472  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  30.94 
 
 
417 aa  162  7e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0628  putative nonspecific lipid-transfer protein (sterol carrier protein)  33.07 
 
 
386 aa  162  8.000000000000001e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0435  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.95 
 
 
387 aa  161  2e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6295  thiolase  35.36 
 
 
392 aa  160  5e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2056  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.05 
 
 
398 aa  159  8e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0124165  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2721  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.86 
 
 
395 aa  157  4e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0558  thiolase  31.49 
 
 
407 aa  155  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1529  thiolase  30.95 
 
 
390 aa  154  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.380974 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0386  acetyl-CoA acetyltransferase  32.29 
 
 
387 aa  154  2e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1335  acetyl-CoA acetyltransferase  35.71 
 
 
460 aa  154  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0510  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  29.8 
 
 
376 aa  152  1e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1309  acetyl-CoA acetyltransferase  33.16 
 
 
387 aa  151  2e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0879061 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0489  acetyl-CoA acetyltransferase  32.49 
 
 
394 aa  150  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.201568  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3483  Thiolase  34.4 
 
 
383 aa  150  5e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5033  thiolase  31.01 
 
 
413 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0302064  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5827  thiolase  31.01 
 
 
413 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1608  acetyl-CoA C-acetyltransferase (acetoacetyl-CoAthiolase) (AcaB-1)  29.91 
 
 
359 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4352  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.03 
 
 
413 aa  146  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5101  Thiolase  29.73 
 
 
413 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1838  thiolase  30.68 
 
 
413 aa  145  9e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4309  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.82 
 
 
378 aa  145  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3070  acetyl-CoA acetyltransferase  28.72 
 
 
400 aa  145  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.430335 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3505  acetyl-CoA acetyltransferase  33.52 
 
 
389 aa  144  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17880  acetyl-CoA acetyltransferase  31.38 
 
 
382 aa  144  4e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.241643  normal  0.751852 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0646  acetyl-CoA acetyltransferase  32.41 
 
 
397 aa  142  7e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6395  thiolase  29.64 
 
 
413 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0582995  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4205  thiolase  31.41 
 
 
413 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18950  acetyl-CoA acetyltransferase  32.14 
 
 
395 aa  140  4.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0500553  normal  0.490702 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1290  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  29.46 
 
 
378 aa  139  7e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1647  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  30.48 
 
 
360 aa  139  1e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1551  acetyl-CoA acetyltransferase  26.68 
 
 
404 aa  137  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3907  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  30.18 
 
 
381 aa  135  9e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114937  normal  0.102476 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2763  putative SCP-x_thiolase/acetyl- CoA acetyltransferase, PaaJ-like  30.33 
 
 
400 aa  135  9e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.470356  normal  0.471158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  35.66 
 
 
383 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1384  acetyl-CoA acetyltransferase  34.19 
 
 
395 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.657708  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3568  lipid-transfer protein  34.03 
 
 
399 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0803413 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0860  putative thiolase  31.27 
 
 
384 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016172  normal  0.461503 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3870  thiolase  34.03 
 
 
384 aa  134  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.28834 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3625  lipid-transfer protein  35.89 
 
 
393 aa  134  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.595778  normal  0.739146 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4527  lipid-transfer protein  33.13 
 
 
399 aa  133  5e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0591575  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3030  lipid-transfer protein  33.83 
 
 
399 aa  133  6e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.463243  normal  0.246741 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3015  lipid-transfer protein  33.83 
 
 
399 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.630367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3061  lipid-transfer protein  33.83 
 
 
399 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.860453 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  31.58 
 
 
380 aa  132  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  31.68 
 
 
388 aa  131  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3588  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  30.03 
 
 
380 aa  130  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.193067  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6077  acetyl-CoA acetyltransferase  31.86 
 
 
390 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>