More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2009 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  100 
 
 		 380 aa  789    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2931  hypothetical protein  76.46 
 
 		 379 aa  607  9.999999999999999e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1978  hypothetical protein  75.66 
 
 		 379 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960116  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3588  thiolase  75.93 
 
 		 379 aa  600  1e-170  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1879  putative lipid transfer protein  75.4 
 
 		 379 aa  598  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0403443 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1686  Acetyl-CoA acetyltransferase-like  75.4 
 
 		 379 aa  580  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0569144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3401  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  69.23 
 
 		 380 aa  533  1e-150  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0771846 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2935  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  60.53 
 
 		 383 aa  486  1e-136  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.220087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5255  thiolase  42.56 
 
 		 389 aa  309  4e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3512  thiolase  43.19 
 
 		 390 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  43.95 
 
 		 382 aa  303  2.0000000000000002e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5279  thiolase  42.86 
 
 		 385 aa  302  5.000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  45.19 
 
 		 383 aa  302  8.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0129  thiolase  45.41 
 
 		 402 aa  298  8e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5776  thiolase  44.39 
 
 		 393 aa  298  1e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0147  thiolase  45.41 
 
 		 402 aa  297  3e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0177  thiolase  44.36 
 
 		 403 aa  295  1e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4625  thiolase  43.42 
 
 		 390 aa  294  2e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6845  thiolase  40.47 
 
 		 383 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4368  thiolase  42.74 
 
 		 383 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.739547  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1074  thiolase  43.04 
 
 		 384 aa  287  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6629  thiolase  43.92 
 
 		 381 aa  286  2.9999999999999996e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51190  thiolase  42.31 
 
 		 383 aa  285  8e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113364 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5111  thiolase  44.25 
 
 		 390 aa  281  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000299159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4071  thiolase  44.44 
 
 		 382 aa  280  4e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2277  thiolase  40.42 
 
 		 383 aa  276  4e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.573629 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2581  thiolase  38.89 
 
 		 385 aa  271  1e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0342  thiolase  40 
 
 		 381 aa  271  2e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0844  thiolase  43.65 
 
 		 384 aa  265  1e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3607  acetyl-CoA acetyltransferase  44.35 
 
 		 382 aa  263  4e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.241671  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  41.75 
 
 		 388 aa  261  1e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3115  acetyl-CoA acetyltransferase  42.94 
 
 		 382 aa  259  6e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119662  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5006  acetyl-CoA acetyltransferase  42.94 
 
 		 382 aa  256  5e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  0.11432 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4152  acetyl-CoA acetyltransferase  40.46 
 
 		 389 aa  253  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500938  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3829  acetyl-CoA acetyltransferase  42.01 
 
 		 388 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.401188  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5499  acetyl-CoA acetyltransferase  41.98 
 
 		 391 aa  252  7e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4413  acetyl-CoA acetyltransferase  42.01 
 
 		 389 aa  252  8.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00900083  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1757  acetyl-CoA acetyltransferase  41.6 
 
 		 391 aa  249  5e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439431  normal  0.143058 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3805  acetyl-CoA acetyltransferase  41.75 
 
 		 388 aa  248  9e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2350  acetyl-CoA acetyltransferase  44.07 
 
 		 382 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.731467  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4565  acetyl-CoA acetyltransferase  41.24 
 
 		 388 aa  240  4e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153409  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2663  acetyl-CoA acetyltransferase  40.77 
 
 		 385 aa  233  5e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4787  acetyl-CoA acetyltransferase  40.46 
 
 		 387 aa  228  9e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0607631  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0860  putative thiolase  39.79 
 
 		 384 aa  227  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016172  normal  0.461503 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1502  acetyl-CoA acetyltransferase  39.11 
 
 		 390 aa  219  6e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7411  acetyl-CoA acetyltransferase  40.73 
 
 		 383 aa  217  2.9999999999999998e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2839  hypothetical protein  35.66 
 
 		 388 aa  203  5e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00983373  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5095  acetyl-CoA acetyltransferase  37.03 
 
 		 395 aa  202  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.926475 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0887  lipid-transfer protein  34.88 
 
 		 390 aa  197  3e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13573  lipid-transfer protein  34.84 
 
 		 386 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000077821 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2093  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  39.83 
 
 		 385 aa  196  8.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3479  lipid-transfer protein  36.07 
 
 		 391 aa  195  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8194  lipid-transfer protein  36.83 
 
 		 390 aa  192  9e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3858  hypothetical protein  36.6 
 
 		 390 aa  192  1e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.198117  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  34.38 
 
 		 387 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3651  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  38.17 
 
 		 387 aa  188  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.48348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4266  hypothetical protein  35.34 
 
 		 381 aa  187  3e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.804759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0511  lipid-transfer protein  35.61 
 
 		 389 aa  187  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2786  lipid-transfer protein  34.31 
 
 		 394 aa  186  4e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0063  lipid-transfer protein  38.54 
 
 		 390 aa  186  5e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1803  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.31 
 
 		 389 aa  186  7e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.851643 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2361  lipid-transfer protein  34.93 
 
 		 394 aa  184  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5253  lipid-transfer protein  33.86 
 
 		 385 aa  184  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509405 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2141  lipid-transfer protein  35.07 
 
 		 392 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5057  lipid-transfer protein  33.33 
 
 		 385 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0352  hypothetical protein  35.15 
 
 		 386 aa  182  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000477716  decreased coverage  0.0000013738 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5302  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.42 
 
 		 388 aa  181  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.739228 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  34.04 
 
 		 386 aa  182  1e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1484  hypothetical protein  38.76 
 
 		 389 aa  181  2e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185234  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4758  lipid-transfer protein  32.82 
 
 		 385 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2744  putative thiolase/acetyl-CoA acetyltransferase, PaaJ-like  34.19 
 
 		 406 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0906041 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4672  lipid-transfer protein  32.82 
 
 		 385 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.495157  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5553  hypothetical protein  34.96 
 
 		 383 aa  179  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  33.6 
 
 		 388 aa  176  8e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1513  lipid-transfer protein  32.54 
 
 		 385 aa  175  9e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  32.02 
 
 		 390 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4021  putative nonspecific lipid-transfer protein  33.25 
 
 		 378 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8761  lipid-transfer protein  33.97 
 
 		 385 aa  172  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.134204 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3567  putative thiolase  36.78 
 
 		 378 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4311  hypothetical protein  33.16 
 
 		 389 aa  170  3e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5282  hypothetical protein  35.37 
 
 		 390 aa  169  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  32.05 
 
 		 390 aa  169  6e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3277  hypothetical protein  34.96 
 
 		 388 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  32.23 
 
 		 387 aa  168  1e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  32.11 
 
 		 388 aa  168  1e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0899  lipid-transfer protein  33.68 
 
 		 389 aa  169  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3215  hypothetical protein  34.96 
 
 		 388 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3226  hypothetical protein  34.96 
 
 		 388 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0435  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  30.65 
 
 		 387 aa  167  2e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0386  acetyl-CoA acetyltransferase  31.35 
 
 		 387 aa  167  2e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2151  nonspecific lipid-transfer protein  30.75 
 
 		 403 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0581  hypothetical protein  32.88 
 
 		 395 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0835832  normal  0.505436 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  31.32 
 
 		 388 aa  166  5.9999999999999996e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1309  acetyl-CoA acetyltransferase  30.05 
 
 		 387 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0879061 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0859  thiolase  32.22 
 
 		 389 aa  166  9e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.823302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2016  lipid-transfer protein  34.16 
 
 		 388 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.314529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4055  putative nonspecific lipid-transfer protein  32.91 
 
 		 397 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0205444  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0031  hypothetical protein  32.43 
 
 		 402 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.761011  normal  0.262129 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1833  putative thiolase  33.33 
 
 		 405 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0913085  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0041  hypothetical protein  32.43 
 
 		 402 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>