More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0860 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0860  putative thiolase  100 
 
 		 384 aa  763    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016172  normal  0.461503 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  54.4 
 
 		 388 aa  410  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3567  putative thiolase  52.67 
 
 		 378 aa  362  5.0000000000000005e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2105  thiolase  53.32 
 
 		 404 aa  362  9e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0715913  normal  0.0186682 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3314  thiolase  52.79 
 
 		 404 aa  362  9e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3952  putative thiolase  54.64 
 
 		 378 aa  352  8.999999999999999e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.130005  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3972  thiolase  51.72 
 
 		 383 aa  336  5e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.330404 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3322  thiolase  51.72 
 
 		 383 aa  335  5.999999999999999e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00152041  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3886  thiolase  50.13 
 
 		 381 aa  300  3e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.266996  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5279  thiolase  43.27 
 
 		 385 aa  281  1e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3512  thiolase  39.58 
 
 		 390 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6629  thiolase  43.34 
 
 		 381 aa  253  4.0000000000000004e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5111  thiolase  40.63 
 
 		 390 aa  250  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000299159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0147  thiolase  41.47 
 
 		 402 aa  249  5e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0129  thiolase  40.94 
 
 		 402 aa  249  7e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2581  thiolase  38.79 
 
 		 385 aa  248  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5255  thiolase  40.91 
 
 		 389 aa  246  4.9999999999999997e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5776  thiolase  40.94 
 
 		 393 aa  245  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51190  thiolase  39.68 
 
 		 383 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113364 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  39.9 
 
 		 383 aa  243  3e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6845  thiolase  37.9 
 
 		 383 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0177  thiolase  40.11 
 
 		 403 aa  241  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4625  thiolase  38.52 
 
 		 390 aa  239  5.999999999999999e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  40.31 
 
 		 382 aa  238  9e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3829  acetyl-CoA acetyltransferase  41.56 
 
 		 388 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.401188  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4368  thiolase  38.62 
 
 		 383 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.739547  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2935  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  41.16 
 
 		 383 aa  232  7.000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.220087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0342  thiolase  40.73 
 
 		 381 aa  232  9e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4413  acetyl-CoA acetyltransferase  40.58 
 
 		 389 aa  229  5e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00900083  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3805  acetyl-CoA acetyltransferase  39.79 
 
 		 388 aa  229  6e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  39.79 
 
 		 380 aa  227  2e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2931  hypothetical protein  37.7 
 
 		 379 aa  225  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2277  thiolase  36.24 
 
 		 383 aa  225  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.573629 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4565  acetyl-CoA acetyltransferase  40.52 
 
 		 388 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153409  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5499  acetyl-CoA acetyltransferase  40.52 
 
 		 391 aa  223  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5006  acetyl-CoA acetyltransferase  37.97 
 
 		 382 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  0.11432 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4152  acetyl-CoA acetyltransferase  39.79 
 
 		 389 aa  223  6e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500938  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7411  acetyl-CoA acetyltransferase  40.16 
 
 		 383 aa  223  6e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4071  thiolase  39.85 
 
 		 382 aa  223  6e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1879  putative lipid transfer protein  37.17 
 
 		 379 aa  222  9e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0403443 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3588  thiolase  37.7 
 
 		 379 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1978  hypothetical protein  36.65 
 
 		 379 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960116  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4787  acetyl-CoA acetyltransferase  39.84 
 
 		 387 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0607631  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3607  acetyl-CoA acetyltransferase  38.89 
 
 		 382 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.241671  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1757  acetyl-CoA acetyltransferase  38.36 
 
 		 391 aa  217  2.9999999999999998e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439431  normal  0.143058 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4266  hypothetical protein  37.17 
 
 		 381 aa  216  5.9999999999999996e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.804759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1074  thiolase  38.06 
 
 		 384 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2350  acetyl-CoA acetyltransferase  38.98 
 
 		 382 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.731467  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3115  acetyl-CoA acetyltransferase  37.83 
 
 		 382 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119662  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3215  hypothetical protein  38.52 
 
 		 388 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3226  hypothetical protein  38.52 
 
 		 388 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3277  hypothetical protein  38.52 
 
 		 388 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0844  thiolase  39.47 
 
 		 384 aa  210  4e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1502  acetyl-CoA acetyltransferase  37.87 
 
 		 390 aa  207  3e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2839  hypothetical protein  38.87 
 
 		 388 aa  206  6e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00983373  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1686  Acetyl-CoA acetyltransferase-like  37.7 
 
 		 379 aa  204  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0569144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2151  nonspecific lipid-transfer protein  34.26 
 
 		 403 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1803  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.07 
 
 		 389 aa  200  3.9999999999999996e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.851643 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2663  acetyl-CoA acetyltransferase  41.07 
 
 		 385 aa  199  6e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3651  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  36.65 
 
 		 387 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.48348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3401  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  38.26 
 
 		 380 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0771846 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2093  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  39.41 
 
 		 385 aa  198  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  34.32 
 
 		 390 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5095  acetyl-CoA acetyltransferase  39.79 
 
 		 395 aa  196  5.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.926475 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3479  lipid-transfer protein  37.5 
 
 		 391 aa  195  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0031  hypothetical protein  35.28 
 
 		 402 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.761011  normal  0.262129 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5302  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.17 
 
 		 388 aa  193  4e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.739228 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4180  putative acetyl-CoA C-acetyltransferase  34.15 
 
 		 394 aa  193  5e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.785914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4021  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.56 
 
 		 378 aa  193  5e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0041  hypothetical protein  35.28 
 
 		 402 aa  193  5e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0050  hypothetical protein  35.28 
 
 		 402 aa  193  5e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0851197  normal  0.0510911 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  35.66 
 
 		 388 aa  189  5e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0899  lipid-transfer protein  38.4 
 
 		 389 aa  186  6e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  33.61 
 
 		 387 aa  184  3e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3483  Thiolase  35.2 
 
 		 383 aa  184  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  34.7 
 
 		 387 aa  182  7e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4311  hypothetical protein  37.43 
 
 		 389 aa  182  7e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2744  putative thiolase/acetyl-CoA acetyltransferase, PaaJ-like  31.85 
 
 		 406 aa  182  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0906041 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  32.71 
 
 		 390 aa  182  1e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1902  hypothetical protein  34.78 
 
 		 396 aa  180  2.9999999999999997e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.986081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13573  lipid-transfer protein  35.79 
 
 		 386 aa  180  4e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000077821 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4354  thiolase  34.32 
 
 		 387 aa  180  4e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0352  hypothetical protein  33.96 
 
 		 386 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000477716  decreased coverage  0.0000013738 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  33.51 
 
 		 387 aa  179  9e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6832  DitF protein  37.47 
 
 		 396 aa  178  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  32.43 
 
 		 388 aa  178  2e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2103  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  36.01 
 
 		 384 aa  177  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.655505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  33.6 
 
 		 386 aa  176  5e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0887  lipid-transfer protein  36.73 
 
 		 390 aa  176  8e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0511  lipid-transfer protein  35.22 
 
 		 389 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8194  lipid-transfer protein  35.92 
 
 		 390 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2141  lipid-transfer protein  34.24 
 
 		 392 aa  173  5e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1631  propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.45 
 
 		 387 aa  172  5.999999999999999e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2786  lipid-transfer protein  36.68 
 
 		 394 aa  171  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0063  lipid-transfer protein  37.16 
 
 		 390 aa  170  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3858  hypothetical protein  37.6 
 
 		 390 aa  169  6e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.198117  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4309  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.33 
 
 		 378 aa  169  7e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4269  hypothetical protein  34.58 
 
 		 402 aa  168  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.340919  normal  0.522568 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1484  hypothetical protein  38.65 
 
 		 389 aa  167  4e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185234  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3310  hypothetical protein  34.04 
 
 		 393 aa  166  5e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.408434 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>