More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1902 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1902  hypothetical protein  100 
 
 
396 aa  815    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.986081  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0581  hypothetical protein  67.68 
 
 
395 aa  546  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0835832  normal  0.505436 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0906  hypothetical protein  50 
 
 
394 aa  404  1e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00747371  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4108  diterpenoid dioxygenase  46.29 
 
 
397 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.742638  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0900  hypothetical protein  43.37 
 
 
389 aa  317  2e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.049177  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4716  DitF protein  44.64 
 
 
453 aa  316  4e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3310  hypothetical protein  44.78 
 
 
393 aa  313  2.9999999999999996e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.408434 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2483  hypothetical protein  43.59 
 
 
548 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.207424 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3705  hypothetical protein  42.75 
 
 
550 aa  297  2e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724372  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3765  hypothetical protein  42.75 
 
 
550 aa  296  3e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3692  hypothetical protein  42.75 
 
 
550 aa  296  3e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4171  hypothetical protein  43.59 
 
 
548 aa  296  4e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4323  hypothetical protein  42.09 
 
 
541 aa  295  1e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.51495 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6832  DitF protein  43.83 
 
 
396 aa  288  2e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4492  hypothetical protein  36.27 
 
 
385 aa  219  7e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  38.23 
 
 
388 aa  215  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3512  thiolase  34.2 
 
 
390 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4021  putative nonspecific lipid-transfer protein  32.9 
 
 
378 aa  205  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2103  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  34.96 
 
 
384 aa  202  8e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.655505  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2581  thiolase  35.57 
 
 
385 aa  199  7.999999999999999e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8194  lipid-transfer protein  32.08 
 
 
390 aa  198  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2361  lipid-transfer protein  34.48 
 
 
394 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2093  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.55 
 
 
385 aa  196  6e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773617  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3651  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  32.08 
 
 
387 aa  196  8.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.48348  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51190  thiolase  35.14 
 
 
383 aa  192  9e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000113364 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0511  lipid-transfer protein  32.9 
 
 
389 aa  189  8e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5279  thiolase  34.63 
 
 
385 aa  188  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  36.72 
 
 
383 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13573  lipid-transfer protein  32 
 
 
386 aa  187  2e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000077821 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2141  lipid-transfer protein  31.55 
 
 
392 aa  187  3e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6845  thiolase  32.32 
 
 
383 aa  187  4e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0899  lipid-transfer protein  34.99 
 
 
389 aa  186  5e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2621  lipid-transfer protein  33.25 
 
 
395 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000528338  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4368  thiolase  34.11 
 
 
383 aa  184  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.739547  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4266  hypothetical protein  34.22 
 
 
381 aa  183  4.0000000000000006e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.804759  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8761  lipid-transfer protein  32.67 
 
 
385 aa  183  5.0000000000000004e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.134204 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0860  putative thiolase  34.78 
 
 
384 aa  180  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016172  normal  0.461503 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0887  lipid-transfer protein  32.17 
 
 
390 aa  178  1e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5253  lipid-transfer protein  30.63 
 
 
385 aa  178  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.509405 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2786  lipid-transfer protein  31.11 
 
 
394 aa  178  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1803  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.53 
 
 
389 aa  178  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.851643 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5057  lipid-transfer protein  31.31 
 
 
385 aa  176  6e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2016  lipid-transfer protein  31.12 
 
 
388 aa  175  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.314529  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3479  lipid-transfer protein  30.99 
 
 
391 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0147  thiolase  34.87 
 
 
402 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4632  acetyl-CoA acetyltransferase  32.07 
 
 
402 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0129  thiolase  34.87 
 
 
402 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5111  thiolase  33.59 
 
 
390 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000299159  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5776  thiolase  33.85 
 
 
393 aa  173  5.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0177  thiolase  34.54 
 
 
403 aa  172  6.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1513  lipid-transfer protein  30.56 
 
 
385 aa  171  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1835  lipid-transfer protein  31.97 
 
 
381 aa  171  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.722448  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0063  lipid-transfer protein  31.9 
 
 
390 aa  170  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4758  lipid-transfer protein  30.81 
 
 
385 aa  170  5e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5694  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4672  lipid-transfer protein  30.81 
 
 
385 aa  170  5e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.495157  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3858  hypothetical protein  31.49 
 
 
390 aa  169  8e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.198117  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0342  thiolase  32.66 
 
 
381 aa  166  5e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2277  thiolase  31.41 
 
 
383 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.573629 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2839  hypothetical protein  33.77 
 
 
388 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00983373  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2819  lipid-transfer protein  31.16 
 
 
389 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3321  lipid-transfer protein  32.26 
 
 
389 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0828492  hitchhiker  0.000989049 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2931  hypothetical protein  31.27 
 
 
379 aa  164  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0617  DitF protein  30 
 
 
400 aa  164  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206422  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  33.78 
 
 
390 aa  162  1e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.59 
 
 
382 aa  162  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4055  putative nonspecific lipid-transfer protein  30.25 
 
 
397 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0205444  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4152  acetyl-CoA acetyltransferase  32.83 
 
 
389 aa  161  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500938  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3805  acetyl-CoA acetyltransferase  32.81 
 
 
388 aa  161  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5302  putative nonspecific lipid-transfer protein  31.82 
 
 
388 aa  160  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.739228 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4413  acetyl-CoA acetyltransferase  33.25 
 
 
389 aa  159  6e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00900083  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3829  acetyl-CoA acetyltransferase  33.42 
 
 
388 aa  159  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.401188  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  30.71 
 
 
380 aa  159  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  28.89 
 
 
388 aa  157  3e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  31.96 
 
 
387 aa  157  3e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4625  thiolase  32.12 
 
 
390 aa  157  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1074  thiolase  32.9 
 
 
384 aa  152  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  30.63 
 
 
390 aa  152  8.999999999999999e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3607  acetyl-CoA acetyltransferase  31.94 
 
 
382 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.241671  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4565  acetyl-CoA acetyltransferase  33.94 
 
 
388 aa  152  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153409  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6629  thiolase  33.33 
 
 
381 aa  152  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1643  putative nonspecific lipid-transfer protein  32.02 
 
 
388 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4020  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.68 
 
 
392 aa  151  2e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.469452  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1670  putative nonspecific lipid-transfer protein  32.02 
 
 
388 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5006  acetyl-CoA acetyltransferase  31.85 
 
 
382 aa  151  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  0.11432 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4071  thiolase  32.12 
 
 
382 aa  151  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1694  putative nonspecific lipid-transfer protein  32.02 
 
 
388 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0636  putative nonspecific lipid-transfer protein  31.76 
 
 
388 aa  150  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.962067  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0554  putative nonspecific lipid-transfer protein  31.76 
 
 
388 aa  150  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0352  hypothetical protein  30.65 
 
 
386 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000477716  decreased coverage  0.0000013738 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1879  putative lipid transfer protein  29.38 
 
 
379 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0403443 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  29.95 
 
 
388 aa  148  1.0000000000000001e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5643  putative nonspecific lipid-transfer protein  31.5 
 
 
388 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3588  thiolase  29.2 
 
 
379 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3115  acetyl-CoA acetyltransferase  31.68 
 
 
382 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119662  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1309  acetyl-CoA acetyltransferase  31.5 
 
 
387 aa  147  5e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0879061 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2044  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  29.31 
 
 
360 aa  145  8.000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1978  hypothetical protein  28.68 
 
 
379 aa  145  9e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960116  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5499  acetyl-CoA acetyltransferase  30.46 
 
 
391 aa  145  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1757  acetyl-CoA acetyltransferase  31.71 
 
 
391 aa  144  3e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439431  normal  0.143058 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3540  hypothetical protein  30.08 
 
 
392 aa  144  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.101585 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>