More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1835 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1835  lipid-transfer protein  100 
 
 		 381 aa  781    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.722448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8761  lipid-transfer protein  57.78 
 
 		 385 aa  451  1e-125  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.134204 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2141  lipid-transfer protein  40.1 
 
 		 392 aa  301  2e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8194  lipid-transfer protein  43.64 
 
 		 390 aa  295  8e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13573  lipid-transfer protein  41.34 
 
 		 386 aa  293  4e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000077821 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0887  lipid-transfer protein  41.86 
 
 		 390 aa  287  2e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2786  lipid-transfer protein  39.95 
 
 		 394 aa  281  9e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3479  lipid-transfer protein  42.47 
 
 		 391 aa  278  1e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0511  lipid-transfer protein  43.01 
 
 		 389 aa  277  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0063  lipid-transfer protein  42.08 
 
 		 390 aa  274  2.0000000000000002e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3321  lipid-transfer protein  43.9 
 
 		 389 aa  273  3e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0828492  hitchhiker  0.000989049 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2621  lipid-transfer protein  41.3 
 
 		 395 aa  272  8.000000000000001e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000528338  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5057  lipid-transfer protein  40.93 
 
 		 385 aa  271  1e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4758  lipid-transfer protein  40.67 
 
 		 385 aa  268  1e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4672  lipid-transfer protein  40.67 
 
 		 385 aa  268  1e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.495157  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5253  lipid-transfer protein  40.93 
 
 		 385 aa  268  2e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509405 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2819  lipid-transfer protein  41.86 
 
 		 389 aa  263  4e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3858  hypothetical protein  40.89 
 
 		 390 aa  263  4e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.198117  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2016  lipid-transfer protein  40.53 
 
 		 388 aa  260  2e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.314529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1513  lipid-transfer protein  39.64 
 
 		 385 aa  258  1e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0899  lipid-transfer protein  39.33 
 
 		 389 aa  249  6e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4055  putative nonspecific lipid-transfer protein  40.05 
 
 		 397 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0205444  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3540  hypothetical protein  37.67 
 
 		 392 aa  216  7e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3651  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  39.9 
 
 		 387 aa  209  8e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.48348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5553  hypothetical protein  35.43 
 
 		 383 aa  206  6e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2361  lipid-transfer protein  36.15 
 
 		 394 aa  198  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2093  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  37.2 
 
 		 385 aa  196  6e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2103  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  36.94 
 
 		 384 aa  195  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.655505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1971  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  34.05 
 
 		 387 aa  192  6e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5454  putative nonspecific lipid-transfer protein  38.06 
 
 		 388 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.839799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5851  putative nonspecific lipid-transfer protein  38.06 
 
 		 388 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0314395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4492  hypothetical protein  35.22 
 
 		 385 aa  190  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5302  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.43 
 
 		 388 aa  189  7e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.739228 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0352  hypothetical protein  35.26 
 
 		 386 aa  188  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000477716  decreased coverage  0.0000013738 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3512  thiolase  36.03 
 
 		 390 aa  187  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6832  DitF protein  34.41 
 
 		 396 aa  185  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  36.07 
 
 		 388 aa  182  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1670  putative nonspecific lipid-transfer protein  36.7 
 
 		 388 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1643  putative nonspecific lipid-transfer protein  36.7 
 
 		 388 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1694  putative nonspecific lipid-transfer protein  36.7 
 
 		 388 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0554  putative nonspecific lipid-transfer protein  37.22 
 
 		 388 aa  181  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5643  putative nonspecific lipid-transfer protein  36.94 
 
 		 388 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0636  putative nonspecific lipid-transfer protein  37.22 
 
 		 388 aa  181  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.962067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1026  hypothetical protein  31.51 
 
 		 396 aa  180  2.9999999999999997e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.651118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2581  thiolase  35.97 
 
 		 385 aa  179  7e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4108  diterpenoid dioxygenase  33.42 
 
 		 397 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.742638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1879  putative lipid transfer protein  31.54 
 
 		 379 aa  176  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0403443 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0891  thiolase  33.08 
 
 		 405 aa  176  7e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.849216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4021  putative nonspecific lipid-transfer protein  32.7 
 
 		 378 aa  176  8e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4716  DitF protein  35.79 
 
 		 453 aa  175  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1902  hypothetical protein  32.79 
 
 		 396 aa  174  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.986081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2044  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  35.87 
 
 		 360 aa  172  5.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0581  hypothetical protein  32.44 
 
 		 395 aa  172  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0835832  normal  0.505436 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2839  hypothetical protein  33.61 
 
 		 388 aa  172  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00983373  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4266  hypothetical protein  34.52 
 
 		 381 aa  171  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.804759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2367  hypothetical protein  33.06 
 
 		 393 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.351877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3588  thiolase  31.3 
 
 		 379 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6845  thiolase  35.11 
 
 		 383 aa  171  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3310  hypothetical protein  36.1 
 
 		 393 aa  170  4e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.408434 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0529  putative nonspecific lipid-transfer protein  37.22 
 
 		 388 aa  170  4e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.384509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1803  putative nonspecific lipid-transfer protein  31.39 
 
 		 389 aa  169  7e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.851643 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0900  hypothetical protein  34.9 
 
 		 389 aa  169  9e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.049177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6629  thiolase  37.98 
 
 		 381 aa  168  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1978  hypothetical protein  30.46 
 
 		 379 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960116  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2931  hypothetical protein  32.44 
 
 		 379 aa  166  9e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5279  thiolase  34.5 
 
 		 385 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4625  thiolase  34.41 
 
 		 390 aa  163  4.0000000000000004e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5255  thiolase  33.77 
 
 		 389 aa  162  8.000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2277  thiolase  33.16 
 
 		 383 aa  162  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.573629 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51190  thiolase  34.65 
 
 		 383 aa  161  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113364 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5776  thiolase  40.94 
 
 		 393 aa  159  7e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0147  thiolase  36.01 
 
 		 402 aa  158  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0342  thiolase  35.56 
 
 		 381 aa  158  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4632  acetyl-CoA acetyltransferase  32.12 
 
 		 402 aa  157  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2483  hypothetical protein  33.25 
 
 		 548 aa  157  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.207424 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0177  thiolase  36.52 
 
 		 403 aa  157  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4171  hypothetical protein  34.42 
 
 		 548 aa  157  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0129  thiolase  35.29 
 
 		 402 aa  157  3e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4071  thiolase  33.97 
 
 		 382 aa  157  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3692  hypothetical protein  34.92 
 
 		 550 aa  157  4e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3765  hypothetical protein  34.92 
 
 		 550 aa  157  4e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3705  hypothetical protein  34.92 
 
 		 550 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.88 
 
 		 382 aa  156  6e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  33.15 
 
 		 383 aa  155  7e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  29.54 
 
 		 380 aa  155  9e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4368  thiolase  33.62 
 
 		 383 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.739547  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1686  Acetyl-CoA acetyltransferase-like  31.47 
 
 		 379 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0569144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2935  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  32.7 
 
 		 383 aa  154  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.220087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4311  hypothetical protein  30.17 
 
 		 389 aa  153  5e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5111  thiolase  36.79 
 
 		 390 aa  149  7e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000299159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0617  DitF protein  31 
 
 		 400 aa  149  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1484  hypothetical protein  33.24 
 
 		 389 aa  145  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185234  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4413  acetyl-CoA acetyltransferase  33.6 
 
 		 389 aa  145  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00900083  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5499  acetyl-CoA acetyltransferase  32.61 
 
 		 391 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3401  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  32.79 
 
 		 380 aa  142  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0771846 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3829  acetyl-CoA acetyltransferase  33.33 
 
 		 388 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.401188  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0860  putative thiolase  32.87 
 
 		 384 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016172  normal  0.461503 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5006  acetyl-CoA acetyltransferase  30.3 
 
 		 382 aa  139  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  0.11432 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3805  acetyl-CoA acetyltransferase  31.72 
 
 		 388 aa  138  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4323  hypothetical protein  30.17 
 
 		 541 aa  139  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.51495 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>