More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4492 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4492  hypothetical protein  100 
 
 		 385 aa  778    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2483  hypothetical protein  40.64 
 
 		 548 aa  239  5.999999999999999e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.207424 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3705  hypothetical protein  40 
 
 		 550 aa  236  4e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3765  hypothetical protein  40 
 
 		 550 aa  236  6e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3692  hypothetical protein  40 
 
 		 550 aa  236  6e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4171  hypothetical protein  41.18 
 
 		 548 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4323  hypothetical protein  38.05 
 
 		 541 aa  224  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.51495 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1902  hypothetical protein  36.27 
 
 		 396 aa  223  6e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.986081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4716  DitF protein  36.84 
 
 		 453 aa  220  3e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0900  hypothetical protein  38.27 
 
 		 389 aa  219  7e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.049177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3651  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  38.67 
 
 		 387 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.48348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3310  hypothetical protein  36.81 
 
 		 393 aa  215  9e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.408434 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2141  lipid-transfer protein  34.09 
 
 		 392 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13573  lipid-transfer protein  36.25 
 
 		 386 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000077821 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4108  diterpenoid dioxygenase  35.13 
 
 		 397 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.742638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5253  lipid-transfer protein  36.53 
 
 		 385 aa  211  3e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509405 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0887  lipid-transfer protein  34.78 
 
 		 390 aa  209  8e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1513  lipid-transfer protein  36.27 
 
 		 385 aa  209  9e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0581  hypothetical protein  35.85 
 
 		 395 aa  208  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0835832  normal  0.505436 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2103  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  34.29 
 
 		 384 aa  207  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.655505  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3858  hypothetical protein  36.57 
 
 		 390 aa  207  3e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.198117  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5057  lipid-transfer protein  35.75 
 
 		 385 aa  205  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0511  lipid-transfer protein  33.51 
 
 		 389 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8194  lipid-transfer protein  36.39 
 
 		 390 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0906  hypothetical protein  34.02 
 
 		 394 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00747371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4758  lipid-transfer protein  35.75 
 
 		 385 aa  200  3e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4672  lipid-transfer protein  35.75 
 
 		 385 aa  200  3e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.495157  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6832  DitF protein  37.92 
 
 		 396 aa  199  6e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2361  lipid-transfer protein  38.6 
 
 		 394 aa  199  7.999999999999999e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2093  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  37.2 
 
 		 385 aa  197  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4021  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.92 
 
 		 378 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0063  lipid-transfer protein  34.36 
 
 		 390 aa  194  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4055  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.51 
 
 		 397 aa  192  6e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0205444  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1835  lipid-transfer protein  36.81 
 
 		 381 aa  192  6e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.722448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8761  lipid-transfer protein  33.85 
 
 		 385 aa  192  7e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.134204 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2016  lipid-transfer protein  33.67 
 
 		 388 aa  192  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.314529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3512  thiolase  35.47 
 
 		 390 aa  189  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4266  hypothetical protein  36.27 
 
 		 381 aa  186  6e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.804759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2786  lipid-transfer protein  32.91 
 
 		 394 aa  186  6e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3321  lipid-transfer protein  34.36 
 
 		 389 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0828492  hitchhiker  0.000989049 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2839  hypothetical protein  34.84 
 
 		 388 aa  182  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00983373  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2581  thiolase  37.02 
 
 		 385 aa  180  2.9999999999999997e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0899  lipid-transfer protein  36 
 
 		 389 aa  180  4e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3479  lipid-transfer protein  31.81 
 
 		 391 aa  177  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2621  lipid-transfer protein  34.54 
 
 		 395 aa  176  6e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000528338  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5279  thiolase  36.67 
 
 		 385 aa  175  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0617  DitF protein  35.88 
 
 		 400 aa  175  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0352  hypothetical protein  34.57 
 
 		 386 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000477716  decreased coverage  0.0000013738 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51190  thiolase  35.23 
 
 		 383 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113364 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4368  thiolase  35.03 
 
 		 383 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.739547  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  33.76 
 
 		 383 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4632  acetyl-CoA acetyltransferase  32.81 
 
 		 402 aa  168  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  35.05 
 
 		 388 aa  165  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5776  thiolase  43.84 
 
 		 393 aa  164  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1803  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.11 
 
 		 389 aa  164  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.851643 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6845  thiolase  33.24 
 
 		 383 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5255  thiolase  33.08 
 
 		 389 aa  160  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5302  putative nonspecific lipid-transfer protein  36.34 
 
 		 388 aa  160  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.739228 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0177  thiolase  35.4 
 
 		 403 aa  159  9e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4625  thiolase  33.51 
 
 		 390 aa  157  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2819  lipid-transfer protein  34.37 
 
 		 389 aa  156  5.0000000000000005e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1074  thiolase  32.44 
 
 		 384 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0342  thiolase  33.63 
 
 		 381 aa  155  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0891  thiolase  32.47 
 
 		 405 aa  155  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.849216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0147  thiolase  34.91 
 
 		 402 aa  153  4e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5111  thiolase  35.56 
 
 		 390 aa  152  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000299159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0129  thiolase  34.91 
 
 		 402 aa  152  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1971  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  32.98 
 
 		 387 aa  151  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6629  thiolase  35.22 
 
 		 381 aa  151  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1484  hypothetical protein  34.06 
 
 		 389 aa  150  3e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185234  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4311  hypothetical protein  34.04 
 
 		 389 aa  146  8.000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  31.17 
 
 		 380 aa  146  8.000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4069  putative thiolase  33.7 
 
 		 372 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.655327  normal  0.671191 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2044  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  30.29 
 
 		 360 aa  144  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5553  hypothetical protein  30.16 
 
 		 383 aa  144  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5454  putative nonspecific lipid-transfer protein  33.51 
 
 		 388 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.839799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5851  putative nonspecific lipid-transfer protein  33.51 
 
 		 388 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0314395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.57 
 
 		 382 aa  141  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1026  hypothetical protein  31.12 
 
 		 396 aa  139  8.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.651118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5643  putative nonspecific lipid-transfer protein  33.51 
 
 		 388 aa  139  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0636  putative nonspecific lipid-transfer protein  33.51 
 
 		 388 aa  139  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.962067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  29.08 
 
 		 388 aa  139  1e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0554  putative nonspecific lipid-transfer protein  33.51 
 
 		 388 aa  139  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2277  thiolase  31.3 
 
 		 383 aa  139  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.573629 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4071  thiolase  40.36 
 
 		 382 aa  139  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3540  hypothetical protein  30.85 
 
 		 392 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0860  putative thiolase  32.69 
 
 		 384 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016172  normal  0.461503 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1643  putative nonspecific lipid-transfer protein  33.25 
 
 		 388 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1670  putative nonspecific lipid-transfer protein  33.25 
 
 		 388 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1694  putative nonspecific lipid-transfer protein  33.25 
 
 		 388 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  28.86 
 
 		 388 aa  134  3e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0435  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  28.34 
 
 		 387 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0844  thiolase  33.68 
 
 		 384 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0529  putative nonspecific lipid-transfer protein  33.51 
 
 		 388 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.384509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  28.03 
 
 		 390 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  29.2 
 
 		 387 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2931  hypothetical protein  30.35 
 
 		 379 aa  127  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  29.31 
 
 		 387 aa  127  3e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  30.56 
 
 		 386 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  29.05 
 
 		 388 aa  124  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>