More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5255 on replicon NC_007950
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007950  Bpro_5255  thiolase  100 
 
 
389 aa  792    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3512  thiolase  52.06 
 
 
390 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5111  thiolase  55.4 
 
 
390 aa  362  5.0000000000000005e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000299159  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5279  thiolase  51.95 
 
 
385 aa  362  8e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5776  thiolase  53.26 
 
 
393 aa  350  3e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4368  thiolase  51.09 
 
 
383 aa  348  1e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.739547  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51190  thiolase  50.96 
 
 
383 aa  348  1e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000113364 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0844  thiolase  55.01 
 
 
384 aa  341  1e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6629  thiolase  53.15 
 
 
381 aa  340  2e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0147  thiolase  52.12 
 
 
402 aa  338  8e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  47.79 
 
 
382 aa  337  1.9999999999999998e-91  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0129  thiolase  52.12 
 
 
402 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0177  thiolase  51.84 
 
 
403 aa  334  2e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2581  thiolase  50 
 
 
385 aa  331  1e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4625  thiolase  49.05 
 
 
390 aa  331  2e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6845  thiolase  49.32 
 
 
383 aa  331  2e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0342  thiolase  49.57 
 
 
381 aa  323  5e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1074  thiolase  50.26 
 
 
384 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4071  thiolase  50.13 
 
 
382 aa  311  9e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  42.56 
 
 
380 aa  309  4e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  47.64 
 
 
383 aa  306  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2277  thiolase  49.03 
 
 
383 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.573629 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1978  hypothetical protein  42.82 
 
 
379 aa  295  8e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960116  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2935  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  43.91 
 
 
383 aa  293  5e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.220087  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2931  hypothetical protein  41.33 
 
 
379 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3588  thiolase  42.31 
 
 
379 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  43.7 
 
 
388 aa  287  2e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1879  putative lipid transfer protein  41.54 
 
 
379 aa  282  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0403443 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4413  acetyl-CoA acetyltransferase  46.06 
 
 
389 aa  280  3e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00900083  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3401  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  44.41 
 
 
380 aa  280  4e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0771846 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1686  Acetyl-CoA acetyltransferase-like  41.79 
 
 
379 aa  275  8e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0569144  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3829  acetyl-CoA acetyltransferase  45.04 
 
 
388 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.401188  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4152  acetyl-CoA acetyltransferase  45.55 
 
 
389 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500938  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3805  acetyl-CoA acetyltransferase  44.25 
 
 
388 aa  273  5.000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1757  acetyl-CoA acetyltransferase  44.47 
 
 
391 aa  273  5.000000000000001e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439431  normal  0.143058 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5499  acetyl-CoA acetyltransferase  45.06 
 
 
391 aa  272  6e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5006  acetyl-CoA acetyltransferase  43.73 
 
 
382 aa  268  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  0.11432 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3607  acetyl-CoA acetyltransferase  42.93 
 
 
382 aa  265  8.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.241671  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4787  acetyl-CoA acetyltransferase  47.04 
 
 
387 aa  263  3e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0607631  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3115  acetyl-CoA acetyltransferase  44.57 
 
 
382 aa  263  4e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119662  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7411  acetyl-CoA acetyltransferase  44.85 
 
 
383 aa  261  1e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1502  acetyl-CoA acetyltransferase  42.89 
 
 
390 aa  258  8e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4565  acetyl-CoA acetyltransferase  44.36 
 
 
388 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153409  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2350  acetyl-CoA acetyltransferase  43.56 
 
 
382 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.731467  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0860  putative thiolase  40.91 
 
 
384 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016172  normal  0.461503 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2663  acetyl-CoA acetyltransferase  43.15 
 
 
385 aa  244  1.9999999999999999e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5095  acetyl-CoA acetyltransferase  44.08 
 
 
395 aa  244  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.926475 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2839  hypothetical protein  41 
 
 
388 aa  229  7e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00983373  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4266  hypothetical protein  40.28 
 
 
381 aa  222  9e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.804759  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0031  hypothetical protein  36.7 
 
 
402 aa  210  4e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.761011  normal  0.262129 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0041  hypothetical protein  36.79 
 
 
402 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0050  hypothetical protein  36.79 
 
 
402 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0851197  normal  0.0510911 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1484  hypothetical protein  40.29 
 
 
389 aa  206  5e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185234  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3567  putative thiolase  38.57 
 
 
378 aa  199  7e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0352  hypothetical protein  36.06 
 
 
386 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000477716  decreased coverage  0.0000013738 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4311  hypothetical protein  36.97 
 
 
389 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4180  putative acetyl-CoA C-acetyltransferase  33.76 
 
 
394 aa  196  7e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.785914  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1803  putative nonspecific lipid-transfer protein  37.99 
 
 
389 aa  191  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.851643 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  34.18 
 
 
390 aa  190  5e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5302  putative nonspecific lipid-transfer protein  36.59 
 
 
388 aa  186  7e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.739228 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3314  thiolase  36.97 
 
 
404 aa  186  8e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4269  hypothetical protein  35.78 
 
 
402 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.340919  normal  0.522568 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  34.34 
 
 
390 aa  184  3e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8761  lipid-transfer protein  35.53 
 
 
385 aa  182  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.134204 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2786  lipid-transfer protein  36.46 
 
 
394 aa  181  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2103  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  36.29 
 
 
384 aa  180  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.655505  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3651  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  36.77 
 
 
387 aa  179  7e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.48348  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2151  nonspecific lipid-transfer protein  32.5 
 
 
403 aa  178  1e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2361  lipid-transfer protein  34.56 
 
 
394 aa  177  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0692288 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0316  acetyl-CoA C-acetyltransferase (acetoacetyl-CoA thiolase) (AcaB-6)  32.96 
 
 
380 aa  177  3e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2105  thiolase  36.36 
 
 
404 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0715913  normal  0.0186682 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2744  putative thiolase/acetyl-CoA acetyltransferase, PaaJ-like  33.42 
 
 
406 aa  177  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0906041 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0859  thiolase  32.28 
 
 
389 aa  176  7e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.823302  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  33.05 
 
 
388 aa  176  8e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6481  thiolase  34.77 
 
 
388 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0511  lipid-transfer protein  34.17 
 
 
389 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5282  hypothetical protein  33.51 
 
 
390 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2141  lipid-transfer protein  34.44 
 
 
392 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2093  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  38.86 
 
 
385 aa  172  5.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773617  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  39.2 
 
 
387 aa  171  1e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  33.25 
 
 
386 aa  171  2e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0581  hypothetical protein  33.15 
 
 
395 aa  166  8e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0835832  normal  0.505436 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3952  putative thiolase  35.96 
 
 
378 aa  166  9e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.130005  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0855  acetyl-CoA C-acetyltransferase (acetoacetyl-CoA thiolase) (AcaB-10)  33.06 
 
 
385 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0722065  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2377  hypothetical protein  35.47 
 
 
402 aa  164  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.494222  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0063  lipid-transfer protein  35.03 
 
 
390 aa  164  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1008  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  32.71 
 
 
385 aa  164  4.0000000000000004e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.011821 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3322  thiolase  35.16 
 
 
383 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00152041  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3972  thiolase  35.16 
 
 
383 aa  163  5.0000000000000005e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.330404 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1496  hypothetical protein  30.23 
 
 
390 aa  163  5.0000000000000005e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  32.02 
 
 
387 aa  162  9e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8194  lipid-transfer protein  33.96 
 
 
390 aa  160  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  30.33 
 
 
388 aa  160  4e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3254  putative thiolase/acetyl-CoA acetyltransferase  33.05 
 
 
394 aa  160  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146846  normal  0.511595 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1335  hypothetical protein  30.7 
 
 
391 aa  159  1e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  32.5 
 
 
388 aa  158  1e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4716  DitF protein  35.95 
 
 
453 aa  158  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6832  DitF protein  35.49 
 
 
396 aa  158  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0899  lipid-transfer protein  34.88 
 
 
389 aa  157  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3705  hypothetical protein  35.34 
 
 
550 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724372  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>