More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0900 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0900  hypothetical protein  100 
 
 		 389 aa  793    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.049177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4108  diterpenoid dioxygenase  50.26 
 
 		 397 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.742638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0581  hypothetical protein  46.17 
 
 		 395 aa  325  7e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0835832  normal  0.505436 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1902  hypothetical protein  43.37 
 
 		 396 aa  324  1e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.986081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0906  hypothetical protein  42.01 
 
 		 394 aa  310  2e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00747371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3705  hypothetical protein  47.04 
 
 		 550 aa  301  1e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3765  hypothetical protein  46.79 
 
 		 550 aa  301  2e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3692  hypothetical protein  46.79 
 
 		 550 aa  301  2e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2483  hypothetical protein  46.61 
 
 		 548 aa  297  2e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.207424 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6832  DitF protein  45.19 
 
 		 396 aa  292  7e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4323  hypothetical protein  42.38 
 
 		 541 aa  287  2e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.51495 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4171  hypothetical protein  45.83 
 
 		 548 aa  287  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3310  hypothetical protein  42.6 
 
 		 393 aa  275  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.408434 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4716  DitF protein  42.31 
 
 		 453 aa  272  7e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4492  hypothetical protein  38.27 
 
 		 385 aa  225  9e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3321  lipid-transfer protein  38.96 
 
 		 389 aa  206  4e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0828492  hitchhiker  0.000989049 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3512  thiolase  36.53 
 
 		 390 aa  197  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4021  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.1 
 
 		 378 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8194  lipid-transfer protein  35.26 
 
 		 390 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2141  lipid-transfer protein  32.83 
 
 		 392 aa  194  3e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3651  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  35.5 
 
 		 387 aa  193  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.48348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8761  lipid-transfer protein  34.76 
 
 		 385 aa  192  6e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.134204 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5776  thiolase  37.43 
 
 		 393 aa  188  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2581  thiolase  34.72 
 
 		 385 aa  186  5e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13573  lipid-transfer protein  35.25 
 
 		 386 aa  185  9e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000077821 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0063  lipid-transfer protein  33.5 
 
 		 390 aa  182  6e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2786  lipid-transfer protein  35.91 
 
 		 394 aa  182  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2103  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  35.55 
 
 		 384 aa  181  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.655505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6629  thiolase  37.05 
 
 		 381 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1835  lipid-transfer protein  34.63 
 
 		 381 aa  180  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.722448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4266  hypothetical protein  35.05 
 
 		 381 aa  179  7e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.804759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0887  lipid-transfer protein  32.49 
 
 		 390 aa  178  1e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1513  lipid-transfer protein  32.57 
 
 		 385 aa  178  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2839  hypothetical protein  35.53 
 
 		 388 aa  177  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00983373  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4071  thiolase  35.53 
 
 		 382 aa  176  5e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5111  thiolase  35.39 
 
 		 390 aa  175  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000299159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0511  lipid-transfer protein  33.6 
 
 		 389 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2093  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.05 
 
 		 385 aa  173  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5253  lipid-transfer protein  32.82 
 
 		 385 aa  173  5e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509405 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5057  lipid-transfer protein  33.15 
 
 		 385 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6845  thiolase  34.14 
 
 		 383 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4632  acetyl-CoA acetyltransferase  33.17 
 
 		 402 aa  171  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3858  hypothetical protein  33.25 
 
 		 390 aa  171  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.198117  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5279  thiolase  32.48 
 
 		 385 aa  171  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0177  thiolase  35.16 
 
 		 403 aa  169  7e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0860  putative thiolase  33.67 
 
 		 384 aa  168  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016172  normal  0.461503 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  36.01 
 
 		 388 aa  169  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4758  lipid-transfer protein  33.42 
 
 		 385 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4672  lipid-transfer protein  33.42 
 
 		 385 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.495157  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0147  thiolase  34.81 
 
 		 402 aa  168  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0129  thiolase  34.55 
 
 		 402 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0342  thiolase  35.42 
 
 		 381 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5302  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.51 
 
 		 388 aa  167  4e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.739228 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2621  lipid-transfer protein  33.93 
 
 		 395 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000528338  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3479  lipid-transfer protein  34.29 
 
 		 391 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2044  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  32.48 
 
 		 360 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2277  thiolase  34.34 
 
 		 383 aa  157  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.573629 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4625  thiolase  33.16 
 
 		 390 aa  157  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2819  lipid-transfer protein  33.59 
 
 		 389 aa  156  5.0000000000000005e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1484  hypothetical protein  35.28 
 
 		 389 aa  155  8e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185234  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2016  lipid-transfer protein  31.46 
 
 		 388 aa  155  8e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.314529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0617  DitF protein  31.32 
 
 		 400 aa  155  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1803  putative nonspecific lipid-transfer protein  32.15 
 
 		 389 aa  154  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.851643 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  34.94 
 
 		 383 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1074  thiolase  34.03 
 
 		 384 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5454  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.29 
 
 		 388 aa  152  8e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.839799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5851  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.29 
 
 		 388 aa  152  8e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0314395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51190  thiolase  31.78 
 
 		 383 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113364 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0899  lipid-transfer protein  32.65 
 
 		 389 aa  150  4e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4368  thiolase  31.95 
 
 		 383 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.739547  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5255  thiolase  32.39 
 
 		 389 aa  148  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  32.88 
 
 		 380 aa  147  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0352  hypothetical protein  33.15 
 
 		 386 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000477716  decreased coverage  0.0000013738 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1643  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.29 
 
 		 388 aa  146  5e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0636  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.03 
 
 		 388 aa  146  5e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.962067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0554  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.03 
 
 		 388 aa  146  5e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1670  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.29 
 
 		 388 aa  146  5e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1694  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.29 
 
 		 388 aa  146  5e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1335  hypothetical protein  34.05 
 
 		 391 aa  146  6e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5643  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.49 
 
 		 388 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2931  hypothetical protein  31.49 
 
 		 379 aa  144  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4069  putative thiolase  35.11 
 
 		 372 aa  142  7e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.655327  normal  0.671191 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3567  putative thiolase  31.87 
 
 		 378 aa  142  9e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1686  Acetyl-CoA acetyltransferase-like  31.82 
 
 		 379 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0569144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4311  hypothetical protein  32.2 
 
 		 389 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0859  thiolase  29.89 
 
 		 389 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.823302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3401  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  35.13 
 
 		 380 aa  139  8.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0771846 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2935  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  31.01 
 
 		 383 aa  139  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.220087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2361  lipid-transfer protein  34 
 
 		 394 aa  137  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4055  putative nonspecific lipid-transfer protein  30.41 
 
 		 397 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0205444  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3829  acetyl-CoA acetyltransferase  31.77 
 
 		 388 aa  137  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.401188  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1496  hypothetical protein  29.92 
 
 		 390 aa  137  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3254  putative thiolase/acetyl-CoA acetyltransferase  31.82 
 
 		 394 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146846  normal  0.511595 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4413  acetyl-CoA acetyltransferase  31.77 
 
 		 389 aa  136  7.000000000000001e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00900083  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5499  acetyl-CoA acetyltransferase  31.25 
 
 		 391 aa  135  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0529  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.76 
 
 		 388 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.384509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3588  thiolase  30.11 
 
 		 379 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1978  hypothetical protein  29.83 
 
 		 379 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960116  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4152  acetyl-CoA acetyltransferase  30.99 
 
 		 389 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500938  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3805  acetyl-CoA acetyltransferase  31.25 
 
 		 388 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>