More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2839 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2839  hypothetical protein  100 
 
 
388 aa  786    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00983373  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1484  hypothetical protein  66.4 
 
 
389 aa  491  9.999999999999999e-139  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185234  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4311  hypothetical protein  58.05 
 
 
389 aa  429  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4266  hypothetical protein  42.6 
 
 
381 aa  264  2e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.804759  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  41.69 
 
 
382 aa  251  2e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4069  putative thiolase  42.82 
 
 
372 aa  250  3e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.655327  normal  0.671191 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5279  thiolase  41.16 
 
 
385 aa  247  3e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3512  thiolase  39.58 
 
 
390 aa  242  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4625  thiolase  39.22 
 
 
390 aa  237  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2093  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  44.59 
 
 
385 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773617  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  39.48 
 
 
388 aa  233  4.0000000000000004e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51190  thiolase  39.15 
 
 
383 aa  233  6e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000113364 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4368  thiolase  39.68 
 
 
383 aa  232  9e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.739547  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5111  thiolase  41.41 
 
 
390 aa  231  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000299159  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  42.08 
 
 
383 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0342  thiolase  40.97 
 
 
381 aa  230  3e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5255  thiolase  41 
 
 
389 aa  229  7e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2141  lipid-transfer protein  37.53 
 
 
392 aa  224  2e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2786  lipid-transfer protein  40.11 
 
 
394 aa  220  3e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2581  thiolase  38.38 
 
 
385 aa  217  2e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2277  thiolase  37.98 
 
 
383 aa  216  4e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.573629 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0887  lipid-transfer protein  40.68 
 
 
390 aa  216  5e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0177  thiolase  40.47 
 
 
403 aa  216  5e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5776  thiolase  39.64 
 
 
393 aa  215  9e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0147  thiolase  48.73 
 
 
402 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6845  thiolase  37.53 
 
 
383 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3479  lipid-transfer protein  38.89 
 
 
391 aa  212  7e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0129  thiolase  48.73 
 
 
402 aa  212  7e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0352  hypothetical protein  38.95 
 
 
386 aa  209  5e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000477716  decreased coverage  0.0000013738 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0511  lipid-transfer protein  37.43 
 
 
389 aa  209  7e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8194  lipid-transfer protein  40 
 
 
390 aa  209  7e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13573  lipid-transfer protein  38.42 
 
 
386 aa  207  2e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000077821 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3858  hypothetical protein  38.79 
 
 
390 aa  207  3e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.198117  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3651  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  37.6 
 
 
387 aa  206  4e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.48348  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0860  putative thiolase  38.87 
 
 
384 aa  206  7e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016172  normal  0.461503 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4055  putative nonspecific lipid-transfer protein  38.18 
 
 
397 aa  203  4e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0205444  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5302  putative nonspecific lipid-transfer protein  38.34 
 
 
388 aa  203  4e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.739228 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  35.66 
 
 
380 aa  203  5e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0899  lipid-transfer protein  39.78 
 
 
389 aa  202  6e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6629  thiolase  38.82 
 
 
381 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1074  thiolase  36.78 
 
 
384 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4071  thiolase  37.94 
 
 
382 aa  200  3e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0063  lipid-transfer protein  39.2 
 
 
390 aa  199  5e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1513  lipid-transfer protein  37.47 
 
 
385 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5253  lipid-transfer protein  37.47 
 
 
385 aa  196  6e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.509405 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5006  acetyl-CoA acetyltransferase  38.02 
 
 
382 aa  196  7e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  0.11432 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2361  lipid-transfer protein  37.96 
 
 
394 aa  196  8.000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5057  lipid-transfer protein  35.84 
 
 
385 aa  193  4e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2016  lipid-transfer protein  37.37 
 
 
388 aa  193  4e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.314529  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2931  hypothetical protein  33.42 
 
 
379 aa  193  6e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4758  lipid-transfer protein  36.1 
 
 
385 aa  192  7e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5694  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4672  lipid-transfer protein  36.1 
 
 
385 aa  192  7e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.495157  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5499  acetyl-CoA acetyltransferase  37.5 
 
 
391 aa  192  9e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1757  acetyl-CoA acetyltransferase  36.81 
 
 
391 aa  191  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439431  normal  0.143058 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3829  acetyl-CoA acetyltransferase  37.84 
 
 
388 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.401188  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1803  putative nonspecific lipid-transfer protein  37.82 
 
 
389 aa  189  5.999999999999999e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.851643 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2621  lipid-transfer protein  37.72 
 
 
395 aa  189  7e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000528338  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3321  lipid-transfer protein  37.17 
 
 
389 aa  188  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0828492  hitchhiker  0.000989049 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3607  acetyl-CoA acetyltransferase  37.47 
 
 
382 aa  189  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.241671  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8761  lipid-transfer protein  35.11 
 
 
385 aa  188  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.134204 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3805  acetyl-CoA acetyltransferase  37.6 
 
 
388 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2483  hypothetical protein  38.32 
 
 
548 aa  187  3e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.207424 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4413  acetyl-CoA acetyltransferase  38.42 
 
 
389 aa  187  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00900083  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7411  acetyl-CoA acetyltransferase  38.1 
 
 
383 aa  187  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4021  putative nonspecific lipid-transfer protein  33.51 
 
 
378 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2103  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  38.67 
 
 
384 aa  187  4e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.655505  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2819  lipid-transfer protein  36.94 
 
 
389 aa  186  6e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4152  acetyl-CoA acetyltransferase  37.26 
 
 
389 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500938  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3115  acetyl-CoA acetyltransferase  37.19 
 
 
382 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119662  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2350  acetyl-CoA acetyltransferase  38.02 
 
 
382 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.731467  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1978  hypothetical protein  32.11 
 
 
379 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960116  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1502  acetyl-CoA acetyltransferase  36.65 
 
 
390 aa  183  4.0000000000000006e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  34.3 
 
 
390 aa  182  7e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0844  thiolase  36.98 
 
 
384 aa  182  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  33.61 
 
 
390 aa  179  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4108  diterpenoid dioxygenase  35.77 
 
 
397 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.742638  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4787  acetyl-CoA acetyltransferase  39.67 
 
 
387 aa  177  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0607631  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1879  putative lipid transfer protein  31.59 
 
 
379 aa  177  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0403443 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4492  hypothetical protein  35.9 
 
 
385 aa  176  8e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4565  acetyl-CoA acetyltransferase  38.42 
 
 
388 aa  176  8e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153409  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3588  thiolase  31.59 
 
 
379 aa  175  9e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4171  hypothetical protein  38.06 
 
 
548 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2663  acetyl-CoA acetyltransferase  37.93 
 
 
385 aa  175  9.999999999999999e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3705  hypothetical protein  38.38 
 
 
550 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724372  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1835  lipid-transfer protein  33.61 
 
 
381 aa  171  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.722448  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5454  putative nonspecific lipid-transfer protein  37.25 
 
 
388 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.839799  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  33.86 
 
 
387 aa  171  2e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5851  putative nonspecific lipid-transfer protein  37.25 
 
 
388 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0314395  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3765  hypothetical protein  38.32 
 
 
550 aa  170  4e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2935  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  33.42 
 
 
383 aa  170  4e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.220087  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3692  hypothetical protein  38.32 
 
 
550 aa  170  4e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1686  Acetyl-CoA acetyltransferase-like  31.58 
 
 
379 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0569144  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3310  hypothetical protein  35.54 
 
 
393 aa  167  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.408434 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0581  hypothetical protein  33.51 
 
 
395 aa  166  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0835832  normal  0.505436 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1902  hypothetical protein  33.77 
 
 
396 aa  164  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.986081  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0900  hypothetical protein  35.53 
 
 
389 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.049177  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  33.42 
 
 
386 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3401  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  39.33 
 
 
380 aa  164  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0771846 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4716  DitF protein  36.22 
 
 
453 aa  163  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  32.6 
 
 
387 aa  162  1e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>