More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4055 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_4055  putative nonspecific lipid-transfer protein  100 
 
 
397 aa  807    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0205444  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0891  thiolase  63.38 
 
 
405 aa  499  1e-140  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.849216  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2361  lipid-transfer protein  46.62 
 
 
394 aa  300  2e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13573  lipid-transfer protein  42.36 
 
 
386 aa  278  1e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000077821 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3858  hypothetical protein  41.28 
 
 
390 aa  265  1e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.198117  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5057  lipid-transfer protein  42.32 
 
 
385 aa  263  4e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4758  lipid-transfer protein  42.07 
 
 
385 aa  262  6.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5694  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4672  lipid-transfer protein  42.07 
 
 
385 aa  262  6.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.495157  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2786  lipid-transfer protein  41.1 
 
 
394 aa  260  3e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1513  lipid-transfer protein  42.32 
 
 
385 aa  258  1e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5253  lipid-transfer protein  42.07 
 
 
385 aa  257  2e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.509405 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8761  lipid-transfer protein  41.61 
 
 
385 aa  257  3e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.134204 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2141  lipid-transfer protein  39.9 
 
 
392 aa  256  5e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2016  lipid-transfer protein  43.88 
 
 
388 aa  255  9e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.314529  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2093  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  44.84 
 
 
385 aa  253  6e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773617  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8194  lipid-transfer protein  39.9 
 
 
390 aa  251  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0887  lipid-transfer protein  40.2 
 
 
390 aa  248  1e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3479  lipid-transfer protein  39.39 
 
 
391 aa  246  6.999999999999999e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0899  lipid-transfer protein  40.31 
 
 
389 aa  241  1e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0063  lipid-transfer protein  39.45 
 
 
390 aa  241  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2621  lipid-transfer protein  40.85 
 
 
395 aa  236  6e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000528338  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0511  lipid-transfer protein  38.9 
 
 
389 aa  236  6e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3651  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  41.19 
 
 
387 aa  225  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.48348  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1835  lipid-transfer protein  40.05 
 
 
381 aa  223  4e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.722448  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3321  lipid-transfer protein  40.5 
 
 
389 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0828492  hitchhiker  0.000989049 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2819  lipid-transfer protein  39.24 
 
 
389 aa  220  3.9999999999999997e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1971  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  39.69 
 
 
387 aa  218  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5553  hypothetical protein  36.95 
 
 
383 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4021  putative nonspecific lipid-transfer protein  38.32 
 
 
378 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3540  hypothetical protein  36.9 
 
 
392 aa  212  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4266  hypothetical protein  38.38 
 
 
381 aa  212  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.804759  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2839  hypothetical protein  38.18 
 
 
388 aa  207  3e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00983373  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3512  thiolase  38.35 
 
 
390 aa  203  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5302  putative nonspecific lipid-transfer protein  38.36 
 
 
388 aa  201  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.739228 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1026  hypothetical protein  37.31 
 
 
396 aa  199  7.999999999999999e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.651118  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2103  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  34.49 
 
 
384 aa  199  9e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.655505  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2277  thiolase  35.68 
 
 
383 aa  192  8e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.573629 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4716  DitF protein  34.97 
 
 
453 aa  189  5e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2367  hypothetical protein  35.53 
 
 
393 aa  188  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.351877  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.97 
 
 
382 aa  187  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3310  hypothetical protein  34.51 
 
 
393 aa  186  4e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.408434 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4492  hypothetical protein  35.51 
 
 
385 aa  185  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0352  hypothetical protein  33.17 
 
 
386 aa  184  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000477716  decreased coverage  0.0000013738 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5111  thiolase  36.13 
 
 
390 aa  184  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000299159  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5279  thiolase  36.68 
 
 
385 aa  181  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6845  thiolase  35.68 
 
 
383 aa  179  8e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51190  thiolase  36.59 
 
 
383 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000113364 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1803  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.81 
 
 
389 aa  176  4e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.851643 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6832  DitF protein  35.4 
 
 
396 aa  176  9e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1484  hypothetical protein  37.53 
 
 
389 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185234  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4625  thiolase  37.73 
 
 
390 aa  175  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0129  thiolase  36.01 
 
 
402 aa  172  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0342  thiolase  45.13 
 
 
381 aa  171  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2581  thiolase  34.84 
 
 
385 aa  171  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4368  thiolase  37.16 
 
 
383 aa  171  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.739547  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5454  putative nonspecific lipid-transfer protein  36.57 
 
 
388 aa  170  4e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.839799  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5851  putative nonspecific lipid-transfer protein  36.57 
 
 
388 aa  170  4e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0314395  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4108  diterpenoid dioxygenase  32.46 
 
 
397 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.742638  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  32.91 
 
 
380 aa  168  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2483  hypothetical protein  35.55 
 
 
548 aa  168  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.207424 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0177  thiolase  36.36 
 
 
403 aa  168  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0147  thiolase  35.46 
 
 
402 aa  168  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1902  hypothetical protein  31.68 
 
 
396 aa  167  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.986081  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2931  hypothetical protein  34.35 
 
 
379 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  36.53 
 
 
383 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4311  hypothetical protein  34.75 
 
 
389 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3607  acetyl-CoA acetyltransferase  35.99 
 
 
382 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.241671  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3115  acetyl-CoA acetyltransferase  35.71 
 
 
382 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119662  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5006  acetyl-CoA acetyltransferase  35.08 
 
 
382 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  0.11432 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4171  hypothetical protein  36.78 
 
 
548 aa  164  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5776  thiolase  35.94 
 
 
393 aa  164  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  37.24 
 
 
388 aa  163  5.0000000000000005e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0554  putative nonspecific lipid-transfer protein  36.9 
 
 
388 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0636  putative nonspecific lipid-transfer protein  36.9 
 
 
388 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.962067  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2044  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  33.42 
 
 
360 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5643  putative nonspecific lipid-transfer protein  36.64 
 
 
388 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4787  acetyl-CoA acetyltransferase  35.68 
 
 
387 aa  160  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0607631  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1643  putative nonspecific lipid-transfer protein  36.64 
 
 
388 aa  159  6e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1670  putative nonspecific lipid-transfer protein  36.64 
 
 
388 aa  159  6e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1496  hypothetical protein  35.44 
 
 
390 aa  159  6e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1694  putative nonspecific lipid-transfer protein  36.64 
 
 
388 aa  159  6e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0581  hypothetical protein  30.75 
 
 
395 aa  159  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0835832  normal  0.505436 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3705  hypothetical protein  34.77 
 
 
550 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724372  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3829  acetyl-CoA acetyltransferase  34.41 
 
 
388 aa  158  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.401188  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3765  hypothetical protein  34.77 
 
 
550 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5255  thiolase  34.63 
 
 
389 aa  158  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4413  acetyl-CoA acetyltransferase  33.7 
 
 
389 aa  158  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00900083  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3692  hypothetical protein  34.77 
 
 
550 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2350  acetyl-CoA acetyltransferase  36.74 
 
 
382 aa  157  4e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.731467  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4180  putative acetyl-CoA C-acetyltransferase  34.11 
 
 
394 aa  157  4e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.785914  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1978  hypothetical protein  33.33 
 
 
379 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960116  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  32.12 
 
 
386 aa  155  1e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  29.49 
 
 
387 aa  155  2e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0860  putative thiolase  34.69 
 
 
384 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016172  normal  0.461503 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0529  putative nonspecific lipid-transfer protein  36.32 
 
 
388 aa  155  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.384509  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3805  acetyl-CoA acetyltransferase  32.35 
 
 
388 aa  152  7e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4071  thiolase  35.62 
 
 
382 aa  152  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0617  DitF protein  32.35 
 
 
400 aa  151  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206422  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1757  acetyl-CoA acetyltransferase  31.95 
 
 
391 aa  150  4e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439431  normal  0.143058 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1502  acetyl-CoA acetyltransferase  32.78 
 
 
390 aa  149  9e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>