More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4311 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_4311  hypothetical protein  100 
 
 
389 aa  795    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2839  hypothetical protein  58.05 
 
 
388 aa  442  1e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00983373  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1484  hypothetical protein  60.47 
 
 
389 aa  428  1e-119  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185234  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3512  thiolase  38.08 
 
 
390 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  39.02 
 
 
382 aa  224  3e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5279  thiolase  39.16 
 
 
385 aa  220  3.9999999999999997e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4266  hypothetical protein  39.69 
 
 
381 aa  218  1e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.804759  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2277  thiolase  39.32 
 
 
383 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.573629 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5776  thiolase  40.41 
 
 
393 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4069  putative thiolase  40.11 
 
 
372 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.655327  normal  0.671191 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51190  thiolase  36.95 
 
 
383 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000113364 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0342  thiolase  39.11 
 
 
381 aa  208  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0177  thiolase  40.34 
 
 
403 aa  209  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6845  thiolase  36.27 
 
 
383 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0147  thiolase  49.18 
 
 
402 aa  207  2e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4368  thiolase  36.76 
 
 
383 aa  206  6e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.739547  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0129  thiolase  49.18 
 
 
402 aa  206  8e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2093  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  39.43 
 
 
385 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773617  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5111  thiolase  37.34 
 
 
390 aa  199  6e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000299159  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5255  thiolase  36.91 
 
 
389 aa  199  7e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6629  thiolase  38.5 
 
 
381 aa  199  9e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4625  thiolase  35.94 
 
 
390 aa  196  8.000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0887  lipid-transfer protein  34.91 
 
 
390 aa  195  1e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2581  thiolase  34.93 
 
 
385 aa  194  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5302  putative nonspecific lipid-transfer protein  36.13 
 
 
388 aa  191  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.739228 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0899  lipid-transfer protein  36.52 
 
 
389 aa  191  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2141  lipid-transfer protein  33.86 
 
 
392 aa  189  5e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  37.53 
 
 
383 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1803  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.9 
 
 
389 aa  188  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.851643 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0352  hypothetical protein  35.28 
 
 
386 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000477716  decreased coverage  0.0000013738 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3479  lipid-transfer protein  35.22 
 
 
391 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0860  putative thiolase  37.43 
 
 
384 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016172  normal  0.461503 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2786  lipid-transfer protein  34.82 
 
 
394 aa  184  3e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  36.18 
 
 
388 aa  182  7e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1074  thiolase  36.41 
 
 
384 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0511  lipid-transfer protein  33.24 
 
 
389 aa  178  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4021  putative nonspecific lipid-transfer protein  33.69 
 
 
378 aa  177  4e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5499  acetyl-CoA acetyltransferase  36.07 
 
 
391 aa  176  5e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13573  lipid-transfer protein  34.6 
 
 
386 aa  176  7e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000077821 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1757  acetyl-CoA acetyltransferase  33.16 
 
 
391 aa  174  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439431  normal  0.143058 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3858  hypothetical protein  36.01 
 
 
390 aa  174  1.9999999999999998e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.198117  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3651  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  36.61 
 
 
387 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.48348  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  33.16 
 
 
380 aa  174  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0063  lipid-transfer protein  34.83 
 
 
390 aa  173  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8194  lipid-transfer protein  35.01 
 
 
390 aa  173  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1502  acetyl-CoA acetyltransferase  34.44 
 
 
390 aa  172  5.999999999999999e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5253  lipid-transfer protein  35.05 
 
 
385 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.509405 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8761  lipid-transfer protein  33.85 
 
 
385 aa  172  9e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.134204 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4071  thiolase  36.72 
 
 
382 aa  171  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2103  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  33.68 
 
 
384 aa  170  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.655505  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4055  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.75 
 
 
397 aa  169  7e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0205444  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3607  acetyl-CoA acetyltransferase  34.44 
 
 
382 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.241671  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5057  lipid-transfer protein  33.59 
 
 
385 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1513  lipid-transfer protein  34.68 
 
 
385 aa  169  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2361  lipid-transfer protein  36.58 
 
 
394 aa  169  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4758  lipid-transfer protein  33.84 
 
 
385 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5694  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4672  lipid-transfer protein  33.84 
 
 
385 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.495157  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3805  acetyl-CoA acetyltransferase  33.24 
 
 
388 aa  166  5e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3115  acetyl-CoA acetyltransferase  33.87 
 
 
382 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119662  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5006  acetyl-CoA acetyltransferase  33.89 
 
 
382 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  0.11432 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2931  hypothetical protein  32.63 
 
 
379 aa  166  8e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3829  acetyl-CoA acetyltransferase  33.98 
 
 
388 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.401188  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2350  acetyl-CoA acetyltransferase  35.56 
 
 
382 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.731467  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4413  acetyl-CoA acetyltransferase  34.43 
 
 
389 aa  164  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00900083  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2663  acetyl-CoA acetyltransferase  35.38 
 
 
385 aa  164  3e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1835  lipid-transfer protein  30.17 
 
 
381 aa  160  5e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.722448  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3321  lipid-transfer protein  34.2 
 
 
389 aa  159  7e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0828492  hitchhiker  0.000989049 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0844  thiolase  45.06 
 
 
384 aa  158  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4152  acetyl-CoA acetyltransferase  33.07 
 
 
389 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500938  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5553  hypothetical protein  32.35 
 
 
383 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1978  hypothetical protein  31.23 
 
 
379 aa  156  7e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960116  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2483  hypothetical protein  35.7 
 
 
548 aa  155  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.207424 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1879  putative lipid transfer protein  30.97 
 
 
379 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0403443 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2819  lipid-transfer protein  34.03 
 
 
389 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3540  hypothetical protein  30.75 
 
 
392 aa  153  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0581  hypothetical protein  32.27 
 
 
395 aa  153  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0835832  normal  0.505436 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4565  acetyl-CoA acetyltransferase  33.79 
 
 
388 aa  153  5.9999999999999996e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153409  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4108  diterpenoid dioxygenase  31.78 
 
 
397 aa  152  7e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.742638  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1686  Acetyl-CoA acetyltransferase-like  31.73 
 
 
379 aa  152  8e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0569144  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2935  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  32.31 
 
 
383 aa  152  8e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.220087  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3588  thiolase  31.23 
 
 
379 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2016  lipid-transfer protein  32.91 
 
 
388 aa  152  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.314529  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2621  lipid-transfer protein  34.83 
 
 
395 aa  151  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000528338  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4787  acetyl-CoA acetyltransferase  36.31 
 
 
387 aa  151  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0607631  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2151  nonspecific lipid-transfer protein  32.43 
 
 
403 aa  149  9e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4180  putative acetyl-CoA C-acetyltransferase  32.75 
 
 
394 aa  148  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.785914  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1902  hypothetical protein  30.57 
 
 
396 aa  146  7.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.986081  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7411  acetyl-CoA acetyltransferase  33.95 
 
 
383 aa  146  8.000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4492  hypothetical protein  33.77 
 
 
385 aa  145  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  30.52 
 
 
387 aa  144  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  29.82 
 
 
387 aa  144  2e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5095  acetyl-CoA acetyltransferase  34.1 
 
 
395 aa  144  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.926475 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  29.54 
 
 
388 aa  143  6e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4171  hypothetical protein  35.06 
 
 
548 aa  143  6e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  28.61 
 
 
388 aa  142  8e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  30.71 
 
 
387 aa  142  8e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0900  hypothetical protein  32.2 
 
 
389 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.049177  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  30.79 
 
 
386 aa  140  3e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1971  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  36.36 
 
 
387 aa  139  6e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  30.98 
 
 
390 aa  139  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>