More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4071 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4071  thiolase  100 
 
 		 382 aa  762    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6629  thiolase  73.16 
 
 		 381 aa  536  1e-151  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5279  thiolase  49.34 
 
 		 385 aa  348  9e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3512  thiolase  47.23 
 
 		 390 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5255  thiolase  50.91 
 
 		 389 aa  342  8e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2277  thiolase  50.53 
 
 		 383 aa  340  2e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.573629 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5776  thiolase  50.53 
 
 		 393 aa  336  3.9999999999999995e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51190  thiolase  47.87 
 
 		 383 aa  334  1e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113364 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6845  thiolase  48.76 
 
 		 383 aa  333  4e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4368  thiolase  48.4 
 
 		 383 aa  333  4e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.739547  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0147  thiolase  49.74 
 
 		 402 aa  330  2e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0177  thiolase  49.08 
 
 		 403 aa  329  5.0000000000000004e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0129  thiolase  49.74 
 
 		 402 aa  327  1.0000000000000001e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5111  thiolase  49.42 
 
 		 390 aa  322  5e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000299159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1074  thiolase  48.94 
 
 		 384 aa  318  7.999999999999999e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  47.49 
 
 		 382 aa  312  5.999999999999999e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0342  thiolase  48.67 
 
 		 381 aa  310  2e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2581  thiolase  47.07 
 
 		 385 aa  309  5.9999999999999995e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4625  thiolase  45.65 
 
 		 390 aa  304  1.0000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  47.12 
 
 		 383 aa  300  3e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  44.71 
 
 		 380 aa  296  3e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0844  thiolase  47.55 
 
 		 384 aa  293  2e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2935  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  46.05 
 
 		 383 aa  278  2e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.220087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2931  hypothetical protein  41.49 
 
 		 379 aa  269  5e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1978  hypothetical protein  41.76 
 
 		 379 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960116  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3588  thiolase  41.49 
 
 		 379 aa  263  4e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  41.98 
 
 		 388 aa  262  6e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1879  putative lipid transfer protein  41.49 
 
 		 379 aa  262  8e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0403443 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3829  acetyl-CoA acetyltransferase  43.15 
 
 		 388 aa  258  9e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.401188  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4413  acetyl-CoA acetyltransferase  43.93 
 
 		 389 aa  257  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00900083  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1686  Acetyl-CoA acetyltransferase-like  42.82 
 
 		 379 aa  256  4e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0569144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5499  acetyl-CoA acetyltransferase  43.56 
 
 		 391 aa  253  5.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3401  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  42.52 
 
 		 380 aa  251  2e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0771846 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3805  acetyl-CoA acetyltransferase  41.69 
 
 		 388 aa  251  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4152  acetyl-CoA acetyltransferase  42.12 
 
 		 389 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500938  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0860  putative thiolase  39.85 
 
 		 384 aa  242  7e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016172  normal  0.461503 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5006  acetyl-CoA acetyltransferase  40.95 
 
 		 382 aa  241  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  0.11432 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4565  acetyl-CoA acetyltransferase  43.15 
 
 		 388 aa  239  5.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153409  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1757  acetyl-CoA acetyltransferase  41.67 
 
 		 391 aa  237  3e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439431  normal  0.143058 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2663  acetyl-CoA acetyltransferase  42.75 
 
 		 385 aa  235  8e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3607  acetyl-CoA acetyltransferase  41.41 
 
 		 382 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.241671  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3115  acetyl-CoA acetyltransferase  41.41 
 
 		 382 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119662  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1502  acetyl-CoA acetyltransferase  41.13 
 
 		 390 aa  228  1e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4787  acetyl-CoA acetyltransferase  43.01 
 
 		 387 aa  228  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0607631  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7411  acetyl-CoA acetyltransferase  42.18 
 
 		 383 aa  228  2e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2350  acetyl-CoA acetyltransferase  41.97 
 
 		 382 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.731467  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2839  hypothetical protein  38.35 
 
 		 388 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00983373  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5095  acetyl-CoA acetyltransferase  39.21 
 
 		 395 aa  205  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.926475 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4266  hypothetical protein  37.01 
 
 		 381 aa  201  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.804759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2093  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  42.37 
 
 		 385 aa  195  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3651  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  38.73 
 
 		 387 aa  189  7e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.48348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0887  lipid-transfer protein  37.53 
 
 		 390 aa  189  7e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5302  putative nonspecific lipid-transfer protein  37.2 
 
 		 388 aa  187  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.739228 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3226  hypothetical protein  35.94 
 
 		 388 aa  186  7e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3215  hypothetical protein  35.94 
 
 		 388 aa  186  7e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3277  hypothetical protein  35.94 
 
 		 388 aa  186  7e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0900  hypothetical protein  36.13 
 
 		 389 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.049177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13573  lipid-transfer protein  38.16 
 
 		 386 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000077821 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4311  hypothetical protein  36.72 
 
 		 389 aa  182  9.000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2361  lipid-transfer protein  39.14 
 
 		 394 aa  181  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1484  hypothetical protein  37.5 
 
 		 389 aa  179  7e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185234  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0352  hypothetical protein  33.78 
 
 		 386 aa  178  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000477716  decreased coverage  0.0000013738 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2105  thiolase  33.87 
 
 		 404 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0715913  normal  0.0186682 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6832  DitF protein  39.95 
 
 		 396 aa  175  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8761  lipid-transfer protein  36.34 
 
 		 385 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.134204 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3314  thiolase  34.78 
 
 		 404 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4171  hypothetical protein  36.46 
 
 		 548 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3567  putative thiolase  34.24 
 
 		 378 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1803  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.65 
 
 		 389 aa  173  5e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.851643 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2786  lipid-transfer protein  35.68 
 
 		 394 aa  173  5.999999999999999e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4108  diterpenoid dioxygenase  36.53 
 
 		 397 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.742638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1513  lipid-transfer protein  37.04 
 
 		 385 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1835  lipid-transfer protein  35.39 
 
 		 381 aa  171  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.722448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2151  nonspecific lipid-transfer protein  32.66 
 
 		 403 aa  171  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2483  hypothetical protein  35.66 
 
 		 548 aa  172  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.207424 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8194  lipid-transfer protein  36.58 
 
 		 390 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2103  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  37.22 
 
 		 384 aa  171  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.655505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3705  hypothetical protein  36.69 
 
 		 550 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  34.52 
 
 		 386 aa  170  3e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0511  lipid-transfer protein  35.22 
 
 		 389 aa  169  5e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3692  hypothetical protein  36.68 
 
 		 550 aa  169  6e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3765  hypothetical protein  36.68 
 
 		 550 aa  169  6e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3479  lipid-transfer protein  34.96 
 
 		 391 aa  169  9e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0859  thiolase  32.19 
 
 		 389 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.823302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2016  lipid-transfer protein  36.25 
 
 		 388 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.314529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2141  lipid-transfer protein  34.38 
 
 		 392 aa  166  5e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1902  hypothetical protein  34.1 
 
 		 396 aa  166  6.9999999999999995e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.986081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5057  lipid-transfer protein  36.41 
 
 		 385 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  39.67 
 
 		 387 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4672  lipid-transfer protein  36.15 
 
 		 385 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.495157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4758  lipid-transfer protein  36.15 
 
 		 385 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2744  putative thiolase/acetyl-CoA acetyltransferase, PaaJ-like  30.13 
 
 		 406 aa  164  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0906041 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5253  lipid-transfer protein  35.98 
 
 		 385 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509405 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4055  putative nonspecific lipid-transfer protein  36.71 
 
 		 397 aa  162  7e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0205444  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3858  hypothetical protein  34.64 
 
 		 390 aa  162  1e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.198117  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3952  putative thiolase  35.42 
 
 		 378 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.130005  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  31.75 
 
 		 388 aa  162  1e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0063  lipid-transfer protein  33.95 
 
 		 390 aa  161  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  37.08 
 
 		 388 aa  161  2e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0899  lipid-transfer protein  36.78 
 
 		 389 aa  160  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>