More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4565 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B3829  acetyl-CoA acetyltransferase  95.1 
 
 
388 aa  768    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.401188  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4152  acetyl-CoA acetyltransferase  88.66 
 
 
389 aa  718    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500938  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4565  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 
388 aa  798    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153409  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3805  acetyl-CoA acetyltransferase  88.92 
 
 
388 aa  725    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4413  acetyl-CoA acetyltransferase  88.66 
 
 
389 aa  721    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00900083  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5499  acetyl-CoA acetyltransferase  80.56 
 
 
391 aa  644    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1757  acetyl-CoA acetyltransferase  71.72 
 
 
391 aa  580  1e-164  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439431  normal  0.143058 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5006  acetyl-CoA acetyltransferase  73.45 
 
 
382 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  0.11432 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4787  acetyl-CoA acetyltransferase  76.55 
 
 
387 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0607631  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1502  acetyl-CoA acetyltransferase  70.1 
 
 
390 aa  566  1e-160  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3607  acetyl-CoA acetyltransferase  71.13 
 
 
382 aa  561  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.241671  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3115  acetyl-CoA acetyltransferase  71.13 
 
 
382 aa  560  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119662  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2350  acetyl-CoA acetyltransferase  70.62 
 
 
382 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.731467  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2663  acetyl-CoA acetyltransferase  70.95 
 
 
385 aa  540  9.999999999999999e-153  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5095  acetyl-CoA acetyltransferase  68.02 
 
 
395 aa  525  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.926475 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7411  acetyl-CoA acetyltransferase  59.59 
 
 
383 aa  418  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3512  thiolase  43.01 
 
 
390 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5279  thiolase  44.59 
 
 
385 aa  278  8e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5776  thiolase  45.08 
 
 
393 aa  277  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  44.99 
 
 
383 aa  273  3e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5111  thiolase  46.26 
 
 
390 aa  271  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000299159  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0342  thiolase  44.04 
 
 
381 aa  269  5.9999999999999995e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5255  thiolase  44.36 
 
 
389 aa  269  8e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0147  thiolase  43.65 
 
 
402 aa  265  7e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0129  thiolase  43.39 
 
 
402 aa  264  2e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0177  thiolase  42.71 
 
 
403 aa  261  2e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2277  thiolase  41.86 
 
 
383 aa  258  8e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.573629 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1074  thiolase  44.03 
 
 
384 aa  255  9e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4368  thiolase  41.73 
 
 
383 aa  253  3e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.739547  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2581  thiolase  41.6 
 
 
385 aa  253  6e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  41.24 
 
 
380 aa  249  4e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51190  thiolase  41.47 
 
 
383 aa  249  4e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000113364 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2935  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  42.89 
 
 
383 aa  246  4e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.220087  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6845  thiolase  38.68 
 
 
383 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  41.45 
 
 
382 aa  243  3.9999999999999997e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1978  hypothetical protein  41.18 
 
 
379 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960116  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2931  hypothetical protein  41.24 
 
 
379 aa  239  5.999999999999999e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6629  thiolase  43.16 
 
 
381 aa  238  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4625  thiolase  39.84 
 
 
390 aa  237  3e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  38.97 
 
 
388 aa  232  9e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1879  putative lipid transfer protein  40.66 
 
 
379 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0403443 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3588  thiolase  40.15 
 
 
379 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0860  putative thiolase  40.52 
 
 
384 aa  230  4e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016172  normal  0.461503 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1686  Acetyl-CoA acetyltransferase-like  41.82 
 
 
379 aa  225  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0569144  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4071  thiolase  43.15 
 
 
382 aa  225  1e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0844  thiolase  43.47 
 
 
384 aa  220  3.9999999999999997e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3401  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  40.21 
 
 
380 aa  210  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0771846 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2839  hypothetical protein  38.04 
 
 
388 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00983373  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2151  nonspecific lipid-transfer protein  33.42 
 
 
403 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0031  hypothetical protein  35.14 
 
 
402 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.761011  normal  0.262129 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1484  hypothetical protein  42.37 
 
 
389 aa  180  4e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185234  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0041  hypothetical protein  35.14 
 
 
402 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0050  hypothetical protein  35.14 
 
 
402 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0851197  normal  0.0510911 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  34.27 
 
 
388 aa  174  2.9999999999999996e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  33.88 
 
 
387 aa  173  5e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  33.33 
 
 
390 aa  170  3e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3651  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  35.04 
 
 
387 aa  168  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.48348  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4266  hypothetical protein  33.69 
 
 
381 aa  167  4e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.804759  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  33.82 
 
 
387 aa  166  5e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  32.32 
 
 
388 aa  163  4.0000000000000004e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0554  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.19 
 
 
388 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0636  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.19 
 
 
388 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.962067  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4180  putative acetyl-CoA C-acetyltransferase  32.82 
 
 
394 aa  162  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.785914  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1803  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.64 
 
 
389 aa  162  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.851643 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1902  hypothetical protein  33.94 
 
 
396 aa  161  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.986081  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2361  lipid-transfer protein  36.29 
 
 
394 aa  161  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5643  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.92 
 
 
388 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5282  hypothetical protein  33.66 
 
 
390 aa  160  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5454  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.92 
 
 
388 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.839799  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5851  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.92 
 
 
388 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0314395  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0581  hypothetical protein  31.81 
 
 
395 aa  159  8e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0835832  normal  0.505436 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3567  putative thiolase  33.51 
 
 
378 aa  157  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4108  diterpenoid dioxygenase  32.65 
 
 
397 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.742638  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0063  lipid-transfer protein  35.62 
 
 
390 aa  157  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4269  hypothetical protein  33.01 
 
 
402 aa  157  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.340919  normal  0.522568 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6832  DitF protein  35.38 
 
 
396 aa  157  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2093  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  36.49 
 
 
385 aa  156  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773617  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1694  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.66 
 
 
388 aa  156  6e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1670  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.66 
 
 
388 aa  156  6e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1643  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.66 
 
 
388 aa  156  6e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  33.43 
 
 
386 aa  156  7e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2786  lipid-transfer protein  35.25 
 
 
394 aa  155  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2105  thiolase  32.99 
 
 
404 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0715913  normal  0.0186682 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4311  hypothetical protein  33.79 
 
 
389 aa  154  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0529  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.19 
 
 
388 aa  154  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.384509  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8761  lipid-transfer protein  34.43 
 
 
385 aa  154  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.134204 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3314  thiolase  32.9 
 
 
404 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  30.94 
 
 
390 aa  153  5e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  31.83 
 
 
387 aa  151  2e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1008  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  31.75 
 
 
385 aa  150  4e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.011821 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4055  putative nonspecific lipid-transfer protein  33.78 
 
 
397 aa  150  5e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0205444  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  31.88 
 
 
388 aa  149  6e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0352  hypothetical protein  32.77 
 
 
386 aa  149  7e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000477716  decreased coverage  0.0000013738 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3479  lipid-transfer protein  34.2 
 
 
391 aa  149  8e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13573  lipid-transfer protein  32.18 
 
 
386 aa  149  9e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000077821 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3310  hypothetical protein  30.91 
 
 
393 aa  148  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.408434 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2141  lipid-transfer protein  33.42 
 
 
392 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4421  Thiolase  29.18 
 
 
394 aa  148  1.0000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0806685  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1513  lipid-transfer protein  35.18 
 
 
385 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5302  putative nonspecific lipid-transfer protein  33.25 
 
 
388 aa  148  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.739228 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>