More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2141 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_2141  lipid-transfer protein  100 
 
 
392 aa  816    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8194  lipid-transfer protein  63.92 
 
 
390 aa  515  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13573  lipid-transfer protein  63.02 
 
 
386 aa  496  1e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000077821 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3321  lipid-transfer protein  66.49 
 
 
389 aa  497  1e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0828492  hitchhiker  0.000989049 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3479  lipid-transfer protein  62.67 
 
 
391 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0063  lipid-transfer protein  64.36 
 
 
390 aa  488  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0887  lipid-transfer protein  61.4 
 
 
390 aa  480  1e-134  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0511  lipid-transfer protein  61.39 
 
 
389 aa  480  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2786  lipid-transfer protein  61.5 
 
 
394 aa  478  1e-134  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2621  lipid-transfer protein  59.69 
 
 
395 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000528338  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5057  lipid-transfer protein  63.28 
 
 
385 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5253  lipid-transfer protein  63.28 
 
 
385 aa  464  9.999999999999999e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.509405 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3858  hypothetical protein  61.5 
 
 
390 aa  467  9.999999999999999e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.198117  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4758  lipid-transfer protein  63.28 
 
 
385 aa  462  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5694  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4672  lipid-transfer protein  63.28 
 
 
385 aa  462  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.495157  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1513  lipid-transfer protein  63.28 
 
 
385 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2819  lipid-transfer protein  60.68 
 
 
389 aa  456  1e-127  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2016  lipid-transfer protein  55.01 
 
 
388 aa  412  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.314529  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8761  lipid-transfer protein  43.23 
 
 
385 aa  310  4e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.134204 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1835  lipid-transfer protein  40.1 
 
 
381 aa  286  5e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.722448  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3651  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  40.51 
 
 
387 aa  266  7e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.48348  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0899  lipid-transfer protein  37.18 
 
 
389 aa  248  2e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4055  putative nonspecific lipid-transfer protein  39.9 
 
 
397 aa  246  6e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0205444  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2093  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  43.41 
 
 
385 aa  245  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773617  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2103  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  37.34 
 
 
384 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.655505  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3540  hypothetical protein  36.34 
 
 
392 aa  239  9e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5553  hypothetical protein  36.86 
 
 
383 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2361  lipid-transfer protein  37.91 
 
 
394 aa  234  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1971  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  38.66 
 
 
387 aa  229  4e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5302  putative nonspecific lipid-transfer protein  38.58 
 
 
388 aa  230  4e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.739228 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4021  putative nonspecific lipid-transfer protein  36.7 
 
 
378 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1026  hypothetical protein  36.22 
 
 
396 aa  227  3e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.651118  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2044  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  36.69 
 
 
360 aa  225  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2839  hypothetical protein  37.53 
 
 
388 aa  224  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00983373  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1803  putative nonspecific lipid-transfer protein  36.48 
 
 
389 aa  218  2e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.851643 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4266  hypothetical protein  37.47 
 
 
381 aa  211  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.804759  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0891  thiolase  35.96 
 
 
405 aa  211  2e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.849216  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4492  hypothetical protein  33.42 
 
 
385 aa  206  6e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2367  hypothetical protein  35.68 
 
 
393 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.351877  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4108  diterpenoid dioxygenase  34.83 
 
 
397 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.742638  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0352  hypothetical protein  33.51 
 
 
386 aa  192  6e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000477716  decreased coverage  0.0000013738 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1902  hypothetical protein  31.55 
 
 
396 aa  187  3e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.986081  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4311  hypothetical protein  33.86 
 
 
389 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0900  hypothetical protein  32.83 
 
 
389 aa  184  3e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.049177  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  35.07 
 
 
380 aa  183  4.0000000000000006e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3512  thiolase  32.49 
 
 
390 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0581  hypothetical protein  30.32 
 
 
395 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0835832  normal  0.505436 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3705  hypothetical protein  34.18 
 
 
550 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724372  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5279  thiolase  33.42 
 
 
385 aa  177  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3692  hypothetical protein  33.93 
 
 
550 aa  177  4e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3765  hypothetical protein  33.93 
 
 
550 aa  177  4e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  32.91 
 
 
388 aa  176  9e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3310  hypothetical protein  32.27 
 
 
393 aa  175  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.408434 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4323  hypothetical protein  30.08 
 
 
541 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.51495 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5255  thiolase  34.44 
 
 
389 aa  175  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2581  thiolase  31.78 
 
 
385 aa  173  3.9999999999999995e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0860  putative thiolase  34.24 
 
 
384 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016172  normal  0.461503 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4716  DitF protein  31.52 
 
 
453 aa  172  6.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4171  hypothetical protein  34.96 
 
 
548 aa  171  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2483  hypothetical protein  33.59 
 
 
548 aa  171  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.207424 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.67 
 
 
382 aa  171  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  32.41 
 
 
383 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6832  DitF protein  32.55 
 
 
396 aa  170  4e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1484  hypothetical protein  35.79 
 
 
389 aa  169  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185234  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2277  thiolase  33.15 
 
 
383 aa  168  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.573629 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2935  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  33.25 
 
 
383 aa  165  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.220087  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1502  acetyl-CoA acetyltransferase  34.99 
 
 
390 aa  163  6e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4632  acetyl-CoA acetyltransferase  32.9 
 
 
402 aa  163  6e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0906  hypothetical protein  30.52 
 
 
394 aa  162  7e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00747371  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5499  acetyl-CoA acetyltransferase  34.73 
 
 
391 aa  162  8.000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51190  thiolase  30.54 
 
 
383 aa  161  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000113364 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5454  putative nonspecific lipid-transfer protein  32.98 
 
 
388 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.839799  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5851  putative nonspecific lipid-transfer protein  32.98 
 
 
388 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0314395  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4413  acetyl-CoA acetyltransferase  34.58 
 
 
389 aa  159  7e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00900083  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0617  DitF protein  31.28 
 
 
400 aa  159  8e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206422  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5643  putative nonspecific lipid-transfer protein  33.25 
 
 
388 aa  159  9e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4152  acetyl-CoA acetyltransferase  34.58 
 
 
389 aa  158  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500938  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2931  hypothetical protein  32.15 
 
 
379 aa  158  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0636  putative nonspecific lipid-transfer protein  32.98 
 
 
388 aa  157  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.962067  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0554  putative nonspecific lipid-transfer protein  32.98 
 
 
388 aa  157  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4625  thiolase  31.92 
 
 
390 aa  158  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6845  thiolase  29.11 
 
 
383 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6629  thiolase  34.02 
 
 
381 aa  157  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1670  putative nonspecific lipid-transfer protein  32.98 
 
 
388 aa  157  4e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1643  putative nonspecific lipid-transfer protein  32.98 
 
 
388 aa  157  4e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1694  putative nonspecific lipid-transfer protein  32.98 
 
 
388 aa  157  4e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0859  thiolase  33.25 
 
 
389 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.823302  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3805  acetyl-CoA acetyltransferase  33.24 
 
 
388 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4368  thiolase  30.87 
 
 
383 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.739547  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5776  thiolase  30.2 
 
 
393 aa  156  7e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5111  thiolase  30.65 
 
 
390 aa  152  8e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000299159  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0147  thiolase  31.81 
 
 
402 aa  152  1e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0129  thiolase  31.04 
 
 
402 aa  151  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5006  acetyl-CoA acetyltransferase  32.29 
 
 
382 aa  150  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  0.11432 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1879  putative lipid transfer protein  30.16 
 
 
379 aa  150  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0403443 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4071  thiolase  34.38 
 
 
382 aa  149  8e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1757  acetyl-CoA acetyltransferase  33.5 
 
 
391 aa  148  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439431  normal  0.143058 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1978  hypothetical protein  30 
 
 
379 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960116  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3829  acetyl-CoA acetyltransferase  33.67 
 
 
388 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.401188  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3588  thiolase  29.89 
 
 
379 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.446493 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>