More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2581 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_2581  thiolase  100 
 
 		 385 aa  781    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6845  thiolase  66.93 
 
 		 383 aa  529  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3512  thiolase  59.38 
 
 		 390 aa  457  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2277  thiolase  60.53 
 
 		 383 aa  456  1e-127  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.573629 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4368  thiolase  60.32 
 
 		 383 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.739547  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51190  thiolase  60.05 
 
 		 383 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113364 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5279  thiolase  58.7 
 
 		 385 aa  443  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0342  thiolase  59.36 
 
 		 381 aa  437  1e-121  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5776  thiolase  58.85 
 
 		 393 aa  431  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0177  thiolase  57.55 
 
 		 403 aa  425  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0129  thiolase  57.81 
 
 		 402 aa  426  1e-118  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0147  thiolase  58.07 
 
 		 402 aa  427  1e-118  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5111  thiolase  55.1 
 
 		 390 aa  390  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000299159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4625  thiolase  51.17 
 
 		 390 aa  361  1e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1074  thiolase  51.45 
 
 		 384 aa  351  8.999999999999999e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5255  thiolase  50 
 
 		 389 aa  331  1e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  46.81 
 
 		 382 aa  329  4e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6629  thiolase  50.13 
 
 		 381 aa  323  3e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  44.53 
 
 		 383 aa  285  9e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4071  thiolase  47.07 
 
 		 382 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0844  thiolase  45.8 
 
 		 384 aa  278  1e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  38.89 
 
 		 380 aa  271  1e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2935  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  41.88 
 
 		 383 aa  263  4e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.220087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  40.42 
 
 		 388 aa  256  6e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1978  hypothetical protein  37.27 
 
 		 379 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960116  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3401  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  41.24 
 
 		 380 aa  255  1.0000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0771846 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3588  thiolase  37.01 
 
 		 379 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2931  hypothetical protein  36.75 
 
 		 379 aa  252  7e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3829  acetyl-CoA acetyltransferase  40.77 
 
 		 388 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.401188  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1879  putative lipid transfer protein  36.48 
 
 		 379 aa  250  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0403443 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5499  acetyl-CoA acetyltransferase  42.56 
 
 		 391 aa  249  6e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0860  putative thiolase  38.79 
 
 		 384 aa  248  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016172  normal  0.461503 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4413  acetyl-CoA acetyltransferase  40.83 
 
 		 389 aa  248  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00900083  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4565  acetyl-CoA acetyltransferase  41.6 
 
 		 388 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153409  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4152  acetyl-CoA acetyltransferase  39.84 
 
 		 389 aa  242  7.999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500938  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1686  Acetyl-CoA acetyltransferase-like  37.04 
 
 		 379 aa  242  7.999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0569144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5006  acetyl-CoA acetyltransferase  40.43 
 
 		 382 aa  240  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  0.11432 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1757  acetyl-CoA acetyltransferase  39.75 
 
 		 391 aa  241  2e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439431  normal  0.143058 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7411  acetyl-CoA acetyltransferase  43.12 
 
 		 383 aa  241  2e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3805  acetyl-CoA acetyltransferase  39.28 
 
 		 388 aa  238  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3607  acetyl-CoA acetyltransferase  39.89 
 
 		 382 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.241671  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4266  hypothetical protein  37.99 
 
 		 381 aa  229  6e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.804759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2663  acetyl-CoA acetyltransferase  39.73 
 
 		 385 aa  229  6e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3115  acetyl-CoA acetyltransferase  40.16 
 
 		 382 aa  227  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119662  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2350  acetyl-CoA acetyltransferase  40.27 
 
 		 382 aa  225  1e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.731467  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4787  acetyl-CoA acetyltransferase  40.67 
 
 		 387 aa  219  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0607631  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2839  hypothetical protein  38.38 
 
 		 388 aa  217  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00983373  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1502  acetyl-CoA acetyltransferase  38.38 
 
 		 390 aa  217  2.9999999999999998e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5095  acetyl-CoA acetyltransferase  40.46 
 
 		 395 aa  214  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.926475 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1803  putative nonspecific lipid-transfer protein  38.46 
 
 		 389 aa  207  2e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.851643 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3567  putative thiolase  36.87 
 
 		 378 aa  201  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3651  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  35.77 
 
 		 387 aa  201  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.48348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1902  hypothetical protein  35.57 
 
 		 396 aa  199  7.999999999999999e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.986081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  35.73 
 
 		 386 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6832  DitF protein  39.72 
 
 		 396 aa  196  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1484  hypothetical protein  37.8 
 
 		 389 aa  196  8.000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185234  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2093  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  36.56 
 
 		 385 aa  195  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  33.67 
 
 		 387 aa  192  6e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3322  thiolase  37.9 
 
 		 383 aa  192  8e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00152041  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4311  hypothetical protein  35.69 
 
 		 389 aa  192  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2105  thiolase  36.64 
 
 		 404 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0715913  normal  0.0186682 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3972  thiolase  37.63 
 
 		 383 aa  191  2.9999999999999997e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.330404 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  32.99 
 
 		 388 aa  190  4e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  32.9 
 
 		 390 aa  188  2e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5302  putative nonspecific lipid-transfer protein  36.91 
 
 		 388 aa  187  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.739228 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2786  lipid-transfer protein  36.13 
 
 		 394 aa  187  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3314  thiolase  36.04 
 
 		 404 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  34.11 
 
 		 387 aa  187  4e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4716  DitF protein  37.31 
 
 		 453 aa  186  5e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4108  diterpenoid dioxygenase  34.55 
 
 		 397 aa  186  6e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.742638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  33.76 
 
 		 388 aa  186  7e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  32.99 
 
 		 388 aa  186  9e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0581  hypothetical protein  35.64 
 
 		 395 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0835832  normal  0.505436 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  33.85 
 
 		 387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4021  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.23 
 
 		 378 aa  182  8.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  32.14 
 
 		 390 aa  181  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5454  putative nonspecific lipid-transfer protein  36.24 
 
 		 388 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.839799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5851  putative nonspecific lipid-transfer protein  36.24 
 
 		 388 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0314395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3310  hypothetical protein  36.59 
 
 		 393 aa  180  4e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.408434 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1835  lipid-transfer protein  35.42 
 
 		 381 aa  179  4.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.722448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8761  lipid-transfer protein  38.07 
 
 		 385 aa  179  5.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.134204 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3952  putative thiolase  36.86 
 
 		 378 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.130005  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4492  hypothetical protein  37.02 
 
 		 385 aa  177  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0900  hypothetical protein  34.72 
 
 		 389 aa  176  4e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.049177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2103  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  35.7 
 
 		 384 aa  176  6e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.655505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4180  putative acetyl-CoA C-acetyltransferase  33.07 
 
 		 394 aa  175  9.999999999999999e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.785914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8194  lipid-transfer protein  34.34 
 
 		 390 aa  174  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13573  lipid-transfer protein  34.92 
 
 		 386 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000077821 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0887  lipid-transfer protein  33.59 
 
 		 390 aa  174  2.9999999999999996e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3858  hypothetical protein  33.67 
 
 		 390 aa  173  3.9999999999999995e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.198117  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2141  lipid-transfer protein  31.78 
 
 		 392 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2361  lipid-transfer protein  41 
 
 		 394 aa  173  5e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3215  hypothetical protein  34.29 
 
 		 388 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3226  hypothetical protein  34.29 
 
 		 388 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3277  hypothetical protein  34.29 
 
 		 388 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2151  nonspecific lipid-transfer protein  32.32 
 
 		 403 aa  171  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0063  lipid-transfer protein  34.95 
 
 		 390 aa  170  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2483  hypothetical protein  33.42 
 
 		 548 aa  169  8e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.207424 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1496  hypothetical protein  34.39 
 
 		 390 aa  169  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4055  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.84 
 
 		 397 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0205444  normal  0.64672 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>