More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5095 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_5095  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 
395 aa  803    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.926475 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3829  acetyl-CoA acetyltransferase  68.27 
 
 
388 aa  550  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.401188  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4413  acetyl-CoA acetyltransferase  69.54 
 
 
389 aa  550  1e-155  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00900083  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4152  acetyl-CoA acetyltransferase  67.77 
 
 
389 aa  538  9.999999999999999e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500938  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5006  acetyl-CoA acetyltransferase  67.77 
 
 
382 aa  541  9.999999999999999e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  0.11432 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1757  acetyl-CoA acetyltransferase  66.33 
 
 
391 aa  535  1e-151  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439431  normal  0.143058 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4565  acetyl-CoA acetyltransferase  68.02 
 
 
388 aa  531  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153409  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3805  acetyl-CoA acetyltransferase  65.99 
 
 
388 aa  533  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5499  acetyl-CoA acetyltransferase  67.42 
 
 
391 aa  534  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3115  acetyl-CoA acetyltransferase  64.97 
 
 
382 aa  523  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119662  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3607  acetyl-CoA acetyltransferase  64.72 
 
 
382 aa  521  1e-147  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.241671  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4787  acetyl-CoA acetyltransferase  68.78 
 
 
387 aa  508  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0607631  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2350  acetyl-CoA acetyltransferase  65.48 
 
 
382 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.731467  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2663  acetyl-CoA acetyltransferase  66.67 
 
 
385 aa  502  1e-141  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1502  acetyl-CoA acetyltransferase  61.93 
 
 
390 aa  492  9.999999999999999e-139  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7411  acetyl-CoA acetyltransferase  57.97 
 
 
383 aa  409  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5255  thiolase  44.84 
 
 
389 aa  261  2e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3512  thiolase  40.2 
 
 
390 aa  258  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5279  thiolase  43.9 
 
 
385 aa  258  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5776  thiolase  43.32 
 
 
393 aa  248  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0129  thiolase  40.78 
 
 
402 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  41.62 
 
 
383 aa  242  7.999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0177  thiolase  39.95 
 
 
403 aa  242  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0147  thiolase  40.52 
 
 
402 aa  241  2e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2277  thiolase  40.81 
 
 
383 aa  236  4e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.573629 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6845  thiolase  39.8 
 
 
383 aa  236  4e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5111  thiolase  42.42 
 
 
390 aa  235  9e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000299159  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6629  thiolase  43.44 
 
 
381 aa  234  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0342  thiolase  41.97 
 
 
381 aa  231  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  42.43 
 
 
382 aa  228  2e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2935  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  40.85 
 
 
383 aa  225  9e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.220087  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1074  thiolase  42.01 
 
 
384 aa  225  9e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4368  thiolase  40.78 
 
 
383 aa  225  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.739547  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2581  thiolase  39.03 
 
 
385 aa  224  3e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  37.53 
 
 
380 aa  221  3e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51190  thiolase  39.74 
 
 
383 aa  219  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000113364 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0860  putative thiolase  40.05 
 
 
384 aa  217  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016172  normal  0.461503 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  39.39 
 
 
388 aa  216  5.9999999999999996e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1978  hypothetical protein  36.57 
 
 
379 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960116  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2931  hypothetical protein  35.93 
 
 
379 aa  204  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1879  putative lipid transfer protein  35.82 
 
 
379 aa  203  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0403443 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3588  thiolase  36.07 
 
 
379 aa  202  7e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0844  thiolase  39.66 
 
 
384 aa  200  3.9999999999999996e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4625  thiolase  38.35 
 
 
390 aa  199  5e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4071  thiolase  40.15 
 
 
382 aa  197  3e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3401  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  38.27 
 
 
380 aa  192  8e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0771846 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1686  Acetyl-CoA acetyltransferase-like  38.17 
 
 
379 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0569144  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2151  nonspecific lipid-transfer protein  34.18 
 
 
403 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2839  hypothetical protein  37.7 
 
 
388 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00983373  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0031  hypothetical protein  34.22 
 
 
402 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.761011  normal  0.262129 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0050  hypothetical protein  34.22 
 
 
402 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0851197  normal  0.0510911 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0041  hypothetical protein  34.22 
 
 
402 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3651  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  39.08 
 
 
387 aa  160  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.48348  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2361  lipid-transfer protein  36.31 
 
 
394 aa  160  5e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0581  hypothetical protein  32.68 
 
 
395 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0835832  normal  0.505436 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  32.33 
 
 
390 aa  157  3e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  31.69 
 
 
388 aa  157  4e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3479  lipid-transfer protein  35.92 
 
 
391 aa  156  6e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1484  hypothetical protein  38.39 
 
 
389 aa  155  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185234  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2105  thiolase  34.63 
 
 
404 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0715913  normal  0.0186682 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4180  putative acetyl-CoA C-acetyltransferase  33.51 
 
 
394 aa  155  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.785914  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  34.16 
 
 
386 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0859  thiolase  31.51 
 
 
389 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.823302  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4269  hypothetical protein  33.9 
 
 
402 aa  152  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.340919  normal  0.522568 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2093  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  38.85 
 
 
385 aa  151  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773617  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7490  Acetyl-CoA acetyltransferase-like  33.69 
 
 
403 aa  151  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.551931 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13573  lipid-transfer protein  34.06 
 
 
386 aa  151  2e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000077821 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  31.13 
 
 
387 aa  151  2e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0063  lipid-transfer protein  37 
 
 
390 aa  151  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  30.3 
 
 
388 aa  151  2e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1833  putative thiolase  31.78 
 
 
405 aa  150  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0913085  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4311  hypothetical protein  33.99 
 
 
389 aa  150  4e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  32.6 
 
 
390 aa  149  8e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  33.06 
 
 
387 aa  149  9e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3314  thiolase  34.27 
 
 
404 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1902  hypothetical protein  30.03 
 
 
396 aa  148  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.986081  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8194  lipid-transfer protein  34.21 
 
 
390 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0887  lipid-transfer protein  33.51 
 
 
390 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4266  hypothetical protein  34.83 
 
 
381 aa  147  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.804759  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5851  putative nonspecific lipid-transfer protein  36.18 
 
 
388 aa  146  5e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0314395  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5282  hypothetical protein  32.31 
 
 
390 aa  146  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5454  putative nonspecific lipid-transfer protein  36.18 
 
 
388 aa  146  5e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.839799  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0554  putative nonspecific lipid-transfer protein  36.18 
 
 
388 aa  146  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0636  putative nonspecific lipid-transfer protein  36.18 
 
 
388 aa  146  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.962067  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6481  thiolase  32.83 
 
 
388 aa  146  8.000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5643  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.92 
 
 
388 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3567  putative thiolase  34.15 
 
 
378 aa  145  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4055  putative nonspecific lipid-transfer protein  31.25 
 
 
397 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0205444  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0899  lipid-transfer protein  33.42 
 
 
389 aa  144  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0352  hypothetical protein  40.64 
 
 
386 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000477716  decreased coverage  0.0000013738 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2786  lipid-transfer protein  33.78 
 
 
394 aa  144  3e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2160  acetyl-CoA acetyltransferase  32.09 
 
 
389 aa  143  4e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4421  Thiolase  30.03 
 
 
394 aa  144  4e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0806685  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3277  hypothetical protein  34.03 
 
 
388 aa  143  6e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2744  putative thiolase/acetyl-CoA acetyltransferase, PaaJ-like  29.85 
 
 
406 aa  143  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0906041 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3215  hypothetical protein  34.03 
 
 
388 aa  143  6e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3226  hypothetical protein  34.03 
 
 
388 aa  143  6e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1277  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  30.79 
 
 
397 aa  142  9e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1694  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.9 
 
 
388 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8761  lipid-transfer protein  31.98 
 
 
385 aa  142  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.134204 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>