More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_D6481 on replicon NC_007337
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007337  Reut_D6481  thiolase  100 
 
 		 388 aa  780    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0859  thiolase  53.52 
 
 		 389 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.823302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5282  hypothetical protein  45.79 
 
 		 390 aa  308  6.999999999999999e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3254  putative thiolase/acetyl-CoA acetyltransferase  35.65 
 
 		 394 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146846  normal  0.511595 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1496  hypothetical protein  35.17 
 
 		 390 aa  194  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1335  hypothetical protein  36.57 
 
 		 391 aa  190  4e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4607  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  36.46 
 
 		 390 aa  187  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.864443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2676  hypothetical protein  35.62 
 
 		 390 aa  187  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5255  thiolase  34.77 
 
 		 389 aa  175  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.56 
 
 		 382 aa  169  9e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2581  thiolase  33.7 
 
 		 385 aa  168  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  35.36 
 
 		 388 aa  161  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  32.22 
 
 		 383 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  31.82 
 
 		 380 aa  157  3e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6629  thiolase  32.7 
 
 		 381 aa  157  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5279  thiolase  33.43 
 
 		 385 aa  156  5.0000000000000005e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5302  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.46 
 
 		 388 aa  156  5.0000000000000005e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.739228 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5006  acetyl-CoA acetyltransferase  32.48 
 
 		 382 aa  155  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  0.11432 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2151  nonspecific lipid-transfer protein  27.79 
 
 		 403 aa  153  4e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0342  thiolase  35.19 
 
 		 381 aa  153  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0031  hypothetical protein  32.57 
 
 		 402 aa  152  7e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.761011  normal  0.262129 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0041  hypothetical protein  32.57 
 
 		 402 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0050  hypothetical protein  32.57 
 
 		 402 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0851197  normal  0.0510911 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1803  putative nonspecific lipid-transfer protein  33.25 
 
 		 389 aa  151  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.851643 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5111  thiolase  32.85 
 
 		 390 aa  150  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000299159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2839  hypothetical protein  34.71 
 
 		 388 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00983373  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4269  hypothetical protein  33.43 
 
 		 402 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.340919  normal  0.522568 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4071  thiolase  32.59 
 
 		 382 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3512  thiolase  31.56 
 
 		 390 aa  147  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6845  thiolase  32.17 
 
 		 383 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7411  acetyl-CoA acetyltransferase  33.62 
 
 		 383 aa  147  4.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3115  acetyl-CoA acetyltransferase  32.34 
 
 		 382 aa  146  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119662  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3607  acetyl-CoA acetyltransferase  32.03 
 
 		 382 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.241671  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5095  acetyl-CoA acetyltransferase  32.83 
 
 		 395 aa  145  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.926475 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3829  acetyl-CoA acetyltransferase  33.33 
 
 		 388 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.401188  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2377  hypothetical protein  32.94 
 
 		 402 aa  144  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.494222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4021  putative nonspecific lipid-transfer protein  31.12 
 
 		 378 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4625  thiolase  32.18 
 
 		 390 aa  144  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0129  thiolase  31.47 
 
 		 402 aa  144  4e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0581  hypothetical protein  29.03 
 
 		 395 aa  143  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0835832  normal  0.505436 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2663  acetyl-CoA acetyltransferase  30.91 
 
 		 385 aa  143  6e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0177  thiolase  32.06 
 
 		 403 aa  143  6e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0860  putative thiolase  31.86 
 
 		 384 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016172  normal  0.461503 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0316  acetyl-CoA C-acetyltransferase (acetoacetyl-CoA thiolase) (AcaB-6)  28.97 
 
 		 380 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2350  acetyl-CoA acetyltransferase  33.7 
 
 		 382 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.731467  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3651  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  36.26 
 
 		 387 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.48348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1757  acetyl-CoA acetyltransferase  34.19 
 
 		 391 aa  140  3.9999999999999997e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439431  normal  0.143058 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4413  acetyl-CoA acetyltransferase  31.97 
 
 		 389 aa  139  6e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00900083  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4152  acetyl-CoA acetyltransferase  32.49 
 
 		 389 aa  139  7e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500938  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1502  acetyl-CoA acetyltransferase  31.48 
 
 		 390 aa  139  7e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2935  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  32.36 
 
 		 383 aa  139  7.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.220087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4266  hypothetical protein  32.31 
 
 		 381 aa  139  7.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.804759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0147  thiolase  31.18 
 
 		 402 aa  139  8.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1902  hypothetical protein  28.97 
 
 		 396 aa  138  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.986081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0511  lipid-transfer protein  31.97 
 
 		 389 aa  139  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3401  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  31.07 
 
 		 380 aa  137  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0771846 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1879  putative lipid transfer protein  29.81 
 
 		 379 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0403443 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3874  hypothetical protein  29.07 
 
 		 393 aa  137  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4565  acetyl-CoA acetyltransferase  32.65 
 
 		 388 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153409  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2093  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.98 
 
 		 385 aa  136  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3588  thiolase  30.92 
 
 		 379 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5499  acetyl-CoA acetyltransferase  32.41 
 
 		 391 aa  135  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2931  hypothetical protein  29.03 
 
 		 379 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2277  thiolase  33.01 
 
 		 383 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.573629 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5776  thiolase  31.01 
 
 		 393 aa  134  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6832  DitF protein  32.39 
 
 		 396 aa  134  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1978  hypothetical protein  29.53 
 
 		 379 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960116  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4180  putative acetyl-CoA C-acetyltransferase  30.38 
 
 		 394 aa  133  6e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.785914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4055  putative nonspecific lipid-transfer protein  31.06 
 
 		 397 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0205444  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0352  hypothetical protein  33.99 
 
 		 386 aa  130  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000477716  decreased coverage  0.0000013738 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0899  lipid-transfer protein  32.29 
 
 		 389 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3805  acetyl-CoA acetyltransferase  30.1 
 
 		 388 aa  129  6e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4368  thiolase  31.69 
 
 		 383 aa  130  6e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.739547  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1686  Acetyl-CoA acetyltransferase-like  29.5 
 
 		 379 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0569144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1484  hypothetical protein  32.14 
 
 		 389 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185234  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4787  acetyl-CoA acetyltransferase  31.81 
 
 		 387 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0607631  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3601  hypothetical protein  30.61 
 
 		 397 aa  127  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0450403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1074  thiolase  32.1 
 
 		 384 aa  126  7e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1513  lipid-transfer protein  30.08 
 
 		 385 aa  125  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0887  lipid-transfer protein  29.82 
 
 		 390 aa  125  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4311  hypothetical protein  32.07 
 
 		 389 aa  125  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5057  lipid-transfer protein  29.29 
 
 		 385 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0063  lipid-transfer protein  33.16 
 
 		 390 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51190  thiolase  30.6 
 
 		 383 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113364 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1008  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  29.59 
 
 		 385 aa  124  2e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.011821 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5253  lipid-transfer protein  29.55 
 
 		 385 aa  124  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509405 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0855  acetyl-CoA C-acetyltransferase (acetoacetyl-CoA thiolase) (AcaB-10)  30.46 
 
 		 385 aa  124  4e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0722065  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4672  lipid-transfer protein  28.76 
 
 		 385 aa  123  5e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.495157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4758  lipid-transfer protein  28.76 
 
 		 385 aa  123  5e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0844  thiolase  31.33 
 
 		 384 aa  122  7e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4108  diterpenoid dioxygenase  29.32 
 
 		 397 aa  122  9e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.742638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2786  lipid-transfer protein  30.56 
 
 		 394 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3479  lipid-transfer protein  30.16 
 
 		 391 aa  119  7e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4716  DitF protein  31.59 
 
 		 453 aa  119  7e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0906  hypothetical protein  30.13 
 
 		 394 aa  119  9e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00747371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0891  thiolase  28.29 
 
 		 405 aa  119  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.849216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0900  hypothetical protein  30.17 
 
 		 389 aa  119  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.049177  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3858  hypothetical protein  30.08 
 
 		 390 aa  118  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.198117  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8761  lipid-transfer protein  34.8 
 
 		 385 aa  117  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.134204 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5454  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.27 
 
 		 388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.839799  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>