More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3277 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_3226  hypothetical protein  100 
 
 		 388 aa  787    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3215  hypothetical protein  100 
 
 		 388 aa  787    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3277  hypothetical protein  100 
 
 		 388 aa  787    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0860  putative thiolase  38.52 
 
 		 384 aa  225  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016172  normal  0.461503 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6629  thiolase  38.12 
 
 		 381 aa  203  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  36.72 
 
 		 388 aa  202  9e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5279  thiolase  36.32 
 
 		 385 aa  195  9e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2277  thiolase  34.45 
 
 		 383 aa  190  4e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.573629 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2151  nonspecific lipid-transfer protein  32.08 
 
 		 403 aa  190  5e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2581  thiolase  34.29 
 
 		 385 aa  186  5e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5499  acetyl-CoA acetyltransferase  35.46 
 
 		 391 aa  186  7e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2105  thiolase  35.07 
 
 		 404 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0715913  normal  0.0186682 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5111  thiolase  34.12 
 
 		 390 aa  184  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000299159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  34.96 
 
 		 380 aa  183  4.0000000000000006e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1757  acetyl-CoA acetyltransferase  34.79 
 
 		 391 aa  182  6e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439431  normal  0.143058 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6845  thiolase  33.86 
 
 		 383 aa  182  7e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5776  thiolase  36.91 
 
 		 393 aa  182  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3314  thiolase  36.41 
 
 		 404 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4071  thiolase  35.06 
 
 		 382 aa  181  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3322  thiolase  36.55 
 
 		 383 aa  181  2.9999999999999997e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00152041  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3972  thiolase  36.55 
 
 		 383 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.330404 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4368  thiolase  33.86 
 
 		 383 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.739547  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3805  acetyl-CoA acetyltransferase  34.83 
 
 		 388 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0147  thiolase  35.86 
 
 		 402 aa  176  6e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4625  thiolase  34.81 
 
 		 390 aa  175  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51190  thiolase  33.07 
 
 		 383 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113364 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1978  hypothetical protein  33.76 
 
 		 379 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960116  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3567  putative thiolase  33.16 
 
 		 378 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.32 
 
 		 382 aa  175  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0342  thiolase  35.05 
 
 		 381 aa  171  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3512  thiolase  33.25 
 
 		 390 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2931  hypothetical protein  33.33 
 
 		 379 aa  170  4e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0129  thiolase  35.34 
 
 		 402 aa  170  5e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5302  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.64 
 
 		 388 aa  169  6e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.739228 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3588  thiolase  32.99 
 
 		 379 aa  169  6e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1074  thiolase  34.47 
 
 		 384 aa  169  7e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1879  putative lipid transfer protein  32.99 
 
 		 379 aa  169  7e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0403443 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4152  acetyl-CoA acetyltransferase  35.96 
 
 		 389 aa  168  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500938  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  36.55 
 
 		 383 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2935  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  36.96 
 
 		 383 aa  167  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.220087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3829  acetyl-CoA acetyltransferase  35.43 
 
 		 388 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.401188  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3952  putative thiolase  34.48 
 
 		 378 aa  166  8e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.130005  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4413  acetyl-CoA acetyltransferase  35.36 
 
 		 389 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00900083  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5255  thiolase  33.59 
 
 		 389 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0177  thiolase  35.08 
 
 		 403 aa  164  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1833  putative thiolase  32.91 
 
 		 405 aa  164  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0913085  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2350  acetyl-CoA acetyltransferase  35.97 
 
 		 382 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.731467  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2744  putative thiolase/acetyl-CoA acetyltransferase, PaaJ-like  30.77 
 
 		 406 aa  162  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0906041 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5006  acetyl-CoA acetyltransferase  34.68 
 
 		 382 aa  161  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  0.11432 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3115  acetyl-CoA acetyltransferase  34.88 
 
 		 382 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119662  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1502  acetyl-CoA acetyltransferase  33.88 
 
 		 390 aa  160  3e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1803  putative nonspecific lipid-transfer protein  31.17 
 
 		 389 aa  158  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.851643 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3607  acetyl-CoA acetyltransferase  34.33 
 
 		 382 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.241671  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4565  acetyl-CoA acetyltransferase  33.51 
 
 		 388 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153409  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7490  Acetyl-CoA acetyltransferase-like  32.1 
 
 		 403 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.551931 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7411  acetyl-CoA acetyltransferase  34.56 
 
 		 383 aa  155  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4787  acetyl-CoA acetyltransferase  33.25 
 
 		 387 aa  153  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0607631  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4180  putative acetyl-CoA C-acetyltransferase  32.41 
 
 		 394 aa  152  8e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.785914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5454  putative nonspecific lipid-transfer protein  32.36 
 
 		 388 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.839799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5851  putative nonspecific lipid-transfer protein  32.36 
 
 		 388 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0314395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2663  acetyl-CoA acetyltransferase  35.47 
 
 		 385 aa  151  2e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0031  hypothetical protein  31.84 
 
 		 402 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.761011  normal  0.262129 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3483  Thiolase  31.27 
 
 		 383 aa  150  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1686  Acetyl-CoA acetyltransferase-like  32.73 
 
 		 379 aa  149  9e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0569144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3401  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  34.36 
 
 		 380 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0771846 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0041  hypothetical protein  31.84 
 
 		 402 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0050  hypothetical protein  31.84 
 
 		 402 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0851197  normal  0.0510911 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1670  putative nonspecific lipid-transfer protein  32.63 
 
 		 388 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1643  putative nonspecific lipid-transfer protein  32.63 
 
 		 388 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1694  putative nonspecific lipid-transfer protein  32.63 
 
 		 388 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0554  putative nonspecific lipid-transfer protein  32.36 
 
 		 388 aa  145  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0636  putative nonspecific lipid-transfer protein  32.36 
 
 		 388 aa  145  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.962067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  29.61 
 
 		 390 aa  144  2e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5643  putative nonspecific lipid-transfer protein  32.1 
 
 		 388 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0529  putative nonspecific lipid-transfer protein  32.1 
 
 		 388 aa  142  7e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.384509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0887  lipid-transfer protein  33.6 
 
 		 390 aa  142  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5095  acetyl-CoA acetyltransferase  34.03 
 
 		 395 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.926475 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1309  acetyl-CoA acetyltransferase  33.33 
 
 		 387 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0879061 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  29.95 
 
 		 388 aa  139  1e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13573  lipid-transfer protein  32.97 
 
 		 386 aa  138  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000077821 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4269  hypothetical protein  31.17 
 
 		 402 aa  137  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.340919  normal  0.522568 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  30.73 
 
 		 386 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0511  lipid-transfer protein  32.34 
 
 		 389 aa  136  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3858  hypothetical protein  33.16 
 
 		 390 aa  136  7.000000000000001e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.198117  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  30.91 
 
 		 390 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4311  hypothetical protein  30.05 
 
 		 389 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2839  hypothetical protein  30.94 
 
 		 388 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00983373  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2141  lipid-transfer protein  31.78 
 
 		 392 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0844  thiolase  36.61 
 
 		 384 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3479  lipid-transfer protein  33.43 
 
 		 391 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  30.18 
 
 		 387 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0899  lipid-transfer protein  30.21 
 
 		 389 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  30.14 
 
 		 387 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8194  lipid-transfer protein  33.07 
 
 		 390 aa  127  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2103  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  31.54 
 
 		 384 aa  125  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.655505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  28.57 
 
 		 387 aa  125  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2377  hypothetical protein  31.92 
 
 		 402 aa  125  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.494222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  26.82 
 
 		 388 aa  125  1e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4069  putative thiolase  33.51 
 
 		 372 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.655327  normal  0.671191 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2016  lipid-transfer protein  30 
 
 		 388 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.314529  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>