More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4368 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4368  thiolase  100 
 
 
383 aa  771    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.739547  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51190  thiolase  94.78 
 
 
383 aa  739    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000113364 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5279  thiolase  67.28 
 
 
385 aa  517  1.0000000000000001e-145  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3512  thiolase  64.6 
 
 
390 aa  510  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6845  thiolase  63.71 
 
 
383 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0147  thiolase  63.64 
 
 
402 aa  473  1e-132  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5776  thiolase  64.77 
 
 
393 aa  472  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0129  thiolase  63.64 
 
 
402 aa  470  1.0000000000000001e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0177  thiolase  62.86 
 
 
403 aa  464  9.999999999999999e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2277  thiolase  60.05 
 
 
383 aa  454  1e-127  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.573629 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2581  thiolase  60.32 
 
 
385 aa  452  1.0000000000000001e-126  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0342  thiolase  61.46 
 
 
381 aa  441  9.999999999999999e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5111  thiolase  59.54 
 
 
390 aa  431  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000299159  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1074  thiolase  57.63 
 
 
384 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4625  thiolase  55 
 
 
390 aa  390  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5255  thiolase  51.09 
 
 
389 aa  348  1e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  46.11 
 
 
382 aa  325  9e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6629  thiolase  50.53 
 
 
381 aa  324  2e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4071  thiolase  48.4 
 
 
382 aa  315  7e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  47.4 
 
 
383 aa  315  8e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0844  thiolase  48.95 
 
 
384 aa  297  2e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  42.74 
 
 
380 aa  289  5.0000000000000004e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1978  hypothetical protein  41.8 
 
 
379 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960116  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  43.86 
 
 
388 aa  275  7e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2931  hypothetical protein  41.27 
 
 
379 aa  273  3e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2935  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  43.54 
 
 
383 aa  271  1e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.220087  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3588  thiolase  41.01 
 
 
379 aa  269  7e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1879  putative lipid transfer protein  40.48 
 
 
379 aa  265  8.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0403443 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5499  acetyl-CoA acetyltransferase  43.31 
 
 
391 aa  265  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1686  Acetyl-CoA acetyltransferase-like  41.76 
 
 
379 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0569144  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3829  acetyl-CoA acetyltransferase  41.99 
 
 
388 aa  258  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.401188  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4413  acetyl-CoA acetyltransferase  41.91 
 
 
389 aa  253  6e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00900083  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1757  acetyl-CoA acetyltransferase  41.03 
 
 
391 aa  251  2e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439431  normal  0.143058 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4565  acetyl-CoA acetyltransferase  41.73 
 
 
388 aa  248  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153409  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3401  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  41.24 
 
 
380 aa  248  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0771846 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4152  acetyl-CoA acetyltransferase  40.69 
 
 
389 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500938  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3805  acetyl-CoA acetyltransferase  40.85 
 
 
388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7411  acetyl-CoA acetyltransferase  43.49 
 
 
383 aa  243  3e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3607  acetyl-CoA acetyltransferase  42.05 
 
 
382 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.241671  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5006  acetyl-CoA acetyltransferase  41.08 
 
 
382 aa  241  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  0.11432 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1502  acetyl-CoA acetyltransferase  40.59 
 
 
390 aa  239  9e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3115  acetyl-CoA acetyltransferase  41.51 
 
 
382 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119662  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2663  acetyl-CoA acetyltransferase  41.55 
 
 
385 aa  237  3e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4787  acetyl-CoA acetyltransferase  43.12 
 
 
387 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0607631  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0860  putative thiolase  38.62 
 
 
384 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016172  normal  0.461503 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2839  hypothetical protein  39.68 
 
 
388 aa  232  9e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00983373  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2350  acetyl-CoA acetyltransferase  41.78 
 
 
382 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.731467  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4266  hypothetical protein  36.94 
 
 
381 aa  210  3e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.804759  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5095  acetyl-CoA acetyltransferase  40.36 
 
 
395 aa  209  5e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.926475 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1484  hypothetical protein  41.24 
 
 
389 aa  207  3e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185234  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5302  putative nonspecific lipid-transfer protein  39.42 
 
 
388 aa  200  3.9999999999999996e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.739228 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4311  hypothetical protein  36.76 
 
 
389 aa  199  6e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3567  putative thiolase  36.44 
 
 
378 aa  199  7.999999999999999e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1803  putative nonspecific lipid-transfer protein  38.36 
 
 
389 aa  197  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.851643 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3651  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  37.95 
 
 
387 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.48348  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  36.36 
 
 
386 aa  194  2e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2093  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  38.18 
 
 
385 aa  191  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773617  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4716  DitF protein  39.23 
 
 
453 aa  191  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3310  hypothetical protein  37.63 
 
 
393 aa  190  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.408434 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0581  hypothetical protein  36.05 
 
 
395 aa  190  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0835832  normal  0.505436 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  34.27 
 
 
387 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  33.16 
 
 
388 aa  186  5e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  34.99 
 
 
390 aa  186  8e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2103  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  36.94 
 
 
384 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.655505  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0352  hypothetical protein  33.96 
 
 
386 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000477716  decreased coverage  0.0000013738 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1008  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  34.79 
 
 
385 aa  184  2.0000000000000003e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.011821 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1902  hypothetical protein  34.11 
 
 
396 aa  184  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.986081  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  33.33 
 
 
390 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  34.11 
 
 
388 aa  182  1e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4180  putative acetyl-CoA C-acetyltransferase  32.45 
 
 
394 aa  181  2.9999999999999997e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.785914  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3314  thiolase  35.54 
 
 
404 aa  180  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  33.59 
 
 
388 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4021  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.06 
 
 
378 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  34.11 
 
 
387 aa  178  2e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2786  lipid-transfer protein  35.42 
 
 
394 aa  176  5e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2105  thiolase  34.56 
 
 
404 aa  176  6e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0715913  normal  0.0186682 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2744  putative thiolase/acetyl-CoA acetyltransferase, PaaJ-like  33.83 
 
 
406 aa  176  6e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0906041 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3972  thiolase  36.07 
 
 
383 aa  176  6e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.330404 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8761  lipid-transfer protein  36.83 
 
 
385 aa  176  8e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.134204 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3322  thiolase  35.81 
 
 
383 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00152041  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0435  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.75 
 
 
387 aa  173  5e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0887  lipid-transfer protein  34.52 
 
 
390 aa  171  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0063  lipid-transfer protein  35.99 
 
 
390 aa  171  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4492  hypothetical protein  35.03 
 
 
385 aa  168  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  32.99 
 
 
387 aa  168  1e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4108  diterpenoid dioxygenase  32.8 
 
 
397 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.742638  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3692  hypothetical protein  35.79 
 
 
550 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3705  hypothetical protein  35.88 
 
 
550 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724372  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4171  hypothetical protein  37.05 
 
 
548 aa  168  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3765  hypothetical protein  35.79 
 
 
550 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4055  putative nonspecific lipid-transfer protein  37.22 
 
 
397 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0205444  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3226  hypothetical protein  39.47 
 
 
388 aa  166  9e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3215  hypothetical protein  39.47 
 
 
388 aa  166  9e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3277  hypothetical protein  39.47 
 
 
388 aa  166  9e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2483  hypothetical protein  35.55 
 
 
548 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.207424 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0316  acetyl-CoA C-acetyltransferase (acetoacetyl-CoA thiolase) (AcaB-6)  30.77 
 
 
380 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0031  hypothetical protein  33 
 
 
402 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.761011  normal  0.262129 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0041  hypothetical protein  33 
 
 
402 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0050  hypothetical protein  33 
 
 
402 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0851197  normal  0.0510911 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2151  nonspecific lipid-transfer protein  30.4 
 
 
403 aa  162  6e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>