More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3588 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3588  thiolase  100 
 
 		 379 aa  786    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1686  Acetyl-CoA acetyltransferase-like  89.42 
 
 		 379 aa  684    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0569144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1879  putative lipid transfer protein  96.31 
 
 		 379 aa  761    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0403443 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2931  hypothetical protein  91.03 
 
 		 379 aa  718    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1978  hypothetical protein  95.78 
 
 		 379 aa  754    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960116  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  75.93 
 
 		 380 aa  600  1e-170  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3401  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  69.5 
 
 		 380 aa  517  1.0000000000000001e-145  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0771846 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2935  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  58.49 
 
 		 383 aa  469  1.0000000000000001e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.220087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5255  thiolase  42.31 
 
 		 389 aa  289  5.0000000000000004e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3512  thiolase  42.63 
 
 		 390 aa  282  8.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5776  thiolase  43.68 
 
 		 393 aa  281  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1074  thiolase  43.01 
 
 		 384 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5279  thiolase  41.8 
 
 		 385 aa  278  1e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  44.09 
 
 		 383 aa  276  6e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6845  thiolase  39.53 
 
 		 383 aa  276  6e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0147  thiolase  43.42 
 
 		 402 aa  275  8e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0129  thiolase  43.16 
 
 		 402 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6629  thiolase  41.99 
 
 		 381 aa  271  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4625  thiolase  39.74 
 
 		 390 aa  271  2e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  40.9 
 
 		 382 aa  271  2e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4368  thiolase  41.01 
 
 		 383 aa  269  7e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.739547  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51190  thiolase  41.01 
 
 		 383 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113364 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2277  thiolase  40.05 
 
 		 383 aa  267  2e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.573629 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0342  thiolase  40.58 
 
 		 381 aa  265  1e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0177  thiolase  41.58 
 
 		 403 aa  264  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5111  thiolase  42.21 
 
 		 390 aa  263  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000299159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2581  thiolase  37.01 
 
 		 385 aa  253  4.0000000000000004e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4071  thiolase  41.49 
 
 		 382 aa  246  6e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  39.38 
 
 		 388 aa  243  5e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5006  acetyl-CoA acetyltransferase  41.81 
 
 		 382 aa  238  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  0.11432 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3829  acetyl-CoA acetyltransferase  40.15 
 
 		 388 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.401188  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0844  thiolase  40.74 
 
 		 384 aa  231  1e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3607  acetyl-CoA acetyltransferase  41.41 
 
 		 382 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.241671  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4413  acetyl-CoA acetyltransferase  39.54 
 
 		 389 aa  229  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00900083  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3115  acetyl-CoA acetyltransferase  40.44 
 
 		 382 aa  229  8e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119662  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5499  acetyl-CoA acetyltransferase  38.58 
 
 		 391 aa  228  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4152  acetyl-CoA acetyltransferase  39.52 
 
 		 389 aa  226  4e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500938  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1757  acetyl-CoA acetyltransferase  38.98 
 
 		 391 aa  223  4e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439431  normal  0.143058 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0860  putative thiolase  37.7 
 
 		 384 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016172  normal  0.461503 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4565  acetyl-CoA acetyltransferase  40.15 
 
 		 388 aa  218  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153409  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2350  acetyl-CoA acetyltransferase  42.25 
 
 		 382 aa  215  9e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.731467  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3805  acetyl-CoA acetyltransferase  38.81 
 
 		 388 aa  215  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1502  acetyl-CoA acetyltransferase  39.78 
 
 		 390 aa  211  2e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2663  acetyl-CoA acetyltransferase  40 
 
 		 385 aa  210  3e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4787  acetyl-CoA acetyltransferase  39.08 
 
 		 387 aa  206  7e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0607631  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7411  acetyl-CoA acetyltransferase  38.28 
 
 		 383 aa  192  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5095  acetyl-CoA acetyltransferase  36.07 
 
 		 395 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.926475 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2093  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  38.01 
 
 		 385 aa  183  5.0000000000000004e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1803  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.36 
 
 		 389 aa  182  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.851643 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5553  hypothetical protein  33.06 
 
 		 383 aa  181  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5302  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.36 
 
 		 388 aa  177  4e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.739228 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13573  lipid-transfer protein  32.72 
 
 		 386 aa  176  6e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000077821 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2839  hypothetical protein  31.59 
 
 		 388 aa  175  9e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00983373  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3479  lipid-transfer protein  35.34 
 
 		 391 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3651  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  35.89 
 
 		 387 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.48348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4266  hypothetical protein  32.72 
 
 		 381 aa  172  6.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.804759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0352  hypothetical protein  32.97 
 
 		 386 aa  172  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000477716  decreased coverage  0.0000013738 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  31.7 
 
 		 387 aa  168  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2744  putative thiolase/acetyl-CoA acetyltransferase, PaaJ-like  32.75 
 
 		 406 aa  168  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0906041 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1835  lipid-transfer protein  30.77 
 
 		 381 aa  167  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.722448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1484  hypothetical protein  37.66 
 
 		 389 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185234  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2103  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  31.68 
 
 		 384 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.655505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  31.88 
 
 		 387 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2786  lipid-transfer protein  32.71 
 
 		 394 aa  163  5.0000000000000005e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0511  lipid-transfer protein  32.77 
 
 		 389 aa  162  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0887  lipid-transfer protein  32.54 
 
 		 390 aa  160  4e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3540  hypothetical protein  31.55 
 
 		 392 aa  159  7e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8194  lipid-transfer protein  31.58 
 
 		 390 aa  158  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  32.91 
 
 		 386 aa  158  1e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  31.68 
 
 		 388 aa  157  2e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5057  lipid-transfer protein  30.29 
 
 		 385 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4758  lipid-transfer protein  30.03 
 
 		 385 aa  155  8e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4672  lipid-transfer protein  30.03 
 
 		 385 aa  155  8e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.495157  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2361  lipid-transfer protein  32.53 
 
 		 394 aa  155  9e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5253  lipid-transfer protein  30.4 
 
 		 385 aa  155  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509405 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3277  hypothetical protein  32.99 
 
 		 388 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3215  hypothetical protein  32.99 
 
 		 388 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3226  hypothetical protein  32.99 
 
 		 388 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0581  hypothetical protein  30.49 
 
 		 395 aa  152  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0835832  normal  0.505436 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1971  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  32.49 
 
 		 387 aa  152  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2367  hypothetical protein  32.74 
 
 		 393 aa  151  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.351877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8761  lipid-transfer protein  32.08 
 
 		 385 aa  151  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.134204 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4021  putative nonspecific lipid-transfer protein  31.01 
 
 		 378 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0859  thiolase  29.59 
 
 		 389 aa  150  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.823302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  30.05 
 
 		 390 aa  149  8e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3858  hypothetical protein  31.27 
 
 		 390 aa  149  9e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.198117  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1513  lipid-transfer protein  29.11 
 
 		 385 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1902  hypothetical protein  29.2 
 
 		 396 aa  147  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.986081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2141  lipid-transfer protein  29.89 
 
 		 392 aa  147  3e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5282  hypothetical protein  32.71 
 
 		 390 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4180  putative acetyl-CoA C-acetyltransferase  29.05 
 
 		 394 aa  147  4.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.785914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2621  lipid-transfer protein  31.72 
 
 		 395 aa  146  5e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000528338  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1026  hypothetical protein  33 
 
 		 396 aa  146  7.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.651118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4311  hypothetical protein  31.37 
 
 		 389 aa  146  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  31.86 
 
 		 388 aa  145  1e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2016  lipid-transfer protein  31.51 
 
 		 388 aa  144  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.314529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0031  hypothetical protein  29.6 
 
 		 402 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.761011  normal  0.262129 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1309  acetyl-CoA acetyltransferase  28.01 
 
 		 387 aa  144  2e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0879061 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0063  lipid-transfer protein  35.62 
 
 		 390 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2151  nonspecific lipid-transfer protein  29.78 
 
 		 403 aa  143  4e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>