More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0129 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_0129  thiolase  100 
 
 		 402 aa  819    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0177  thiolase  94.26 
 
 		 403 aa  754    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0147  thiolase  99 
 
 		 402 aa  810    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5776  thiolase  77 
 
 		 393 aa  599  1e-170  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3512  thiolase  70.91 
 
 		 390 aa  571  1.0000000000000001e-162  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5279  thiolase  63.9 
 
 		 385 aa  485  1e-136  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4368  thiolase  63.64 
 
 		 383 aa  480  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.739547  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51190  thiolase  63.12 
 
 		 383 aa  481  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113364 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5111  thiolase  61.44 
 
 		 390 aa  458  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000299159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6845  thiolase  59.74 
 
 		 383 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2277  thiolase  56.77 
 
 		 383 aa  429  1e-119  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.573629 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2581  thiolase  57.81 
 
 		 385 aa  431  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0342  thiolase  59.42 
 
 		 381 aa  414  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4625  thiolase  55.61 
 
 		 390 aa  407  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1074  thiolase  58.27 
 
 		 384 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5255  thiolase  49.87 
 
 		 389 aa  344  2e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6629  thiolase  51.45 
 
 		 381 aa  329  5.0000000000000004e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  49.86 
 
 		 382 aa  317  3e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4071  thiolase  49.74 
 
 		 382 aa  312  6.999999999999999e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  45.14 
 
 		 380 aa  307  2.0000000000000002e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  47.4 
 
 		 383 aa  301  1e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0844  thiolase  50.66 
 
 		 384 aa  300  4e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1978  hypothetical protein  43.68 
 
 		 379 aa  292  6e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960116  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  44.91 
 
 		 388 aa  291  2e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2931  hypothetical protein  43.42 
 
 		 379 aa  290  3e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2935  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  46.42 
 
 		 383 aa  290  4e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.220087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3588  thiolase  43.16 
 
 		 379 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1879  putative lipid transfer protein  43.68 
 
 		 379 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0403443 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3829  acetyl-CoA acetyltransferase  42.71 
 
 		 388 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.401188  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5499  acetyl-CoA acetyltransferase  45.29 
 
 		 391 aa  272  6e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4413  acetyl-CoA acetyltransferase  42.71 
 
 		 389 aa  268  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00900083  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4565  acetyl-CoA acetyltransferase  43.39 
 
 		 388 aa  267  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153409  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1686  Acetyl-CoA acetyltransferase-like  42.82 
 
 		 379 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0569144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3805  acetyl-CoA acetyltransferase  41.91 
 
 		 388 aa  264  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3401  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  43.04 
 
 		 380 aa  263  3e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0771846 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4152  acetyl-CoA acetyltransferase  41.38 
 
 		 389 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500938  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0860  putative thiolase  40.94 
 
 		 384 aa  259  8e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016172  normal  0.461503 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5006  acetyl-CoA acetyltransferase  40.26 
 
 		 382 aa  258  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  0.11432 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3607  acetyl-CoA acetyltransferase  41.71 
 
 		 382 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.241671  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7411  acetyl-CoA acetyltransferase  44.5 
 
 		 383 aa  256  4e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4787  acetyl-CoA acetyltransferase  43.49 
 
 		 387 aa  250  4e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0607631  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1757  acetyl-CoA acetyltransferase  40.76 
 
 		 391 aa  249  4e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439431  normal  0.143058 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3115  acetyl-CoA acetyltransferase  40.41 
 
 		 382 aa  249  5e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119662  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2350  acetyl-CoA acetyltransferase  41.19 
 
 		 382 aa  247  3e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.731467  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1502  acetyl-CoA acetyltransferase  41.93 
 
 		 390 aa  246  4e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2663  acetyl-CoA acetyltransferase  42.97 
 
 		 385 aa  245  9.999999999999999e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5095  acetyl-CoA acetyltransferase  40.36 
 
 		 395 aa  239  9e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.926475 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2839  hypothetical protein  40.1 
 
 		 388 aa  223  4e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00983373  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4266  hypothetical protein  37.21 
 
 		 381 aa  214  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.804759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3567  putative thiolase  37.8 
 
 		 378 aa  212  9e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4311  hypothetical protein  40.28 
 
 		 389 aa  208  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3651  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  38.6 
 
 		 387 aa  205  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.48348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3314  thiolase  38.21 
 
 		 404 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2093  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  37.89 
 
 		 385 aa  199  7.999999999999999e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5302  putative nonspecific lipid-transfer protein  38.82 
 
 		 388 aa  199  9e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.739228 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1484  hypothetical protein  48.36 
 
 		 389 aa  196  8.000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185234  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2105  thiolase  37.27 
 
 		 404 aa  192  9e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0715913  normal  0.0186682 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0887  lipid-transfer protein  35.79 
 
 		 390 aa  191  2.9999999999999997e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1803  putative nonspecific lipid-transfer protein  37.73 
 
 		 389 aa  189  9e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.851643 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1902  hypothetical protein  34.87 
 
 		 396 aa  187  4e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.986081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0581  hypothetical protein  35.58 
 
 		 395 aa  186  6e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0835832  normal  0.505436 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4021  putative nonspecific lipid-transfer protein  36.07 
 
 		 378 aa  186  9e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0352  hypothetical protein  37.16 
 
 		 386 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000477716  decreased coverage  0.0000013738 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3972  thiolase  36.48 
 
 		 383 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.330404 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3705  hypothetical protein  37.43 
 
 		 550 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0063  lipid-transfer protein  35.32 
 
 		 390 aa  184  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3322  thiolase  36.22 
 
 		 383 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00152041  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4171  hypothetical protein  37.59 
 
 		 548 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2151  nonspecific lipid-transfer protein  34 
 
 		 403 aa  184  3e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2483  hypothetical protein  38.14 
 
 		 548 aa  184  3e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.207424 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3692  hypothetical protein  37.17 
 
 		 550 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3765  hypothetical protein  37.17 
 
 		 550 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8761  lipid-transfer protein  36.46 
 
 		 385 aa  183  5.0000000000000004e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.134204 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2744  putative thiolase/acetyl-CoA acetyltransferase, PaaJ-like  33.75 
 
 		 406 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0906041 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2103  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  37.5 
 
 		 384 aa  182  9.000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.655505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2786  lipid-transfer protein  37.12 
 
 		 394 aa  181  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4716  DitF protein  38.63 
 
 		 453 aa  180  4e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3858  hypothetical protein  34.03 
 
 		 390 aa  180  4e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.198117  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0031  hypothetical protein  33.58 
 
 		 402 aa  180  4e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.761011  normal  0.262129 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3310  hypothetical protein  37.06 
 
 		 393 aa  179  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.408434 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0041  hypothetical protein  33.58 
 
 		 402 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0050  hypothetical protein  33.58 
 
 		 402 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0851197  normal  0.0510911 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2361  lipid-transfer protein  38.71 
 
 		 394 aa  176  5e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3952  putative thiolase  37.8 
 
 		 378 aa  176  8e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.130005  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  33.16 
 
 		 386 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5454  putative nonspecific lipid-transfer protein  37.6 
 
 		 388 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.839799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5851  putative nonspecific lipid-transfer protein  37.6 
 
 		 388 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0314395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6832  DitF protein  35.75 
 
 		 396 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  30.33 
 
 		 388 aa  174  2.9999999999999996e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4323  hypothetical protein  33.25 
 
 		 541 aa  174  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.51495 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  31.71 
 
 		 388 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4055  putative nonspecific lipid-transfer protein  36.51 
 
 		 397 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0205444  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  33.85 
 
 		 390 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  39.67 
 
 		 387 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3479  lipid-transfer protein  35.16 
 
 		 391 aa  173  5e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13573  lipid-transfer protein  35.6 
 
 		 386 aa  172  1e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000077821 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1833  putative thiolase  34.25 
 
 		 405 aa  171  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0913085  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1513  lipid-transfer protein  34.62 
 
 		 385 aa  171  3e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1643  putative nonspecific lipid-transfer protein  37.33 
 
 		 388 aa  170  4e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1670  putative nonspecific lipid-transfer protein  37.33 
 
 		 388 aa  170  4e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>