More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6629 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6629  thiolase  100 
 
 		 381 aa  755    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4071  thiolase  73.16 
 
 		 382 aa  525  1e-148  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3512  thiolase  50.53 
 
 		 390 aa  358  9.999999999999999e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5255  thiolase  53.15 
 
 		 389 aa  356  2.9999999999999997e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5279  thiolase  52.91 
 
 		 385 aa  353  2e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5776  thiolase  55.07 
 
 		 393 aa  346  5e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5111  thiolase  51.31 
 
 		 390 aa  343  2e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000299159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51190  thiolase  50.53 
 
 		 383 aa  343  4e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113364 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0147  thiolase  51.72 
 
 		 402 aa  340  2e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6845  thiolase  50.41 
 
 		 383 aa  339  4e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0177  thiolase  50.79 
 
 		 403 aa  337  9.999999999999999e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2581  thiolase  50.13 
 
 		 385 aa  337  9.999999999999999e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4368  thiolase  50.53 
 
 		 383 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.739547  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0129  thiolase  51.45 
 
 		 402 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1074  thiolase  52.79 
 
 		 384 aa  335  7e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4625  thiolase  49.47 
 
 		 390 aa  329  4e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0844  thiolase  51.83 
 
 		 384 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2277  thiolase  49.47 
 
 		 383 aa  326  5e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.573629 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0342  thiolase  51.2 
 
 		 381 aa  322  6e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  50.39 
 
 		 383 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  48.55 
 
 		 382 aa  311  7.999999999999999e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  43.92 
 
 		 380 aa  298  1e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2931  hypothetical protein  42.52 
 
 		 379 aa  293  3e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1978  hypothetical protein  42.26 
 
 		 379 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960116  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  45.05 
 
 		 388 aa  285  1.0000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2935  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  46.3 
 
 		 383 aa  284  2.0000000000000002e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.220087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3588  thiolase  41.99 
 
 		 379 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1879  putative lipid transfer protein  41.73 
 
 		 379 aa  282  7.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0403443 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1686  Acetyl-CoA acetyltransferase-like  43.83 
 
 		 379 aa  273  3e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0569144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3401  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  45.36 
 
 		 380 aa  273  5.000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0771846 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0860  putative thiolase  43.34 
 
 		 384 aa  264  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016172  normal  0.461503 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4413  acetyl-CoA acetyltransferase  46.07 
 
 		 389 aa  262  6.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00900083  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3829  acetyl-CoA acetyltransferase  44.65 
 
 		 388 aa  259  4e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.401188  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7411  acetyl-CoA acetyltransferase  45.26 
 
 		 383 aa  256  4e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5499  acetyl-CoA acetyltransferase  44.35 
 
 		 391 aa  256  6e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5006  acetyl-CoA acetyltransferase  43.22 
 
 		 382 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  0.11432 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4152  acetyl-CoA acetyltransferase  44.44 
 
 		 389 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500938  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3115  acetyl-CoA acetyltransferase  42.7 
 
 		 382 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119662  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3805  acetyl-CoA acetyltransferase  43.36 
 
 		 388 aa  248  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1757  acetyl-CoA acetyltransferase  42.55 
 
 		 391 aa  247  3e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439431  normal  0.143058 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3607  acetyl-CoA acetyltransferase  41.85 
 
 		 382 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.241671  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4565  acetyl-CoA acetyltransferase  43.16 
 
 		 388 aa  239  6.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153409  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1502  acetyl-CoA acetyltransferase  42.26 
 
 		 390 aa  238  1e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2663  acetyl-CoA acetyltransferase  44.36 
 
 		 385 aa  236  4e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4787  acetyl-CoA acetyltransferase  43.19 
 
 		 387 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0607631  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2350  acetyl-CoA acetyltransferase  42.13 
 
 		 382 aa  230  3e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.731467  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5095  acetyl-CoA acetyltransferase  42.61 
 
 		 395 aa  227  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.926475 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2839  hypothetical protein  38.82 
 
 		 388 aa  212  7.999999999999999e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00983373  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4266  hypothetical protein  38.42 
 
 		 381 aa  212  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.804759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4311  hypothetical protein  38.76 
 
 		 389 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3567  putative thiolase  37.7 
 
 		 378 aa  199  5e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2093  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  41.37 
 
 		 385 aa  199  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3226  hypothetical protein  37.68 
 
 		 388 aa  199  7e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3277  hypothetical protein  37.68 
 
 		 388 aa  199  7e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3215  hypothetical protein  37.68 
 
 		 388 aa  199  7e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8761  lipid-transfer protein  39.07 
 
 		 385 aa  197  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.134204 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3651  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  39.45 
 
 		 387 aa  192  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.48348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5302  putative nonspecific lipid-transfer protein  37.53 
 
 		 388 aa  191  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.739228 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2151  nonspecific lipid-transfer protein  35.03 
 
 		 403 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4180  putative acetyl-CoA C-acetyltransferase  34.59 
 
 		 394 aa  190  4e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.785914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6832  DitF protein  40 
 
 		 396 aa  189  9e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2105  thiolase  37.5 
 
 		 404 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0715913  normal  0.0186682 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0511  lipid-transfer protein  36.99 
 
 		 389 aa  188  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2103  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  37.94 
 
 		 384 aa  187  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.655505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3314  thiolase  37.23 
 
 		 404 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0352  hypothetical protein  34.81 
 
 		 386 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000477716  decreased coverage  0.0000013738 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2744  putative thiolase/acetyl-CoA acetyltransferase, PaaJ-like  34.11 
 
 		 406 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0906041 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0031  hypothetical protein  34.93 
 
 		 402 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.761011  normal  0.262129 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8194  lipid-transfer protein  37.99 
 
 		 390 aa  182  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0899  lipid-transfer protein  38.38 
 
 		 389 aa  181  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1484  hypothetical protein  38.36 
 
 		 389 aa  180  4e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185234  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0041  hypothetical protein  34.93 
 
 		 402 aa  180  4e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0050  hypothetical protein  34.93 
 
 		 402 aa  180  4e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0851197  normal  0.0510911 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1803  putative nonspecific lipid-transfer protein  38.48 
 
 		 389 aa  179  5.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.851643 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13573  lipid-transfer protein  37.78 
 
 		 386 aa  179  7e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000077821 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3972  thiolase  35.5 
 
 		 383 aa  179  7e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.330404 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  36.72 
 
 		 386 aa  179  9e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1835  lipid-transfer protein  37.98 
 
 		 381 aa  177  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.722448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3322  thiolase  35.5 
 
 		 383 aa  178  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00152041  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0900  hypothetical protein  37.05 
 
 		 389 aa  177  3e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.049177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2361  lipid-transfer protein  37.84 
 
 		 394 aa  177  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4108  diterpenoid dioxygenase  35.26 
 
 		 397 aa  176  4e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.742638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0887  lipid-transfer protein  36.72 
 
 		 390 aa  176  5e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1513  lipid-transfer protein  36.17 
 
 		 385 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5253  lipid-transfer protein  36.44 
 
 		 385 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509405 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3858  hypothetical protein  37.43 
 
 		 390 aa  172  1e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.198117  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3952  putative thiolase  37.67 
 
 		 378 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.130005  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4758  lipid-transfer protein  36.17 
 
 		 385 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0859  thiolase  32.71 
 
 		 389 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.823302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5057  lipid-transfer protein  36.17 
 
 		 385 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4672  lipid-transfer protein  36.17 
 
 		 385 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.495157  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  33.07 
 
 		 387 aa  170  3e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0581  hypothetical protein  34.22 
 
 		 395 aa  170  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0835832  normal  0.505436 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3479  lipid-transfer protein  36.32 
 
 		 391 aa  170  3e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2016  lipid-transfer protein  35.4 
 
 		 388 aa  169  6e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.314529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  32.23 
 
 		 388 aa  169  8e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2141  lipid-transfer protein  34.02 
 
 		 392 aa  169  8e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2786  lipid-transfer protein  38.33 
 
 		 394 aa  169  8e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5454  putative nonspecific lipid-transfer protein  37.85 
 
 		 388 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.839799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5851  putative nonspecific lipid-transfer protein  37.85 
 
 		 388 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0314395  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>