More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5302 on replicon NC_010333
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010333  Caul_5302  putative nonspecific lipid-transfer protein  100 
 
 
388 aa  791    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.739228 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1803  putative nonspecific lipid-transfer protein  80.31 
 
 
389 aa  627  1e-178  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.851643 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0554  putative nonspecific lipid-transfer protein  50 
 
 
388 aa  315  8e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5851  putative nonspecific lipid-transfer protein  49.73 
 
 
388 aa  315  8e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0314395  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0636  putative nonspecific lipid-transfer protein  50 
 
 
388 aa  315  8e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.962067  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5454  putative nonspecific lipid-transfer protein  49.73 
 
 
388 aa  315  8e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.839799  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5643  putative nonspecific lipid-transfer protein  49.73 
 
 
388 aa  314  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1643  putative nonspecific lipid-transfer protein  49.73 
 
 
388 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1694  putative nonspecific lipid-transfer protein  49.73 
 
 
388 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1670  putative nonspecific lipid-transfer protein  49.73 
 
 
388 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0529  putative nonspecific lipid-transfer protein  50 
 
 
388 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.384509  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0887  lipid-transfer protein  42.26 
 
 
390 aa  265  7e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13573  lipid-transfer protein  41.48 
 
 
386 aa  263  4e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000077821 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3858  hypothetical protein  40.58 
 
 
390 aa  248  9e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.198117  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0063  lipid-transfer protein  41.36 
 
 
390 aa  247  3e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3479  lipid-transfer protein  40.96 
 
 
391 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2141  lipid-transfer protein  38.58 
 
 
392 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8194  lipid-transfer protein  40.21 
 
 
390 aa  245  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3651  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  41.76 
 
 
387 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.48348  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2786  lipid-transfer protein  41.13 
 
 
394 aa  243  5e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2016  lipid-transfer protein  41.22 
 
 
388 aa  242  9e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.314529  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2621  lipid-transfer protein  40.1 
 
 
395 aa  241  2e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000528338  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2103  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  39.69 
 
 
384 aa  239  8e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.655505  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0899  lipid-transfer protein  40.31 
 
 
389 aa  237  3e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  38.4 
 
 
388 aa  233  3e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4266  hypothetical protein  40.31 
 
 
381 aa  233  4.0000000000000004e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.804759  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2819  lipid-transfer protein  41.29 
 
 
389 aa  231  2e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5253  lipid-transfer protein  39.37 
 
 
385 aa  228  1e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.509405 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1513  lipid-transfer protein  38.4 
 
 
385 aa  224  2e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4021  putative nonspecific lipid-transfer protein  37.9 
 
 
378 aa  224  3e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0511  lipid-transfer protein  37.33 
 
 
389 aa  223  4e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5057  lipid-transfer protein  37.87 
 
 
385 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4758  lipid-transfer protein  38.13 
 
 
385 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5694  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4672  lipid-transfer protein  38.13 
 
 
385 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.495157  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8761  lipid-transfer protein  37.89 
 
 
385 aa  216  5.9999999999999996e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.134204 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5553  hypothetical protein  38.61 
 
 
383 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2093  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  39.74 
 
 
385 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773617  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51190  thiolase  40.21 
 
 
383 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000113364 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2839  hypothetical protein  38.34 
 
 
388 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00983373  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3512  thiolase  37.24 
 
 
390 aa  213  5.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1971  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  40.86 
 
 
387 aa  213  7e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5279  thiolase  38.46 
 
 
385 aa  212  7.999999999999999e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3321  lipid-transfer protein  39.68 
 
 
389 aa  212  7.999999999999999e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0828492  hitchhiker  0.000989049 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3540  hypothetical protein  38.95 
 
 
392 aa  211  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6845  thiolase  37.89 
 
 
383 aa  209  7e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4368  thiolase  39.42 
 
 
383 aa  209  8e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.739547  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0352  hypothetical protein  36.19 
 
 
386 aa  204  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000477716  decreased coverage  0.0000013738 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4055  putative nonspecific lipid-transfer protein  37.76 
 
 
397 aa  202  6e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0205444  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4625  thiolase  37.73 
 
 
390 aa  202  6e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  37.34 
 
 
383 aa  202  8e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0860  putative thiolase  35.17 
 
 
384 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016172  normal  0.461503 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1026  hypothetical protein  37.21 
 
 
396 aa  202  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.651118  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2277  thiolase  38.55 
 
 
383 aa  201  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.573629 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2581  thiolase  36.91 
 
 
385 aa  197  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1835  lipid-transfer protein  35.43 
 
 
381 aa  196  7e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.722448  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5255  thiolase  36.59 
 
 
389 aa  196  8.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0177  thiolase  40.33 
 
 
403 aa  195  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0342  thiolase  38.99 
 
 
381 aa  195  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.81 
 
 
382 aa  194  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1978  hypothetical protein  34.87 
 
 
379 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960116  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4311  hypothetical protein  36.13 
 
 
389 aa  194  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0129  thiolase  38.82 
 
 
402 aa  193  3e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0147  thiolase  38.82 
 
 
402 aa  193  3e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  35.42 
 
 
380 aa  192  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2931  hypothetical protein  35.13 
 
 
379 aa  189  5e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5111  thiolase  36.19 
 
 
390 aa  189  8e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000299159  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3588  thiolase  34.36 
 
 
379 aa  189  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5776  thiolase  39.53 
 
 
393 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2044  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  35.2 
 
 
360 aa  186  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1484  hypothetical protein  37.23 
 
 
389 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185234  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1879  putative lipid transfer protein  33.85 
 
 
379 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0403443 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6629  thiolase  37.53 
 
 
381 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0581  hypothetical protein  33.51 
 
 
395 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0835832  normal  0.505436 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1686  Acetyl-CoA acetyltransferase-like  34.63 
 
 
379 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0569144  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4071  thiolase  37.2 
 
 
382 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4180  putative acetyl-CoA C-acetyltransferase  33.16 
 
 
394 aa  179  4.999999999999999e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.785914  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2361  lipid-transfer protein  36.94 
 
 
394 aa  179  7e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3401  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  37.05 
 
 
380 aa  179  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0771846 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2935  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  36.32 
 
 
383 aa  178  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.220087  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4108  diterpenoid dioxygenase  33.16 
 
 
397 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.742638  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0891  thiolase  32.5 
 
 
405 aa  177  3e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.849216  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1074  thiolase  35.51 
 
 
384 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2367  hypothetical protein  41.6 
 
 
393 aa  176  6e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.351877  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6832  DitF protein  35.59 
 
 
396 aa  175  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5499  acetyl-CoA acetyltransferase  33.93 
 
 
391 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3310  hypothetical protein  36.88 
 
 
393 aa  174  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.408434 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1902  hypothetical protein  31.82 
 
 
396 aa  172  7.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.986081  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3115  acetyl-CoA acetyltransferase  34.54 
 
 
382 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119662  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  31.62 
 
 
388 aa  170  3e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1496  hypothetical protein  35.04 
 
 
390 aa  170  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  31.19 
 
 
387 aa  169  5e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2483  hypothetical protein  35.56 
 
 
548 aa  169  6e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.207424 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3607  acetyl-CoA acetyltransferase  34.28 
 
 
382 aa  169  8e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.241671  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4492  hypothetical protein  35.42 
 
 
385 aa  169  8e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0900  hypothetical protein  34.51 
 
 
389 aa  168  2e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.049177  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0859  thiolase  32.07 
 
 
389 aa  167  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.823302  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5006  acetyl-CoA acetyltransferase  33.42 
 
 
382 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  0.11432 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3829  acetyl-CoA acetyltransferase  34.02 
 
 
388 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.401188  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4716  DitF protein  35.49 
 
 
453 aa  166  6.9999999999999995e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1502  acetyl-CoA acetyltransferase  34.29 
 
 
390 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>