More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1496 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_2676  hypothetical protein  90.26 
 
 		 390 aa  713    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1496  hypothetical protein  100 
 
 		 390 aa  801    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3254  putative thiolase/acetyl-CoA acetyltransferase  63.75 
 
 		 394 aa  508  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146846  normal  0.511595 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1335  hypothetical protein  62.92 
 
 		 391 aa  491  1e-137  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4607  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  61.46 
 
 		 390 aa  477  1e-133  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.864443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3874  hypothetical protein  41.19 
 
 		 393 aa  282  7.000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0859  thiolase  38.11 
 
 		 389 aa  248  9e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.823302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6481  thiolase  35.17 
 
 		 388 aa  207  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5282  hypothetical protein  34.62 
 
 		 390 aa  196  6e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  36.26 
 
 		 388 aa  195  9e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  34.51 
 
 		 383 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0031  hypothetical protein  34.07 
 
 		 402 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.761011  normal  0.262129 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0041  hypothetical protein  34.07 
 
 		 402 aa  177  4e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4180  putative acetyl-CoA C-acetyltransferase  33.62 
 
 		 394 aa  176  4e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.785914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0050  hypothetical protein  34.07 
 
 		 402 aa  177  4e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0851197  normal  0.0510911 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5111  thiolase  33.89 
 
 		 390 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000299159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2581  thiolase  34.39 
 
 		 385 aa  173  5.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4266  hypothetical protein  31.78 
 
 		 381 aa  172  7.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.804759  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5776  thiolase  34.63 
 
 		 393 aa  169  5e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5279  thiolase  33.05 
 
 		 385 aa  169  9e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3512  thiolase  30.57 
 
 		 390 aa  168  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2151  nonspecific lipid-transfer protein  32.4 
 
 		 403 aa  168  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5255  thiolase  30.75 
 
 		 389 aa  167  4e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0860  putative thiolase  31.16 
 
 		 384 aa  167  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016172  normal  0.461503 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4269  hypothetical protein  33.24 
 
 		 402 aa  166  8e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.340919  normal  0.522568 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2786  lipid-transfer protein  32.68 
 
 		 394 aa  166  9e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  31.14 
 
 		 380 aa  164  3e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0129  thiolase  32.83 
 
 		 402 aa  161  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5302  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.5 
 
 		 388 aa  160  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.739228 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2377  hypothetical protein  32.96 
 
 		 402 aa  160  4e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.494222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0342  thiolase  33.53 
 
 		 381 aa  160  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1803  putative nonspecific lipid-transfer protein  33.69 
 
 		 389 aa  159  6e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.851643 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0147  thiolase  32.53 
 
 		 402 aa  159  9e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0177  thiolase  32.23 
 
 		 403 aa  158  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6845  thiolase  32.59 
 
 		 383 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51190  thiolase  32.46 
 
 		 383 aa  156  8e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113364 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4055  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.1 
 
 		 397 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0205444  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0511  lipid-transfer protein  32.84 
 
 		 389 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3479  lipid-transfer protein  31.36 
 
 		 391 aa  152  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3858  hypothetical protein  32.37 
 
 		 390 aa  152  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.198117  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4368  thiolase  32.95 
 
 		 383 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.739547  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0316  acetyl-CoA C-acetyltransferase (acetoacetyl-CoA thiolase) (AcaB-6)  30.07 
 
 		 380 aa  150  3e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2839  hypothetical protein  31.27 
 
 		 388 aa  150  5e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00983373  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1008  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  29.52 
 
 		 385 aa  150  5e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.011821 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2103  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  33.98 
 
 		 384 aa  150  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.655505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2141  lipid-transfer protein  31.92 
 
 		 392 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3651  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  34.1 
 
 		 387 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.48348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6629  thiolase  33.14 
 
 		 381 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3115  acetyl-CoA acetyltransferase  31.56 
 
 		 382 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119662  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0887  lipid-transfer protein  30.69 
 
 		 390 aa  147  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3401  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  30.86 
 
 		 380 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0771846 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3607  acetyl-CoA acetyltransferase  31.56 
 
 		 382 aa  146  5e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.241671  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0063  lipid-transfer protein  33.93 
 
 		 390 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2931  hypothetical protein  30.09 
 
 		 379 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2277  thiolase  32.94 
 
 		 383 aa  144  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.573629 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3567  putative thiolase  28.69 
 
 		 378 aa  143  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4716  DitF protein  35.71 
 
 		 453 aa  143  6e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5499  acetyl-CoA acetyltransferase  30.03 
 
 		 391 aa  142  7e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3310  hypothetical protein  35.77 
 
 		 393 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.408434 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13573  lipid-transfer protein  30.31 
 
 		 386 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000077821 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8194  lipid-transfer protein  31.2 
 
 		 390 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2935  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  31.4 
 
 		 383 aa  141  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.220087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5006  acetyl-CoA acetyltransferase  31.27 
 
 		 382 aa  140  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  0.11432 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1902  hypothetical protein  29.62 
 
 		 396 aa  140  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.986081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2350  acetyl-CoA acetyltransferase  31.69 
 
 		 382 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.731467  normal  0.759568 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0855  acetyl-CoA C-acetyltransferase (acetoacetyl-CoA thiolase) (AcaB-10)  28.23 
 
 		 385 aa  139  7e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0722065  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4152  acetyl-CoA acetyltransferase  29.36 
 
 		 389 aa  139  7.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500938  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3829  acetyl-CoA acetyltransferase  29.27 
 
 		 388 aa  139  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.401188  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2284  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  28.91 
 
 		 383 aa  139  1e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0131646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0844  thiolase  32.01 
 
 		 384 aa  139  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0899  lipid-transfer protein  37.3 
 
 		 389 aa  138  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2361  lipid-transfer protein  36.09 
 
 		 394 aa  138  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1277  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  29.31 
 
 		 397 aa  138  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1757  acetyl-CoA acetyltransferase  29.78 
 
 		 391 aa  137  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439431  normal  0.143058 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4625  thiolase  32.27 
 
 		 390 aa  137  3.0000000000000003e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2093  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.36 
 
 		 385 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6832  DitF protein  37.29 
 
 		 396 aa  137  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4421  Thiolase  29.16 
 
 		 394 aa  137  4e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0806685  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1978  hypothetical protein  28.08 
 
 		 379 aa  136  5e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960116  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3805  acetyl-CoA acetyltransferase  28.89 
 
 		 388 aa  136  7.000000000000001e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4413  acetyl-CoA acetyltransferase  31.18 
 
 		 389 aa  136  8e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00900083  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2663  acetyl-CoA acetyltransferase  29.65 
 
 		 385 aa  136  8e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1686  Acetyl-CoA acetyltransferase-like  28.24 
 
 		 379 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0569144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  30.57 
 
 		 382 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2621  lipid-transfer protein  30.36 
 
 		 395 aa  134  3.9999999999999996e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000528338  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1926  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  29.75 
 
 		 392 aa  133  6e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0900  hypothetical protein  29.92 
 
 		 389 aa  133  6e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.049177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1502  acetyl-CoA acetyltransferase  29.94 
 
 		 390 aa  132  7.999999999999999e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1484  hypothetical protein  31.67 
 
 		 389 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185234  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4787  acetyl-CoA acetyltransferase  30.65 
 
 		 387 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0607631  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2819  lipid-transfer protein  30.73 
 
 		 389 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0596  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  29.63 
 
 		 392 aa  131  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3705  hypothetical protein  30.9 
 
 		 550 aa  131  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4108  diterpenoid dioxygenase  34.93 
 
 		 397 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.742638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3692  hypothetical protein  30.9 
 
 		 550 aa  131  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3765  hypothetical protein  30.9 
 
 		 550 aa  131  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2242  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  30.29 
 
 		 389 aa  130  4.0000000000000003e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8761  lipid-transfer protein  30.42 
 
 		 385 aa  129  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.134204 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1513  lipid-transfer protein  30.19 
 
 		 385 aa  129  6e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7411  acetyl-CoA acetyltransferase  30.65 
 
 		 383 aa  129  6e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>