More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2676 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_1496  hypothetical protein  90.26 
 
 
390 aa  713    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2676  hypothetical protein  100 
 
 
390 aa  796    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3254  putative thiolase/acetyl-CoA acetyltransferase  63.31 
 
 
394 aa  496  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146846  normal  0.511595 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1335  hypothetical protein  61.66 
 
 
391 aa  483  1e-135  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4607  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  61.2 
 
 
390 aa  459  9.999999999999999e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.864443  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3874  hypothetical protein  41.16 
 
 
393 aa  281  2e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0859  thiolase  36.49 
 
 
389 aa  237  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.823302  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6481  thiolase  35.62 
 
 
388 aa  200  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5282  hypothetical protein  32.82 
 
 
390 aa  182  8.000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  35.23 
 
 
388 aa  180  4e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5111  thiolase  33.33 
 
 
390 aa  169  8e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000299159  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4180  putative acetyl-CoA C-acetyltransferase  32.76 
 
 
394 aa  167  2.9999999999999998e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.785914  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2581  thiolase  34.39 
 
 
385 aa  167  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5279  thiolase  34.19 
 
 
385 aa  167  4e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4266  hypothetical protein  32.6 
 
 
381 aa  166  8e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.804759  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0031  hypothetical protein  33.52 
 
 
402 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.761011  normal  0.262129 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0041  hypothetical protein  33.52 
 
 
402 aa  162  9e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0050  hypothetical protein  33.52 
 
 
402 aa  162  9e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0851197  normal  0.0510911 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5776  thiolase  34.43 
 
 
393 aa  162  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2151  nonspecific lipid-transfer protein  32.65 
 
 
403 aa  162  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2786  lipid-transfer protein  32.39 
 
 
394 aa  161  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4269  hypothetical protein  33.8 
 
 
402 aa  160  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.340919  normal  0.522568 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3512  thiolase  31.29 
 
 
390 aa  160  5e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2377  hypothetical protein  33.81 
 
 
402 aa  156  7e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.494222  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  31.45 
 
 
383 aa  155  9e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0129  thiolase  32.53 
 
 
402 aa  155  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6845  thiolase  33.7 
 
 
383 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0177  thiolase  32.53 
 
 
403 aa  155  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0316  acetyl-CoA C-acetyltransferase (acetoacetyl-CoA thiolase) (AcaB-6)  31.53 
 
 
380 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0147  thiolase  32.23 
 
 
402 aa  153  5.9999999999999996e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  30 
 
 
380 aa  153  5.9999999999999996e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5255  thiolase  30.79 
 
 
389 aa  153  5.9999999999999996e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5302  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.23 
 
 
388 aa  152  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.739228 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0342  thiolase  33.24 
 
 
381 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1803  putative nonspecific lipid-transfer protein  32.35 
 
 
389 aa  147  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.851643 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51190  thiolase  33.14 
 
 
383 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000113364 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3479  lipid-transfer protein  30.79 
 
 
391 aa  144  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0860  putative thiolase  30.4 
 
 
384 aa  144  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016172  normal  0.461503 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3858  hypothetical protein  31.2 
 
 
390 aa  144  4e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.198117  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2839  hypothetical protein  32.25 
 
 
388 aa  143  5e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00983373  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6629  thiolase  34.1 
 
 
381 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0511  lipid-transfer protein  31.18 
 
 
389 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0887  lipid-transfer protein  30.03 
 
 
390 aa  142  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0063  lipid-transfer protein  33.42 
 
 
390 aa  141  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4368  thiolase  32.57 
 
 
383 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.739547  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1008  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  30.77 
 
 
385 aa  141  1.9999999999999998e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.011821 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2141  lipid-transfer protein  31.66 
 
 
392 aa  139  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1902  hypothetical protein  30.16 
 
 
396 aa  139  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.986081  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4055  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.07 
 
 
397 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0205444  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2277  thiolase  33.04 
 
 
383 aa  138  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.573629 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3607  acetyl-CoA acetyltransferase  30.43 
 
 
382 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.241671  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8194  lipid-transfer protein  31.16 
 
 
390 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0855  acetyl-CoA C-acetyltransferase (acetoacetyl-CoA thiolase) (AcaB-10)  27.56 
 
 
385 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0722065  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3115  acetyl-CoA acetyltransferase  29.81 
 
 
382 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119662  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3651  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  32.08 
 
 
387 aa  134  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.48348  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13573  lipid-transfer protein  29.94 
 
 
386 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000077821 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3567  putative thiolase  28.69 
 
 
378 aa  133  6e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4716  DitF protein  34.45 
 
 
453 aa  132  7.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2284  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  29.75 
 
 
383 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0131646  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2103  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  32.43 
 
 
384 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.655505  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2935  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  30.32 
 
 
383 aa  130  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.220087  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3310  hypothetical protein  34.47 
 
 
393 aa  130  6e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.408434 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0844  thiolase  31.1 
 
 
384 aa  130  6e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2093  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.49 
 
 
385 aa  129  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773617  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3829  acetyl-CoA acetyltransferase  29.34 
 
 
388 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.401188  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4152  acetyl-CoA acetyltransferase  28.93 
 
 
389 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500938  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4625  thiolase  32.56 
 
 
390 aa  127  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2361  lipid-transfer protein  34.43 
 
 
394 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5643  putative nonspecific lipid-transfer protein  33.24 
 
 
388 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5006  acetyl-CoA acetyltransferase  28.9 
 
 
382 aa  127  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  0.11432 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2931  hypothetical protein  28.86 
 
 
379 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2621  lipid-transfer protein  28.84 
 
 
395 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000528338  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2350  acetyl-CoA acetyltransferase  30.14 
 
 
382 aa  126  5e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.731467  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5454  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.29 
 
 
388 aa  126  5e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.839799  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1757  acetyl-CoA acetyltransferase  29.92 
 
 
391 aa  127  5e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439431  normal  0.143058 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5851  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.29 
 
 
388 aa  126  5e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0314395  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5499  acetyl-CoA acetyltransferase  31.07 
 
 
391 aa  126  6e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0636  putative nonspecific lipid-transfer protein  32.96 
 
 
388 aa  125  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.962067  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0554  putative nonspecific lipid-transfer protein  32.96 
 
 
388 aa  125  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6832  DitF protein  35.17 
 
 
396 aa  125  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3805  acetyl-CoA acetyltransferase  28.2 
 
 
388 aa  124  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0900  hypothetical protein  29.09 
 
 
389 aa  124  3e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.049177  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  29.04 
 
 
382 aa  124  4e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1670  putative nonspecific lipid-transfer protein  32.41 
 
 
388 aa  123  5e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1643  putative nonspecific lipid-transfer protein  32.41 
 
 
388 aa  123  5e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1694  putative nonspecific lipid-transfer protein  32.41 
 
 
388 aa  123  5e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3705  hypothetical protein  29.81 
 
 
550 aa  123  6e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724372  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1513  lipid-transfer protein  30.46 
 
 
385 aa  123  7e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3765  hypothetical protein  29.81 
 
 
550 aa  122  7e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3692  hypothetical protein  29.81 
 
 
550 aa  122  7e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0899  lipid-transfer protein  34.57 
 
 
389 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3401  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  28.19 
 
 
380 aa  122  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0771846 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4413  acetyl-CoA acetyltransferase  30.98 
 
 
389 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00900083  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4071  thiolase  32.46 
 
 
382 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4108  diterpenoid dioxygenase  32.91 
 
 
397 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.742638  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2016  lipid-transfer protein  30.91 
 
 
388 aa  120  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.314529  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4492  hypothetical protein  29.28 
 
 
385 aa  120  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1978  hypothetical protein  26.36 
 
 
379 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960116  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1502  acetyl-CoA acetyltransferase  29.65 
 
 
390 aa  120  3.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3319  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  27.61 
 
 
384 aa  120  3.9999999999999996e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.16037  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>