More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3254 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3254  putative thiolase/acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 		 394 aa  803    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146846  normal  0.511595 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1335  hypothetical protein  66.84 
 
 		 391 aa  528  1e-149  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1496  hypothetical protein  63.75 
 
 		 390 aa  511  1e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2676  hypothetical protein  63.31 
 
 		 390 aa  498  1e-140  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4607  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  59.42 
 
 		 390 aa  443  1e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.864443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3874  hypothetical protein  39.15 
 
 		 393 aa  251  2e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0859  thiolase  36.57 
 
 		 389 aa  216  8e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.823302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6481  thiolase  35.65 
 
 		 388 aa  203  5e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5282  hypothetical protein  34.06 
 
 		 390 aa  182  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5279  thiolase  35.06 
 
 		 385 aa  181  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5111  thiolase  35.59 
 
 		 390 aa  176  6e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000299159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2786  lipid-transfer protein  34.26 
 
 		 394 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2151  nonspecific lipid-transfer protein  31.87 
 
 		 403 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  36.26 
 
 		 388 aa  172  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0031  hypothetical protein  33.06 
 
 		 402 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.761011  normal  0.262129 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0177  thiolase  34.94 
 
 		 403 aa  170  4e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0041  hypothetical protein  33.06 
 
 		 402 aa  169  6e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0050  hypothetical protein  33.06 
 
 		 402 aa  169  6e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0851197  normal  0.0510911 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3512  thiolase  34.59 
 
 		 390 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5776  thiolase  36.14 
 
 		 393 aa  169  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5255  thiolase  33.05 
 
 		 389 aa  169  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0129  thiolase  34.64 
 
 		 402 aa  169  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2581  thiolase  33.62 
 
 		 385 aa  165  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4269  hypothetical protein  32.96 
 
 		 402 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.340919  normal  0.522568 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2839  hypothetical protein  37.28 
 
 		 388 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00983373  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0147  thiolase  34.04 
 
 		 402 aa  163  5.0000000000000005e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2377  hypothetical protein  33.95 
 
 		 402 aa  161  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.494222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3805  acetyl-CoA acetyltransferase  32.94 
 
 		 388 aa  159  7e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4180  putative acetyl-CoA C-acetyltransferase  31.1 
 
 		 394 aa  159  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.785914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6845  thiolase  33.52 
 
 		 383 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  35.21 
 
 		 383 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3829  acetyl-CoA acetyltransferase  33.83 
 
 		 388 aa  157  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.401188  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0316  acetyl-CoA C-acetyltransferase (acetoacetyl-CoA thiolase) (AcaB-6)  29.79 
 
 		 380 aa  156  7e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4266  hypothetical protein  32.16 
 
 		 381 aa  155  8e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.804759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0860  putative thiolase  31.73 
 
 		 384 aa  155  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016172  normal  0.461503 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4413  acetyl-CoA acetyltransferase  33.53 
 
 		 389 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00900083  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0887  lipid-transfer protein  31.56 
 
 		 390 aa  153  4e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3401  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  32.45 
 
 		 380 aa  153  5.9999999999999996e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0771846 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2277  thiolase  34.63 
 
 		 383 aa  152  7e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.573629 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4152  acetyl-CoA acetyltransferase  33.53 
 
 		 389 aa  152  8e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500938  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  30.96 
 
 		 380 aa  152  8.999999999999999e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4565  acetyl-CoA acetyltransferase  33.23 
 
 		 388 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153409  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0342  thiolase  34.44 
 
 		 381 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3479  lipid-transfer protein  31.86 
 
 		 391 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5006  acetyl-CoA acetyltransferase  32.39 
 
 		 382 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  0.11432 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1902  hypothetical protein  30.41 
 
 		 396 aa  145  9e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.986081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0511  lipid-transfer protein  30.35 
 
 		 389 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5302  putative nonspecific lipid-transfer protein  32.85 
 
 		 388 aa  145  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.739228 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4625  thiolase  33.33 
 
 		 390 aa  144  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1484  hypothetical protein  35.65 
 
 		 389 aa  144  4e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185234  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1757  acetyl-CoA acetyltransferase  32.12 
 
 		 391 aa  143  4e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439431  normal  0.143058 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7411  acetyl-CoA acetyltransferase  32.65 
 
 		 383 aa  142  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  30.97 
 
 		 382 aa  142  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4108  diterpenoid dioxygenase  31.68 
 
 		 397 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.742638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2483  hypothetical protein  33.6 
 
 		 548 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.207424 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4421  Thiolase  30.43 
 
 		 394 aa  141  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0806685  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5499  acetyl-CoA acetyltransferase  32.47 
 
 		 391 aa  140  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1008  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  30.08 
 
 		 385 aa  140  3.9999999999999997e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.011821 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3765  hypothetical protein  32.05 
 
 		 550 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3692  hypothetical protein  32.05 
 
 		 550 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4787  acetyl-CoA acetyltransferase  31.56 
 
 		 387 aa  139  6e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0607631  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3705  hypothetical protein  32.05 
 
 		 550 aa  139  6e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724372  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0855  acetyl-CoA C-acetyltransferase (acetoacetyl-CoA thiolase) (AcaB-10)  28.23 
 
 		 385 aa  139  7.999999999999999e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0722065  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51190  thiolase  30.46 
 
 		 383 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113364 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3115  acetyl-CoA acetyltransferase  30.64 
 
 		 382 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119662  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0900  hypothetical protein  32.14 
 
 		 389 aa  139  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.049177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13573  lipid-transfer protein  32.04 
 
 		 386 aa  138  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000077821 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3607  acetyl-CoA acetyltransferase  30.36 
 
 		 382 aa  137  4e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.241671  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6832  DitF protein  37.16 
 
 		 396 aa  136  5e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4171  hypothetical protein  32.11 
 
 		 548 aa  137  5e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5643  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.53 
 
 		 388 aa  136  5e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1978  hypothetical protein  30.14 
 
 		 379 aa  136  8e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960116  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0554  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.53 
 
 		 388 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2931  hypothetical protein  30.14 
 
 		 379 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0636  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.53 
 
 		 388 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.962067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1879  putative lipid transfer protein  29.51 
 
 		 379 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0403443 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0844  thiolase  33.84 
 
 		 384 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3858  hypothetical protein  30.77 
 
 		 390 aa  134  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.198117  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1502  acetyl-CoA acetyltransferase  30.59 
 
 		 390 aa  133  5e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2103  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  32.61 
 
 		 384 aa  133  6e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.655505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3651  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  31.82 
 
 		 387 aa  132  6.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.48348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1686  Acetyl-CoA acetyltransferase-like  29.91 
 
 		 379 aa  133  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0569144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4055  putative nonspecific lipid-transfer protein  32.69 
 
 		 397 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0205444  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3972  thiolase  33.51 
 
 		 383 aa  132  9e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.330404 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5454  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.53 
 
 		 388 aa  132  9e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.839799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2663  acetyl-CoA acetyltransferase  28.57 
 
 		 385 aa  132  9e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5851  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.53 
 
 		 388 aa  132  9e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0314395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2350  acetyl-CoA acetyltransferase  31.36 
 
 		 382 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.731467  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3588  thiolase  29.23 
 
 		 379 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2141  lipid-transfer protein  31.07 
 
 		 392 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0581  hypothetical protein  30.37 
 
 		 395 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0835832  normal  0.505436 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2093  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.71 
 
 		 385 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3567  putative thiolase  31.44 
 
 		 378 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2621  lipid-transfer protein  30.34 
 
 		 395 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000528338  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3322  thiolase  33.24 
 
 		 383 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00152041  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1670  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.24 
 
 		 388 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1643  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.24 
 
 		 388 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1694  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.24 
 
 		 388 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2819  lipid-transfer protein  31.37 
 
 		 389 aa  131  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4368  thiolase  29.73 
 
 		 383 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.739547  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>