More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3858 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3858  hypothetical protein  100 
 
 
390 aa  796    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.198117  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2786  lipid-transfer protein  76.62 
 
 
394 aa  599  1e-170  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0887  lipid-transfer protein  76.67 
 
 
390 aa  599  1e-170  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13573  lipid-transfer protein  71.88 
 
 
386 aa  571  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000077821 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2621  lipid-transfer protein  72.21 
 
 
395 aa  559  1e-158  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000528338  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8194  lipid-transfer protein  71.13 
 
 
390 aa  556  1e-157  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2819  lipid-transfer protein  72.14 
 
 
389 aa  534  1e-150  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5057  lipid-transfer protein  71.35 
 
 
385 aa  527  1e-148  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4758  lipid-transfer protein  71.35 
 
 
385 aa  522  1e-147  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5694  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5253  lipid-transfer protein  71.61 
 
 
385 aa  521  1e-147  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.509405 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4672  lipid-transfer protein  71.35 
 
 
385 aa  522  1e-147  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.495157  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1513  lipid-transfer protein  71.09 
 
 
385 aa  517  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3479  lipid-transfer protein  68.64 
 
 
391 aa  514  1.0000000000000001e-145  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0063  lipid-transfer protein  66.92 
 
 
390 aa  500  1e-140  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2141  lipid-transfer protein  61.5 
 
 
392 aa  484  1e-135  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0511  lipid-transfer protein  62.53 
 
 
389 aa  480  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3321  lipid-transfer protein  64.18 
 
 
389 aa  464  1e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0828492  hitchhiker  0.000989049 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2016  lipid-transfer protein  54.45 
 
 
388 aa  385  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.314529  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8761  lipid-transfer protein  44.07 
 
 
385 aa  322  7e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.134204 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3651  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  44.39 
 
 
387 aa  281  1e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.48348  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0899  lipid-transfer protein  41.41 
 
 
389 aa  265  1e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1835  lipid-transfer protein  40.89 
 
 
381 aa  263  3e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.722448  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4055  putative nonspecific lipid-transfer protein  41.28 
 
 
397 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0205444  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2093  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  45.82 
 
 
385 aa  259  6e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773617  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2103  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  40.05 
 
 
384 aa  252  7e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.655505  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4021  putative nonspecific lipid-transfer protein  37.99 
 
 
378 aa  247  3e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5302  putative nonspecific lipid-transfer protein  40.58 
 
 
388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.739228 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2361  lipid-transfer protein  40.15 
 
 
394 aa  244  3e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1971  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  40.62 
 
 
387 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4266  hypothetical protein  39.9 
 
 
381 aa  237  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.804759  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2044  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  40.39 
 
 
360 aa  231  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5553  hypothetical protein  36.72 
 
 
383 aa  231  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1803  putative nonspecific lipid-transfer protein  38.02 
 
 
389 aa  229  9e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.851643 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1026  hypothetical protein  35.57 
 
 
396 aa  219  8.999999999999998e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.651118  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2839  hypothetical protein  38.79 
 
 
388 aa  218  1e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00983373  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3540  hypothetical protein  34.77 
 
 
392 aa  218  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0891  thiolase  33.17 
 
 
405 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.849216  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4492  hypothetical protein  36.57 
 
 
385 aa  209  7e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  37.79 
 
 
388 aa  200  3e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  36.6 
 
 
380 aa  199  6e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0352  hypothetical protein  35.04 
 
 
386 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000477716  decreased coverage  0.0000013738 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4171  hypothetical protein  38.52 
 
 
548 aa  194  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3512  thiolase  31.97 
 
 
390 aa  192  8e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3705  hypothetical protein  36.76 
 
 
550 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724372  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1484  hypothetical protein  37.83 
 
 
389 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185234  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  35.98 
 
 
383 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3692  hypothetical protein  36.5 
 
 
550 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3765  hypothetical protein  36.5 
 
 
550 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5279  thiolase  36.22 
 
 
385 aa  190  4e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4323  hypothetical protein  34.02 
 
 
541 aa  187  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.51495 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6832  DitF protein  34.47 
 
 
396 aa  186  8e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2483  hypothetical protein  36.22 
 
 
548 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.207424 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2367  hypothetical protein  34.7 
 
 
393 aa  183  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.351877  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.22 
 
 
382 aa  182  1e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4311  hypothetical protein  36.01 
 
 
389 aa  180  4e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2277  thiolase  32.98 
 
 
383 aa  179  4.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.573629 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1902  hypothetical protein  31.49 
 
 
396 aa  179  5.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.986081  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2581  thiolase  33.67 
 
 
385 aa  179  7e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4108  diterpenoid dioxygenase  32.58 
 
 
397 aa  179  9e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.742638  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0860  putative thiolase  37.89 
 
 
384 aa  178  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016172  normal  0.461503 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5454  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.62 
 
 
388 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.839799  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5851  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.62 
 
 
388 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0314395  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3310  hypothetical protein  34.11 
 
 
393 aa  177  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.408434 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2935  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  36.2 
 
 
383 aa  178  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.220087  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0147  thiolase  34.62 
 
 
402 aa  177  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4716  DitF protein  34.63 
 
 
453 aa  178  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0554  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.62 
 
 
388 aa  177  3e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0636  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.62 
 
 
388 aa  177  3e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.962067  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1670  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.62 
 
 
388 aa  176  4e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1643  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.62 
 
 
388 aa  176  4e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1694  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.62 
 
 
388 aa  176  4e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0129  thiolase  34.03 
 
 
402 aa  177  4e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5643  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.36 
 
 
388 aa  176  9e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6845  thiolase  33.68 
 
 
383 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0177  thiolase  33.25 
 
 
403 aa  174  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0581  hypothetical protein  31.72 
 
 
395 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0835832  normal  0.505436 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6629  thiolase  37.43 
 
 
381 aa  170  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0900  hypothetical protein  33.25 
 
 
389 aa  171  3e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.049177  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4632  acetyl-CoA acetyltransferase  33.17 
 
 
402 aa  167  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0617  DitF protein  31.47 
 
 
400 aa  167  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206422  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0529  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.62 
 
 
388 aa  166  5e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.384509  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5776  thiolase  32.91 
 
 
393 aa  166  8e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5111  thiolase  33.07 
 
 
390 aa  166  9e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000299159  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5255  thiolase  34.72 
 
 
389 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4368  thiolase  33.51 
 
 
383 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.739547  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2931  hypothetical protein  32.35 
 
 
379 aa  164  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51190  thiolase  33.79 
 
 
383 aa  164  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000113364 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0906  hypothetical protein  31.49 
 
 
394 aa  160  5e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00747371  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1496  hypothetical protein  31.58 
 
 
390 aa  159  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4071  thiolase  34.64 
 
 
382 aa  157  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7411  acetyl-CoA acetyltransferase  35.87 
 
 
383 aa  157  4e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1879  putative lipid transfer protein  31.81 
 
 
379 aa  157  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0403443 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5499  acetyl-CoA acetyltransferase  34.45 
 
 
391 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1978  hypothetical protein  31.54 
 
 
379 aa  156  6e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960116  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3588  thiolase  31.27 
 
 
379 aa  156  6e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3607  acetyl-CoA acetyltransferase  34.55 
 
 
382 aa  155  9e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.241671  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3401  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  33.51 
 
 
380 aa  154  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0771846 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3567  putative thiolase  34.2 
 
 
378 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4413  acetyl-CoA acetyltransferase  33.96 
 
 
389 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00900083  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2350  acetyl-CoA acetyltransferase  35.23 
 
 
382 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.731467  normal  0.759568 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>