More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1978 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3588  thiolase  95.78 
 
 		 379 aa  754    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1686  Acetyl-CoA acetyltransferase-like  87.83 
 
 		 379 aa  678    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0569144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1879  putative lipid transfer protein  95.51 
 
 		 379 aa  751    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0403443 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2931  hypothetical protein  92.08 
 
 		 379 aa  728    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1978  hypothetical protein  100 
 
 		 379 aa  784    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960116  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  75.66 
 
 		 380 aa  603  1.0000000000000001e-171  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3401  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  68.7 
 
 		 380 aa  515  1.0000000000000001e-145  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0771846 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2935  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  58.22 
 
 		 383 aa  467  9.999999999999999e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.220087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5255  thiolase  42.82 
 
 		 389 aa  295  8e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3512  thiolase  43.42 
 
 		 390 aa  290  3e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5776  thiolase  43.42 
 
 		 393 aa  283  3.0000000000000004e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5279  thiolase  42.33 
 
 		 385 aa  283  5.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1074  thiolase  42.22 
 
 		 384 aa  282  7.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0147  thiolase  43.95 
 
 		 402 aa  282  8.000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0129  thiolase  43.68 
 
 		 402 aa  280  2e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  44.36 
 
 		 383 aa  280  2e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6629  thiolase  42.26 
 
 		 381 aa  280  4e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4368  thiolase  41.8 
 
 		 383 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.739547  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51190  thiolase  41.95 
 
 		 383 aa  277  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113364 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2277  thiolase  40.32 
 
 		 383 aa  275  8e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.573629 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4625  thiolase  40.05 
 
 		 390 aa  275  1.0000000000000001e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6845  thiolase  39.06 
 
 		 383 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0177  thiolase  42.11 
 
 		 403 aa  271  1e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  39.84 
 
 		 382 aa  270  2e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0342  thiolase  40.84 
 
 		 381 aa  267  2e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5111  thiolase  41.53 
 
 		 390 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000299159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2581  thiolase  37.27 
 
 		 385 aa  255  1.0000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4071  thiolase  41.76 
 
 		 382 aa  250  3e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5006  acetyl-CoA acetyltransferase  42.47 
 
 		 382 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  0.11432 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  38.34 
 
 		 388 aa  243  6e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3829  acetyl-CoA acetyltransferase  41.43 
 
 		 388 aa  242  7.999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.401188  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5499  acetyl-CoA acetyltransferase  39.85 
 
 		 391 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4152  acetyl-CoA acetyltransferase  41.09 
 
 		 389 aa  241  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500938  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3607  acetyl-CoA acetyltransferase  42.35 
 
 		 382 aa  239  4e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.241671  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4413  acetyl-CoA acetyltransferase  40.56 
 
 		 389 aa  239  6.999999999999999e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00900083  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0844  thiolase  41.27 
 
 		 384 aa  239  8e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3115  acetyl-CoA acetyltransferase  41.53 
 
 		 382 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119662  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1757  acetyl-CoA acetyltransferase  39.78 
 
 		 391 aa  228  2e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439431  normal  0.143058 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4565  acetyl-CoA acetyltransferase  41.18 
 
 		 388 aa  227  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153409  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2350  acetyl-CoA acetyltransferase  43.17 
 
 		 382 aa  225  1e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.731467  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3805  acetyl-CoA acetyltransferase  39.9 
 
 		 388 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0860  putative thiolase  36.65 
 
 		 384 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016172  normal  0.461503 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2663  acetyl-CoA acetyltransferase  41.28 
 
 		 385 aa  221  9.999999999999999e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1502  acetyl-CoA acetyltransferase  40.61 
 
 		 390 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4787  acetyl-CoA acetyltransferase  39.62 
 
 		 387 aa  212  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0607631  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7411  acetyl-CoA acetyltransferase  38.28 
 
 		 383 aa  197  3e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5095  acetyl-CoA acetyltransferase  36.57 
 
 		 395 aa  191  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.926475 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1803  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.38 
 
 		 389 aa  187  3e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.851643 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5553  hypothetical protein  33.33 
 
 		 383 aa  186  4e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2839  hypothetical protein  32.11 
 
 		 388 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00983373  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2093  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  38.01 
 
 		 385 aa  184  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5302  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.87 
 
 		 388 aa  182  6e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.739228 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4266  hypothetical protein  33.25 
 
 		 381 aa  181  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.804759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3479  lipid-transfer protein  35.54 
 
 		 391 aa  178  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3651  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  36.44 
 
 		 387 aa  178  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.48348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13573  lipid-transfer protein  33.7 
 
 		 386 aa  177  3e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000077821 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2744  putative thiolase/acetyl-CoA acetyltransferase, PaaJ-like  33.25 
 
 		 406 aa  172  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0906041 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  31.44 
 
 		 387 aa  170  5e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2103  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  32.33 
 
 		 384 aa  169  6e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.655505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0352  hypothetical protein  31.93 
 
 		 386 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000477716  decreased coverage  0.0000013738 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1484  hypothetical protein  37.34 
 
 		 389 aa  166  4e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185234  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0887  lipid-transfer protein  33.07 
 
 		 390 aa  164  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0511  lipid-transfer protein  32.79 
 
 		 389 aa  164  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3540  hypothetical protein  31.81 
 
 		 392 aa  161  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1835  lipid-transfer protein  30.46 
 
 		 381 aa  162  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.722448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2786  lipid-transfer protein  32.59 
 
 		 394 aa  161  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3277  hypothetical protein  33.76 
 
 		 388 aa  159  5e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3226  hypothetical protein  33.76 
 
 		 388 aa  159  5e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3215  hypothetical protein  33.76 
 
 		 388 aa  159  5e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5253  lipid-transfer protein  33.33 
 
 		 385 aa  159  7e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509405 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8194  lipid-transfer protein  31.84 
 
 		 390 aa  158  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  32.59 
 
 		 386 aa  158  2e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  30.85 
 
 		 387 aa  158  2e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  31.15 
 
 		 388 aa  157  3e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2367  hypothetical protein  32.74 
 
 		 393 aa  157  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.351877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2361  lipid-transfer protein  32.38 
 
 		 394 aa  156  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0859  thiolase  29.95 
 
 		 389 aa  155  8e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.823302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0581  hypothetical protein  31.04 
 
 		 395 aa  155  9e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0835832  normal  0.505436 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4021  putative nonspecific lipid-transfer protein  31.56 
 
 		 378 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2151  nonspecific lipid-transfer protein  30.83 
 
 		 403 aa  154  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5454  putative nonspecific lipid-transfer protein  33.42 
 
 		 388 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.839799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1971  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  32.49 
 
 		 387 aa  154  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5851  putative nonspecific lipid-transfer protein  33.42 
 
 		 388 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0314395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1026  hypothetical protein  33.59 
 
 		 396 aa  154  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.651118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8761  lipid-transfer protein  32.88 
 
 		 385 aa  153  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.134204 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0031  hypothetical protein  31.03 
 
 		 402 aa  153  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.761011  normal  0.262129 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1513  lipid-transfer protein  29.51 
 
 		 385 aa  152  7e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5057  lipid-transfer protein  30.41 
 
 		 385 aa  152  7e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4055  putative nonspecific lipid-transfer protein  33.33 
 
 		 397 aa  152  8e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0205444  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0041  hypothetical protein  31.03 
 
 		 402 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0050  hypothetical protein  31.03 
 
 		 402 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0851197  normal  0.0510911 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1643  putative nonspecific lipid-transfer protein  33.96 
 
 		 388 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5282  hypothetical protein  32.71 
 
 		 390 aa  151  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4758  lipid-transfer protein  30.14 
 
 		 385 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1670  putative nonspecific lipid-transfer protein  33.96 
 
 		 388 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4672  lipid-transfer protein  30.14 
 
 		 385 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.495157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1694  putative nonspecific lipid-transfer protein  33.96 
 
 		 388 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4311  hypothetical protein  31.37 
 
 		 389 aa  150  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0636  putative nonspecific lipid-transfer protein  33.96 
 
 		 388 aa  149  8e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.962067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0554  putative nonspecific lipid-transfer protein  33.96 
 
 		 388 aa  149  8e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>