More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3479 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3479  lipid-transfer protein  100 
 
 
391 aa  802    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8194  lipid-transfer protein  72.82 
 
 
390 aa  560  1e-158  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0887  lipid-transfer protein  72.42 
 
 
390 aa  554  1e-156  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13573  lipid-transfer protein  70.1 
 
 
386 aa  548  1e-155  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000077821 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2786  lipid-transfer protein  71.13 
 
 
394 aa  543  1e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3858  hypothetical protein  68.64 
 
 
390 aa  512  1e-144  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.198117  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0063  lipid-transfer protein  69.51 
 
 
390 aa  514  1e-144  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5057  lipid-transfer protein  70.73 
 
 
385 aa  508  1e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5253  lipid-transfer protein  72.54 
 
 
385 aa  510  1e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.509405 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2621  lipid-transfer protein  66.93 
 
 
395 aa  510  1e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000528338  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4758  lipid-transfer protein  71.24 
 
 
385 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5694  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0511  lipid-transfer protein  64.88 
 
 
389 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4672  lipid-transfer protein  71.24 
 
 
385 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.495157  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2141  lipid-transfer protein  62.53 
 
 
392 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1513  lipid-transfer protein  71.5 
 
 
385 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2819  lipid-transfer protein  68.16 
 
 
389 aa  493  9.999999999999999e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3321  lipid-transfer protein  67.87 
 
 
389 aa  491  9.999999999999999e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0828492  hitchhiker  0.000989049 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2016  lipid-transfer protein  57.62 
 
 
388 aa  404  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.314529  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8761  lipid-transfer protein  45.22 
 
 
385 aa  317  3e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.134204 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1835  lipid-transfer protein  42.6 
 
 
381 aa  272  9e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.722448  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2093  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  47.14 
 
 
385 aa  266  5e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773617  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3651  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  42.93 
 
 
387 aa  260  3e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.48348  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0899  lipid-transfer protein  40.77 
 
 
389 aa  258  1e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1971  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  42.16 
 
 
387 aa  252  7e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3540  hypothetical protein  39.29 
 
 
392 aa  249  8e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4055  putative nonspecific lipid-transfer protein  40.2 
 
 
397 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0205444  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5553  hypothetical protein  37.66 
 
 
383 aa  243  5e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5302  putative nonspecific lipid-transfer protein  41.71 
 
 
388 aa  242  7.999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.739228 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2103  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  38.96 
 
 
384 aa  233  3e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.655505  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1026  hypothetical protein  37.79 
 
 
396 aa  232  1e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.651118  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1803  putative nonspecific lipid-transfer protein  40.06 
 
 
389 aa  229  6e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.851643 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4021  putative nonspecific lipid-transfer protein  38.1 
 
 
378 aa  229  6e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4266  hypothetical protein  40.27 
 
 
381 aa  221  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.804759  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2361  lipid-transfer protein  37.44 
 
 
394 aa  221  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2839  hypothetical protein  39.64 
 
 
388 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00983373  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2367  hypothetical protein  35.61 
 
 
393 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.351877  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0891  thiolase  33.33 
 
 
405 aa  202  9.999999999999999e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.849216  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2044  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  35.57 
 
 
360 aa  199  6e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5279  thiolase  38.11 
 
 
385 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0581  hypothetical protein  35.49 
 
 
395 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0835832  normal  0.505436 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3512  thiolase  33.93 
 
 
390 aa  197  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  35.92 
 
 
380 aa  196  7e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  35.2 
 
 
383 aa  196  9e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0352  hypothetical protein  34.63 
 
 
386 aa  195  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000477716  decreased coverage  0.0000013738 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0860  putative thiolase  37.5 
 
 
384 aa  195  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016172  normal  0.461503 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4171  hypothetical protein  37.98 
 
 
548 aa  193  4e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3705  hypothetical protein  36.41 
 
 
550 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724372  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3692  hypothetical protein  36.15 
 
 
550 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3765  hypothetical protein  36.15 
 
 
550 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4108  diterpenoid dioxygenase  34.16 
 
 
397 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.742638  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4716  DitF protein  35.81 
 
 
453 aa  188  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2483  hypothetical protein  35.23 
 
 
548 aa  187  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.207424 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1484  hypothetical protein  37.56 
 
 
389 aa  187  3e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185234  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3310  hypothetical protein  35.62 
 
 
393 aa  187  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.408434 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4323  hypothetical protein  33.42 
 
 
541 aa  186  6e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.51495 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4311  hypothetical protein  35.61 
 
 
389 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6832  DitF protein  36.81 
 
 
396 aa  184  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  35.69 
 
 
388 aa  183  4.0000000000000006e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1902  hypothetical protein  30.98 
 
 
396 aa  182  7e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.986081  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1978  hypothetical protein  35.17 
 
 
379 aa  180  4e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960116  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6845  thiolase  35.55 
 
 
383 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4492  hypothetical protein  31.81 
 
 
385 aa  179  8e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3588  thiolase  34.97 
 
 
379 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2277  thiolase  34.43 
 
 
383 aa  176  5e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.573629 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5454  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.25 
 
 
388 aa  176  6e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.839799  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5851  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.25 
 
 
388 aa  176  6e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0314395  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0554  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.97 
 
 
388 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0636  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.97 
 
 
388 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.962067  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1643  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.97 
 
 
388 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1670  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.97 
 
 
388 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1694  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.97 
 
 
388 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.38 
 
 
382 aa  174  2.9999999999999996e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5643  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.7 
 
 
388 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2931  hypothetical protein  34.45 
 
 
379 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1879  putative lipid transfer protein  34.43 
 
 
379 aa  171  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0403443 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0177  thiolase  35.25 
 
 
403 aa  169  6e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5776  thiolase  33.78 
 
 
393 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0147  thiolase  35.25 
 
 
402 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2935  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  33.85 
 
 
383 aa  167  4e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.220087  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51190  thiolase  34.89 
 
 
383 aa  167  4e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000113364 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0129  thiolase  34.97 
 
 
402 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2581  thiolase  31.82 
 
 
385 aa  165  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4368  thiolase  34.06 
 
 
383 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.739547  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0529  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.97 
 
 
388 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.384509  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0900  hypothetical protein  34.92 
 
 
389 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.049177  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5499  acetyl-CoA acetyltransferase  34.69 
 
 
391 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0906  hypothetical protein  32.41 
 
 
394 aa  162  1e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00747371  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6629  thiolase  36.13 
 
 
381 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4607  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  32.93 
 
 
390 aa  161  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.864443  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1335  hypothetical protein  32.61 
 
 
391 aa  160  4e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4413  acetyl-CoA acetyltransferase  35.87 
 
 
389 aa  159  8e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00900083  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0859  thiolase  32.32 
 
 
389 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.823302  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4625  thiolase  33.33 
 
 
390 aa  158  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1757  acetyl-CoA acetyltransferase  34.91 
 
 
391 aa  158  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439431  normal  0.143058 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5006  acetyl-CoA acetyltransferase  33.7 
 
 
382 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  0.11432 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0617  DitF protein  31.54 
 
 
400 aa  155  9e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206422  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3829  acetyl-CoA acetyltransferase  34.33 
 
 
388 aa  155  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.401188  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1686  Acetyl-CoA acetyltransferase-like  34.03 
 
 
379 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0569144  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5111  thiolase  32.38 
 
 
390 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000299159  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4071  thiolase  34.73 
 
 
382 aa  153  4e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>