More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0887 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0887  lipid-transfer protein  100 
 
 		 390 aa  795    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13573  lipid-transfer protein  77.14 
 
 		 386 aa  614  9.999999999999999e-175  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000077821 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3858  hypothetical protein  76.67 
 
 		 390 aa  591  1e-168  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.198117  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2786  lipid-transfer protein  73.06 
 
 		 394 aa  577  1.0000000000000001e-163  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5253  lipid-transfer protein  76.88 
 
 		 385 aa  561  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509405 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5057  lipid-transfer protein  75.06 
 
 		 385 aa  555  1e-157  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4758  lipid-transfer protein  75.32 
 
 		 385 aa  552  1e-156  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8194  lipid-transfer protein  69.92 
 
 		 390 aa  553  1e-156  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3479  lipid-transfer protein  72.39 
 
 		 391 aa  552  1e-156  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1513  lipid-transfer protein  75.58 
 
 		 385 aa  553  1e-156  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4672  lipid-transfer protein  75.32 
 
 		 385 aa  552  1e-156  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.495157  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2621  lipid-transfer protein  69.69 
 
 		 395 aa  539  9.999999999999999e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000528338  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2819  lipid-transfer protein  69.87 
 
 		 389 aa  520  1e-146  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0063  lipid-transfer protein  67.18 
 
 		 390 aa  508  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2141  lipid-transfer protein  61.4 
 
 		 392 aa  491  1e-137  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0511  lipid-transfer protein  62.8 
 
 		 389 aa  487  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3321  lipid-transfer protein  64.36 
 
 		 389 aa  460  9.999999999999999e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0828492  hitchhiker  0.000989049 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2016  lipid-transfer protein  55.67 
 
 		 388 aa  398  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.314529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8761  lipid-transfer protein  44.96 
 
 		 385 aa  325  9e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.134204 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1835  lipid-transfer protein  41.86 
 
 		 381 aa  277  2e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.722448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5302  putative nonspecific lipid-transfer protein  42.26 
 
 		 388 aa  265  1e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.739228 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3651  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  42.71 
 
 		 387 aa  257  3e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.48348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0899  lipid-transfer protein  39.53 
 
 		 389 aa  256  5e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2361  lipid-transfer protein  39.6 
 
 		 394 aa  253  6e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4055  putative nonspecific lipid-transfer protein  40.2 
 
 		 397 aa  246  4e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0205444  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1803  putative nonspecific lipid-transfer protein  39.32 
 
 		 389 aa  244  1.9999999999999999e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.851643 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2093  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  42.78 
 
 		 385 aa  244  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1971  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  40.25 
 
 		 387 aa  241  2e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2103  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  38.64 
 
 		 384 aa  241  2e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.655505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5553  hypothetical protein  37.6 
 
 		 383 aa  239  5e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3540  hypothetical protein  37.79 
 
 		 392 aa  234  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1026  hypothetical protein  37.44 
 
 		 396 aa  234  3e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.651118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4021  putative nonspecific lipid-transfer protein  36.07 
 
 		 378 aa  230  4e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4266  hypothetical protein  38.9 
 
 		 381 aa  228  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.804759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2044  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  37.5 
 
 		 360 aa  223  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2839  hypothetical protein  40.68 
 
 		 388 aa  223  7e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00983373  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0352  hypothetical protein  35.23 
 
 		 386 aa  209  7e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000477716  decreased coverage  0.0000013738 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4492  hypothetical protein  34.78 
 
 		 385 aa  208  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0891  thiolase  32.76 
 
 		 405 aa  207  2e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.849216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0581  hypothetical protein  35.42 
 
 		 395 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0835832  normal  0.505436 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  35.4 
 
 		 380 aa  204  3e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5279  thiolase  36.73 
 
 		 385 aa  202  8e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2483  hypothetical protein  37.31 
 
 		 548 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.207424 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4171  hypothetical protein  38.75 
 
 		 548 aa  201  3e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6832  DitF protein  37.59 
 
 		 396 aa  200  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2367  hypothetical protein  35.99 
 
 		 393 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.351877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3705  hypothetical protein  35.75 
 
 		 550 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3512  thiolase  33.33 
 
 		 390 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3765  hypothetical protein  35.5 
 
 		 550 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3692  hypothetical protein  35.5 
 
 		 550 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4108  diterpenoid dioxygenase  34.33 
 
 		 397 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.742638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4311  hypothetical protein  35.14 
 
 		 389 aa  193  5e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4716  DitF protein  35.84 
 
 		 453 aa  191  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  36.39 
 
 		 383 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  35.97 
 
 		 388 aa  189  7e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3310  hypothetical protein  35.35 
 
 		 393 aa  189  8e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.408434 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2277  thiolase  34.59 
 
 		 383 aa  188  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.573629 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6845  thiolase  33.85 
 
 		 383 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  36.59 
 
 		 382 aa  186  5e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1484  hypothetical protein  38.4 
 
 		 389 aa  186  6e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185234  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0860  putative thiolase  36.73 
 
 		 384 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016172  normal  0.461503 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0147  thiolase  36.07 
 
 		 402 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0177  thiolase  34.81 
 
 		 403 aa  183  4.0000000000000006e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0129  thiolase  35.79 
 
 		 402 aa  183  4.0000000000000006e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1902  hypothetical protein  32.49 
 
 		 396 aa  183  5.0000000000000004e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.986081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4323  hypothetical protein  33.17 
 
 		 541 aa  182  6e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.51495 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2581  thiolase  34.1 
 
 		 385 aa  182  8.000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5454  putative nonspecific lipid-transfer protein  36.72 
 
 		 388 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.839799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5851  putative nonspecific lipid-transfer protein  36.72 
 
 		 388 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0314395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4071  thiolase  37.53 
 
 		 382 aa  179  5.999999999999999e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0636  putative nonspecific lipid-transfer protein  36.46 
 
 		 388 aa  179  9e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.962067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1643  putative nonspecific lipid-transfer protein  36.46 
 
 		 388 aa  179  9e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0554  putative nonspecific lipid-transfer protein  36.46 
 
 		 388 aa  179  9e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1670  putative nonspecific lipid-transfer protein  36.46 
 
 		 388 aa  179  9e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1694  putative nonspecific lipid-transfer protein  36.46 
 
 		 388 aa  179  9e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4368  thiolase  34.52 
 
 		 383 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.739547  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5643  putative nonspecific lipid-transfer protein  36.2 
 
 		 388 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5776  thiolase  34.1 
 
 		 393 aa  176  5e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51190  thiolase  33.97 
 
 		 383 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113364 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4632  acetyl-CoA acetyltransferase  33.25 
 
 		 402 aa  174  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6629  thiolase  36.98 
 
 		 381 aa  173  5.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2935  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  34.62 
 
 		 383 aa  172  6.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.220087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0900  hypothetical protein  33.5 
 
 		 389 aa  172  1e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.049177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2931  hypothetical protein  34.29 
 
 		 379 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0906  hypothetical protein  33.08 
 
 		 394 aa  169  8e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00747371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5111  thiolase  33.68 
 
 		 390 aa  168  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000299159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1978  hypothetical protein  33.07 
 
 		 379 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960116  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0617  DitF protein  32.08 
 
 		 400 aa  167  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0529  putative nonspecific lipid-transfer protein  36.46 
 
 		 388 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.384509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3588  thiolase  32.54 
 
 		 379 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1879  putative lipid transfer protein  33.07 
 
 		 379 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0403443 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4607  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  33.6 
 
 		 390 aa  162  6e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.864443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4625  thiolase  33.68 
 
 		 390 aa  162  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1335  hypothetical protein  32.72 
 
 		 391 aa  157  3e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5006  acetyl-CoA acetyltransferase  31.62 
 
 		 382 aa  157  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  0.11432 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0859  thiolase  32.6 
 
 		 389 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.823302  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1496  hypothetical protein  30.69 
 
 		 390 aa  155  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1502  acetyl-CoA acetyltransferase  34.12 
 
 		 390 aa  154  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3607  acetyl-CoA acetyltransferase  31.69 
 
 		 382 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.241671  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0342  thiolase  33.42 
 
 		 381 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>