More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3540 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3540  hypothetical protein  100 
 
 		 392 aa  801    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5553  hypothetical protein  80.21 
 
 		 383 aa  632  1e-180  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2367  hypothetical protein  70.18 
 
 		 393 aa  526  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.351877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1026  hypothetical protein  64.29 
 
 		 396 aa  493  9.999999999999999e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.651118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1971  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  57.62 
 
 		 387 aa  434  1e-120  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3479  lipid-transfer protein  39.3 
 
 		 391 aa  249  8e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2786  lipid-transfer protein  38.27 
 
 		 394 aa  248  1e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2141  lipid-transfer protein  36.34 
 
 		 392 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13573  lipid-transfer protein  37.08 
 
 		 386 aa  238  1e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000077821 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2361  lipid-transfer protein  39.23 
 
 		 394 aa  236  3e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8194  lipid-transfer protein  37.31 
 
 		 390 aa  234  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8761  lipid-transfer protein  38.05 
 
 		 385 aa  233  4.0000000000000004e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.134204 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0887  lipid-transfer protein  36.92 
 
 		 390 aa  226  5.0000000000000005e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0063  lipid-transfer protein  40.15 
 
 		 390 aa  225  8e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2621  lipid-transfer protein  38.3 
 
 		 395 aa  224  2e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000528338  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0511  lipid-transfer protein  35 
 
 		 389 aa  223  6e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3858  hypothetical protein  35.53 
 
 		 390 aa  217  2.9999999999999998e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.198117  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5057  lipid-transfer protein  36.25 
 
 		 385 aa  216  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5253  lipid-transfer protein  35.99 
 
 		 385 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509405 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4672  lipid-transfer protein  35.99 
 
 		 385 aa  212  7e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.495157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4758  lipid-transfer protein  35.99 
 
 		 385 aa  212  7e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2819  lipid-transfer protein  38.28 
 
 		 389 aa  211  1e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1513  lipid-transfer protein  35.22 
 
 		 385 aa  209  6e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1835  lipid-transfer protein  37.67 
 
 		 381 aa  208  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.722448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3321  lipid-transfer protein  36.64 
 
 		 389 aa  208  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0828492  hitchhiker  0.000989049 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4055  putative nonspecific lipid-transfer protein  36.55 
 
 		 397 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0205444  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2016  lipid-transfer protein  37.06 
 
 		 388 aa  207  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.314529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5302  putative nonspecific lipid-transfer protein  38.95 
 
 		 388 aa  205  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.739228 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3651  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  38.36 
 
 		 387 aa  199  5e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.48348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1803  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.7 
 
 		 389 aa  189  9e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.851643 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0891  thiolase  34.9 
 
 		 405 aa  187  2e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.849216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0899  lipid-transfer protein  35.37 
 
 		 389 aa  186  4e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2093  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.06 
 
 		 385 aa  180  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2103  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  31.79 
 
 		 384 aa  179  7e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.655505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4266  hypothetical protein  34.11 
 
 		 381 aa  174  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.804759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2277  thiolase  33.85 
 
 		 383 aa  173  5e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.573629 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1879  putative lipid transfer protein  32.57 
 
 		 379 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0403443 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3512  thiolase  33.75 
 
 		 390 aa  171  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1978  hypothetical protein  32.57 
 
 		 379 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960116  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3588  thiolase  32.32 
 
 		 379 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5279  thiolase  32.75 
 
 		 385 aa  157  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2839  hypothetical protein  33.59 
 
 		 388 aa  155  9e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00983373  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1686  Acetyl-CoA acetyltransferase-like  33.69 
 
 		 379 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0569144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6845  thiolase  30.92 
 
 		 383 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2581  thiolase  32.57 
 
 		 385 aa  153  5.9999999999999996e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  32.49 
 
 		 380 aa  152  7e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2931  hypothetical protein  31.04 
 
 		 379 aa  151  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4311  hypothetical protein  31.34 
 
 		 389 aa  149  7e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4368  thiolase  33.42 
 
 		 383 aa  149  7e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.739547  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1902  hypothetical protein  30.08 
 
 		 396 aa  149  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.986081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.89 
 
 		 382 aa  148  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4716  DitF protein  30.77 
 
 		 453 aa  146  5e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5643  putative nonspecific lipid-transfer protein  32.87 
 
 		 388 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0554  putative nonspecific lipid-transfer protein  32.87 
 
 		 388 aa  144  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0636  putative nonspecific lipid-transfer protein  32.87 
 
 		 388 aa  144  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.962067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5454  putative nonspecific lipid-transfer protein  32.6 
 
 		 388 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.839799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51190  thiolase  32.83 
 
 		 383 aa  144  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113364 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5851  putative nonspecific lipid-transfer protein  32.6 
 
 		 388 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0314395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6629  thiolase  33.59 
 
 		 381 aa  143  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0147  thiolase  34 
 
 		 402 aa  143  5e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2935  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  33.33 
 
 		 383 aa  143  6e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.220087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5255  thiolase  32.81 
 
 		 389 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  33 
 
 		 383 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1670  putative nonspecific lipid-transfer protein  32.6 
 
 		 388 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4021  putative nonspecific lipid-transfer protein  30.65 
 
 		 378 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1643  putative nonspecific lipid-transfer protein  32.6 
 
 		 388 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1694  putative nonspecific lipid-transfer protein  32.6 
 
 		 388 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0129  thiolase  33.5 
 
 		 402 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0906  hypothetical protein  29.62 
 
 		 394 aa  140  4.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00747371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3705  hypothetical protein  30.15 
 
 		 550 aa  139  6e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3310  hypothetical protein  30.34 
 
 		 393 aa  139  6e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.408434 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0177  thiolase  34 
 
 		 403 aa  139  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3692  hypothetical protein  30.15 
 
 		 550 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3765  hypothetical protein  30.15 
 
 		 550 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2044  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  32.5 
 
 		 360 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0529  putative nonspecific lipid-transfer protein  33.15 
 
 		 388 aa  137  4e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.384509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6832  DitF protein  32.89 
 
 		 396 aa  136  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0581  hypothetical protein  28.49 
 
 		 395 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0835832  normal  0.505436 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5499  acetyl-CoA acetyltransferase  31.78 
 
 		 391 aa  135  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0342  thiolase  33 
 
 		 381 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1484  hypothetical protein  32.98 
 
 		 389 aa  134  3e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185234  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0352  hypothetical protein  29.68 
 
 		 386 aa  134  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000477716  decreased coverage  0.0000013738 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3401  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  32.9 
 
 		 380 aa  134  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0771846 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4108  diterpenoid dioxygenase  29.6 
 
 		 397 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.742638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3607  acetyl-CoA acetyltransferase  32.45 
 
 		 382 aa  133  5e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.241671  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5776  thiolase  32.5 
 
 		 393 aa  132  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0859  thiolase  30.23 
 
 		 389 aa  131  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.823302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4413  acetyl-CoA acetyltransferase  32.73 
 
 		 389 aa  131  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00900083  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3805  acetyl-CoA acetyltransferase  31.11 
 
 		 388 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4625  thiolase  31.93 
 
 		 390 aa  129  8.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4071  thiolase  31.39 
 
 		 382 aa  129  8.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3829  acetyl-CoA acetyltransferase  30.81 
 
 		 388 aa  129  9.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.401188  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1757  acetyl-CoA acetyltransferase  31.51 
 
 		 391 aa  129  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439431  normal  0.143058 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4632  acetyl-CoA acetyltransferase  29.18 
 
 		 402 aa  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5006  acetyl-CoA acetyltransferase  29.95 
 
 		 382 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  0.11432 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3115  acetyl-CoA acetyltransferase  31.23 
 
 		 382 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119662  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2483  hypothetical protein  28.68 
 
 		 548 aa  127  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.207424 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5111  thiolase  31.09 
 
 		 390 aa  126  8.000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000299159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4171  hypothetical protein  28.68 
 
 		 548 aa  125  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0860  putative thiolase  31.23 
 
 		 384 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016172  normal  0.461503 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>