More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4672 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_4758  lipid-transfer protein  100 
 
 
385 aa  787    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5694  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5253  lipid-transfer protein  96.1 
 
 
385 aa  705    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.509405 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1513  lipid-transfer protein  95.84 
 
 
385 aa  702    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4672  lipid-transfer protein  100 
 
 
385 aa  787    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.495157  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13573  lipid-transfer protein  85.23 
 
 
386 aa  668    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000077821 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5057  lipid-transfer protein  99.22 
 
 
385 aa  785    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0887  lipid-transfer protein  75.32 
 
 
390 aa  582  1.0000000000000001e-165  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2786  lipid-transfer protein  70.23 
 
 
394 aa  566  1e-160  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8194  lipid-transfer protein  71.09 
 
 
390 aa  549  1e-155  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3858  hypothetical protein  71.35 
 
 
390 aa  547  1e-154  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.198117  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2621  lipid-transfer protein  69.35 
 
 
395 aa  541  9.999999999999999e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000528338  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3479  lipid-transfer protein  71.05 
 
 
391 aa  536  1e-151  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2819  lipid-transfer protein  69.09 
 
 
389 aa  513  1e-144  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2141  lipid-transfer protein  63.28 
 
 
392 aa  498  1e-140  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0511  lipid-transfer protein  62.97 
 
 
389 aa  488  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0063  lipid-transfer protein  65.45 
 
 
390 aa  484  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3321  lipid-transfer protein  66.23 
 
 
389 aa  461  9.999999999999999e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0828492  hitchhiker  0.000989049 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2016  lipid-transfer protein  57.22 
 
 
388 aa  410  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.314529  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8761  lipid-transfer protein  44.65 
 
 
385 aa  330  2e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.134204 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3651  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  44.87 
 
 
387 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.48348  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1835  lipid-transfer protein  40.67 
 
 
381 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.722448  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4055  putative nonspecific lipid-transfer protein  42.07 
 
 
397 aa  271  2e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0205444  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2093  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  45.97 
 
 
385 aa  268  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773617  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0899  lipid-transfer protein  40.21 
 
 
389 aa  265  8.999999999999999e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2361  lipid-transfer protein  40.67 
 
 
394 aa  260  3e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1971  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  41.65 
 
 
387 aa  245  9.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2103  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  39.49 
 
 
384 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.655505  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4021  putative nonspecific lipid-transfer protein  37 
 
 
378 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4266  hypothetical protein  41.16 
 
 
381 aa  238  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.804759  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3540  hypothetical protein  36.67 
 
 
392 aa  230  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0891  thiolase  34.07 
 
 
405 aa  229  5e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.849216  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5302  putative nonspecific lipid-transfer protein  38.06 
 
 
388 aa  228  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.739228 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5553  hypothetical protein  36.65 
 
 
383 aa  226  4e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1026  hypothetical protein  36.22 
 
 
396 aa  220  3.9999999999999997e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.651118  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1803  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.71 
 
 
389 aa  211  1e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.851643 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4492  hypothetical protein  35.75 
 
 
385 aa  208  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2839  hypothetical protein  36.1 
 
 
388 aa  207  4e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00983373  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  38.02 
 
 
388 aa  206  7e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2044  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  35.39 
 
 
360 aa  202  9e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0352  hypothetical protein  33.6 
 
 
386 aa  197  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000477716  decreased coverage  0.0000013738 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2367  hypothetical protein  34.92 
 
 
393 aa  195  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.351877  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  35.12 
 
 
380 aa  195  1e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6845  thiolase  35.7 
 
 
383 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0581  hypothetical protein  33.15 
 
 
395 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0835832  normal  0.505436 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  34.75 
 
 
383 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5279  thiolase  36.6 
 
 
385 aa  193  4e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3512  thiolase  33.24 
 
 
390 aa  192  6e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1902  hypothetical protein  31.82 
 
 
396 aa  192  8e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.986081  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4171  hypothetical protein  38.54 
 
 
548 aa  190  4e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1484  hypothetical protein  39.47 
 
 
389 aa  187  4e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185234  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2483  hypothetical protein  36.62 
 
 
548 aa  187  4e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.207424 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3705  hypothetical protein  36.62 
 
 
550 aa  186  9e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724372  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6832  DitF protein  35.97 
 
 
396 aa  184  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3692  hypothetical protein  36.36 
 
 
550 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3765  hypothetical protein  36.36 
 
 
550 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3310  hypothetical protein  34.55 
 
 
393 aa  182  9.000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.408434 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4716  DitF protein  35.16 
 
 
453 aa  180  4e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4108  diterpenoid dioxygenase  32.41 
 
 
397 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.742638  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  36.03 
 
 
382 aa  179  7e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0900  hypothetical protein  33.88 
 
 
389 aa  179  9e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.049177  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2581  thiolase  33.7 
 
 
385 aa  179  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4311  hypothetical protein  34.61 
 
 
389 aa  178  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2277  thiolase  33.51 
 
 
383 aa  176  9e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.573629 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6629  thiolase  37.23 
 
 
381 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4368  thiolase  34.07 
 
 
383 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.739547  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5111  thiolase  34.29 
 
 
390 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000299159  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0906  hypothetical protein  32.65 
 
 
394 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00747371  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0860  putative thiolase  34.08 
 
 
384 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016172  normal  0.461503 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51190  thiolase  33.52 
 
 
383 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000113364 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3588  thiolase  32.18 
 
 
379 aa  171  3e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5776  thiolase  34.72 
 
 
393 aa  168  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1879  putative lipid transfer protein  32.5 
 
 
379 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0403443 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0147  thiolase  35.38 
 
 
402 aa  168  1e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2931  hypothetical protein  33.06 
 
 
379 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5454  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.13 
 
 
388 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.839799  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2935  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  34.93 
 
 
383 aa  167  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.220087  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5851  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.13 
 
 
388 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0314395  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0129  thiolase  35.1 
 
 
402 aa  167  4e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1978  hypothetical protein  32.5 
 
 
379 aa  167  4e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960116  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4323  hypothetical protein  32.14 
 
 
541 aa  167  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.51495 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0636  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.13 
 
 
388 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.962067  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0554  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.13 
 
 
388 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1670  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.13 
 
 
388 aa  166  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1643  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.13 
 
 
388 aa  166  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1694  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.13 
 
 
388 aa  166  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0342  thiolase  34.14 
 
 
381 aa  166  9e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5499  acetyl-CoA acetyltransferase  35.77 
 
 
391 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5643  putative nonspecific lipid-transfer protein  33.86 
 
 
388 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0177  thiolase  34.04 
 
 
403 aa  164  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4071  thiolase  36.41 
 
 
382 aa  163  5.0000000000000005e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4632  acetyl-CoA acetyltransferase  31.46 
 
 
402 aa  161  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4625  thiolase  31.97 
 
 
390 aa  160  5e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1502  acetyl-CoA acetyltransferase  33.86 
 
 
390 aa  160  5e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4413  acetyl-CoA acetyltransferase  35.36 
 
 
389 aa  159  9e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00900083  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5006  acetyl-CoA acetyltransferase  34.5 
 
 
382 aa  158  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  0.11432 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5255  thiolase  32.34 
 
 
389 aa  157  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3874  hypothetical protein  33.6 
 
 
393 aa  156  5.0000000000000005e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0529  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.13 
 
 
388 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.384509  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3829  acetyl-CoA acetyltransferase  33.69 
 
 
388 aa  156  7e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.401188  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  32.15 
 
 
386 aa  154  2e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>