More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4632 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4632  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 
402 aa  829    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2483  hypothetical protein  35.15 
 
 
548 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.207424 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4171  hypothetical protein  35.22 
 
 
548 aa  177  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4323  hypothetical protein  33.42 
 
 
541 aa  177  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.51495 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1902  hypothetical protein  32.07 
 
 
396 aa  174  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.986081  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3705  hypothetical protein  34.9 
 
 
550 aa  173  5e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724372  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6832  DitF protein  36.76 
 
 
396 aa  172  5.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3765  hypothetical protein  34.9 
 
 
550 aa  173  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3692  hypothetical protein  34.9 
 
 
550 aa  173  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4108  diterpenoid dioxygenase  33.08 
 
 
397 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.742638  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0581  hypothetical protein  32.47 
 
 
395 aa  170  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0835832  normal  0.505436 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4021  putative nonspecific lipid-transfer protein  31.66 
 
 
378 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0887  lipid-transfer protein  33.25 
 
 
390 aa  167  2.9999999999999998e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8761  lipid-transfer protein  31.81 
 
 
385 aa  166  8e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.134204 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4492  hypothetical protein  32.81 
 
 
385 aa  165  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0900  hypothetical protein  33.17 
 
 
389 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.049177  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2141  lipid-transfer protein  32.9 
 
 
392 aa  163  6e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  34.19 
 
 
388 aa  162  8.000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3858  hypothetical protein  33.17 
 
 
390 aa  162  1e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.198117  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2361  lipid-transfer protein  32.65 
 
 
394 aa  161  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4266  hypothetical protein  32.01 
 
 
381 aa  160  3e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.804759  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13573  lipid-transfer protein  33.95 
 
 
386 aa  160  4e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000077821 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5253  lipid-transfer protein  32.48 
 
 
385 aa  158  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.509405 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1835  lipid-transfer protein  32.12 
 
 
381 aa  157  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.722448  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2786  lipid-transfer protein  31.23 
 
 
394 aa  157  4e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2016  lipid-transfer protein  33.08 
 
 
388 aa  156  7e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.314529  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1513  lipid-transfer protein  32.23 
 
 
385 aa  155  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3512  thiolase  31.23 
 
 
390 aa  155  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5057  lipid-transfer protein  31.2 
 
 
385 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2581  thiolase  30.81 
 
 
385 aa  151  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0906  hypothetical protein  33.16 
 
 
394 aa  151  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00747371  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8194  lipid-transfer protein  32.23 
 
 
390 aa  149  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4758  lipid-transfer protein  31.46 
 
 
385 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5694  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4672  lipid-transfer protein  31.46 
 
 
385 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.495157  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2093  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.42 
 
 
385 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773617  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4716  DitF protein  30.38 
 
 
453 aa  147  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3651  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  31.2 
 
 
387 aa  147  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.48348  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0063  lipid-transfer protein  32.92 
 
 
390 aa  146  6e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5255  thiolase  31.04 
 
 
389 aa  145  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4625  thiolase  31.39 
 
 
390 aa  144  4e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  31.19 
 
 
380 aa  144  4e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3479  lipid-transfer protein  31.94 
 
 
391 aa  143  5e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0860  putative thiolase  33.42 
 
 
384 aa  143  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016172  normal  0.461503 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3310  hypothetical protein  31.03 
 
 
393 aa  141  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.408434 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0129  thiolase  32.31 
 
 
402 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0511  lipid-transfer protein  31.74 
 
 
389 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6845  thiolase  29.03 
 
 
383 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5302  putative nonspecific lipid-transfer protein  32.06 
 
 
388 aa  140  4.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.739228 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0147  thiolase  32.31 
 
 
402 aa  139  7e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0899  lipid-transfer protein  31.48 
 
 
389 aa  139  7.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2103  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  30.28 
 
 
384 aa  139  8.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.655505  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5279  thiolase  31.31 
 
 
385 aa  139  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0859  thiolase  31.22 
 
 
389 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.823302  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2621  lipid-transfer protein  33.25 
 
 
395 aa  138  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000528338  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51190  thiolase  29.97 
 
 
383 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000113364 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5776  thiolase  31.19 
 
 
393 aa  137  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0177  thiolase  31.44 
 
 
403 aa  136  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0352  hypothetical protein  31.5 
 
 
386 aa  136  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000477716  decreased coverage  0.0000013738 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4368  thiolase  30.2 
 
 
383 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.739547  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1643  putative nonspecific lipid-transfer protein  32.56 
 
 
388 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1670  putative nonspecific lipid-transfer protein  32.56 
 
 
388 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1694  putative nonspecific lipid-transfer protein  32.56 
 
 
388 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2839  hypothetical protein  31.12 
 
 
388 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00983373  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5454  putative nonspecific lipid-transfer protein  31.79 
 
 
388 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.839799  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5851  putative nonspecific lipid-transfer protein  31.79 
 
 
388 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0314395  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0554  putative nonspecific lipid-transfer protein  32.56 
 
 
388 aa  133  5e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0636  putative nonspecific lipid-transfer protein  32.56 
 
 
388 aa  133  5e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.962067  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  29.82 
 
 
383 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5643  putative nonspecific lipid-transfer protein  32.05 
 
 
388 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2931  hypothetical protein  30.2 
 
 
379 aa  130  6e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6629  thiolase  29.98 
 
 
381 aa  129  9.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5111  thiolase  29.84 
 
 
390 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000299159  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5553  hypothetical protein  30.15 
 
 
383 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1978  hypothetical protein  29.7 
 
 
379 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960116  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1971  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  28.35 
 
 
387 aa  126  6e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3829  acetyl-CoA acetyltransferase  29.87 
 
 
388 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.401188  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1803  putative nonspecific lipid-transfer protein  29.7 
 
 
389 aa  125  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.851643 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3321  lipid-transfer protein  30.9 
 
 
389 aa  125  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0828492  hitchhiker  0.000989049 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4055  putative nonspecific lipid-transfer protein  29.31 
 
 
397 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0205444  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3540  hypothetical protein  29.18 
 
 
392 aa  125  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0529  putative nonspecific lipid-transfer protein  32.05 
 
 
388 aa  125  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.384509  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4180  putative acetyl-CoA C-acetyltransferase  28.4 
 
 
394 aa  125  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.785914  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0891  thiolase  28.61 
 
 
405 aa  123  6e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.849216  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4413  acetyl-CoA acetyltransferase  30.5 
 
 
389 aa  122  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00900083  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  29.55 
 
 
382 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3588  thiolase  29.22 
 
 
379 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5499  acetyl-CoA acetyltransferase  29.74 
 
 
391 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1496  hypothetical protein  28.57 
 
 
390 aa  119  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5006  acetyl-CoA acetyltransferase  29.21 
 
 
382 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  0.11432 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3805  acetyl-CoA acetyltransferase  29.6 
 
 
388 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4152  acetyl-CoA acetyltransferase  27.91 
 
 
389 aa  117  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500938  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1879  putative lipid transfer protein  29.22 
 
 
379 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0403443 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1484  hypothetical protein  32.61 
 
 
389 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185234  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4311  hypothetical protein  29.5 
 
 
389 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3607  acetyl-CoA acetyltransferase  29.06 
 
 
382 aa  116  6e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.241671  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3483  Thiolase  29.7 
 
 
383 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3401  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  28.69 
 
 
380 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0771846 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1026  hypothetical protein  26.54 
 
 
396 aa  114  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.651118  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0342  thiolase  30.21 
 
 
381 aa  113  6e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1502  acetyl-CoA acetyltransferase  29.64 
 
 
390 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>