More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0891 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0891  thiolase  100 
 
 		 405 aa  843    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.849216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4055  putative nonspecific lipid-transfer protein  63.38 
 
 		 397 aa  494  1e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0205444  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2361  lipid-transfer protein  39.66 
 
 		 394 aa  255  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13573  lipid-transfer protein  34.48 
 
 		 386 aa  234  3e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000077821 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0899  lipid-transfer protein  37.1 
 
 		 389 aa  231  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2016  lipid-transfer protein  37.07 
 
 		 388 aa  227  3e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.314529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5253  lipid-transfer protein  35.06 
 
 		 385 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509405 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1513  lipid-transfer protein  34.81 
 
 		 385 aa  226  7e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5057  lipid-transfer protein  34.07 
 
 		 385 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3858  hypothetical protein  33.17 
 
 		 390 aa  221  1.9999999999999999e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.198117  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2141  lipid-transfer protein  35.96 
 
 		 392 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2786  lipid-transfer protein  33.83 
 
 		 394 aa  219  5e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4758  lipid-transfer protein  34.07 
 
 		 385 aa  216  5e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4672  lipid-transfer protein  34.07 
 
 		 385 aa  216  5e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.495157  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8194  lipid-transfer protein  34.16 
 
 		 390 aa  212  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0511  lipid-transfer protein  34.66 
 
 		 389 aa  209  5e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8761  lipid-transfer protein  33.17 
 
 		 385 aa  208  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.134204 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0887  lipid-transfer protein  32.76 
 
 		 390 aa  207  3e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0063  lipid-transfer protein  32.68 
 
 		 390 aa  205  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3479  lipid-transfer protein  33 
 
 		 391 aa  205  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5553  hypothetical protein  34.6 
 
 		 383 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2093  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.83 
 
 		 385 aa  199  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2621  lipid-transfer protein  33.5 
 
 		 395 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000528338  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2103  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  33.51 
 
 		 384 aa  196  5.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.655505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2819  lipid-transfer protein  33.66 
 
 		 389 aa  192  6e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3540  hypothetical protein  34.5 
 
 		 392 aa  192  7e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3651  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  33.99 
 
 		 387 aa  190  4e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.48348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1971  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  33.25 
 
 		 387 aa  189  9e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1026  hypothetical protein  33.92 
 
 		 396 aa  186  6e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.651118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5302  putative nonspecific lipid-transfer protein  32.02 
 
 		 388 aa  179  7e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.739228 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1835  lipid-transfer protein  33.08 
 
 		 381 aa  177  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.722448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4021  putative nonspecific lipid-transfer protein  32.47 
 
 		 378 aa  173  5e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3321  lipid-transfer protein  32.34 
 
 		 389 aa  172  5.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0828492  hitchhiker  0.000989049 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0352  hypothetical protein  31.23 
 
 		 386 aa  170  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000477716  decreased coverage  0.0000013738 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4266  hypothetical protein  32.77 
 
 		 381 aa  170  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.804759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1803  putative nonspecific lipid-transfer protein  32.36 
 
 		 389 aa  166  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.851643 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2367  hypothetical protein  31.75 
 
 		 393 aa  155  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.351877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3512  thiolase  33.76 
 
 		 390 aa  152  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5279  thiolase  33.42 
 
 		 385 aa  150  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2044  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  30.79 
 
 		 360 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2277  thiolase  31.75 
 
 		 383 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.573629 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4492  hypothetical protein  33.42 
 
 		 385 aa  147  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5454  putative nonspecific lipid-transfer protein  31.01 
 
 		 388 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.839799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5851  putative nonspecific lipid-transfer protein  31.01 
 
 		 388 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0314395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7411  acetyl-CoA acetyltransferase  33.67 
 
 		 383 aa  147  4.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5643  putative nonspecific lipid-transfer protein  32.36 
 
 		 388 aa  146  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5255  thiolase  32.38 
 
 		 389 aa  145  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2839  hypothetical protein  30.41 
 
 		 388 aa  144  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00983373  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0554  putative nonspecific lipid-transfer protein  32.12 
 
 		 388 aa  144  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0636  putative nonspecific lipid-transfer protein  32.12 
 
 		 388 aa  144  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.962067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5006  acetyl-CoA acetyltransferase  32.64 
 
 		 382 aa  142  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  0.11432 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1643  putative nonspecific lipid-transfer protein  32.36 
 
 		 388 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1670  putative nonspecific lipid-transfer protein  32.36 
 
 		 388 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1694  putative nonspecific lipid-transfer protein  32.36 
 
 		 388 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  29.46 
 
 		 380 aa  141  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0342  thiolase  36.89 
 
 		 381 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2581  thiolase  31.96 
 
 		 385 aa  140  4.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  31.11 
 
 		 388 aa  140  4.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.06 
 
 		 382 aa  139  8.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3607  acetyl-CoA acetyltransferase  32.39 
 
 		 382 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.241671  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6629  thiolase  32 
 
 		 381 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4787  acetyl-CoA acetyltransferase  30.37 
 
 		 387 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0607631  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  30.75 
 
 		 383 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6845  thiolase  29.6 
 
 		 383 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3115  acetyl-CoA acetyltransferase  32.13 
 
 		 382 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119662  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0529  putative nonspecific lipid-transfer protein  31.41 
 
 		 388 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.384509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0860  putative thiolase  30.37 
 
 		 384 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016172  normal  0.461503 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3829  acetyl-CoA acetyltransferase  29.98 
 
 		 388 aa  134  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.401188  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4152  acetyl-CoA acetyltransferase  29.7 
 
 		 389 aa  134  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500938  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4108  diterpenoid dioxygenase  29.6 
 
 		 397 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.742638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1074  thiolase  31.69 
 
 		 384 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4413  acetyl-CoA acetyltransferase  29.2 
 
 		 389 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00900083  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4368  thiolase  29.44 
 
 		 383 aa  133  5e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.739547  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1484  hypothetical protein  31.63 
 
 		 389 aa  133  6e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185234  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0859  thiolase  30.05 
 
 		 389 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.823302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51190  thiolase  29.8 
 
 		 383 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113364 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4180  putative acetyl-CoA C-acetyltransferase  32.32 
 
 		 394 aa  132  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.785914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2483  hypothetical protein  30.47 
 
 		 548 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.207424 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3805  acetyl-CoA acetyltransferase  29.05 
 
 		 388 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2932  putative nonspecific lipid-transfer protein  44.03 
 
 		 151 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4071  thiolase  31.44 
 
 		 382 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4625  thiolase  30.87 
 
 		 390 aa  131  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5776  thiolase  30.79 
 
 		 393 aa  130  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1902  hypothetical protein  26.54 
 
 		 396 aa  129  6e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.986081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0581  hypothetical protein  25.97 
 
 		 395 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0835832  normal  0.505436 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3310  hypothetical protein  27.61 
 
 		 393 aa  129  8.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.408434 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0129  thiolase  31.27 
 
 		 402 aa  129  9.000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1502  acetyl-CoA acetyltransferase  30.03 
 
 		 390 aa  129  1.0000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0147  thiolase  30.97 
 
 		 402 aa  127  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2350  acetyl-CoA acetyltransferase  31.62 
 
 		 382 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.731467  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0844  thiolase  36.33 
 
 		 384 aa  127  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0617  DitF protein  29.09 
 
 		 400 aa  127  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6481  thiolase  28.29 
 
 		 388 aa  127  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4716  DitF protein  28.05 
 
 		 453 aa  127  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1757  acetyl-CoA acetyltransferase  28.57 
 
 		 391 aa  126  6e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439431  normal  0.143058 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5499  acetyl-CoA acetyltransferase  27.97 
 
 		 391 aa  126  7e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3705  hypothetical protein  28.68 
 
 		 550 aa  126  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4565  acetyl-CoA acetyltransferase  28.61 
 
 		 388 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153409  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4632  acetyl-CoA acetyltransferase  28.27 
 
 		 402 aa  125  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3692  hypothetical protein  28.68 
 
 		 550 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>