More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2367 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2367  hypothetical protein  100 
 
 
393 aa  802    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.351877  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3540  hypothetical protein  70.18 
 
 
392 aa  566  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5553  hypothetical protein  70.9 
 
 
383 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1026  hypothetical protein  62.88 
 
 
396 aa  491  9.999999999999999e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.651118  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1971  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  57.22 
 
 
387 aa  425  1e-118  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2141  lipid-transfer protein  35.68 
 
 
392 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13573  lipid-transfer protein  36.32 
 
 
386 aa  232  1e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000077821 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3479  lipid-transfer protein  36.39 
 
 
391 aa  230  3e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8194  lipid-transfer protein  36.36 
 
 
390 aa  224  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2361  lipid-transfer protein  36.41 
 
 
394 aa  221  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0887  lipid-transfer protein  35.99 
 
 
390 aa  220  3.9999999999999997e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2786  lipid-transfer protein  36.67 
 
 
394 aa  219  5e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0511  lipid-transfer protein  34.64 
 
 
389 aa  212  9e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8761  lipid-transfer protein  35.16 
 
 
385 aa  211  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.134204 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2621  lipid-transfer protein  36.9 
 
 
395 aa  209  5e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000528338  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3858  hypothetical protein  34.7 
 
 
390 aa  206  7e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.198117  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0063  lipid-transfer protein  35.7 
 
 
390 aa  205  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5253  lipid-transfer protein  35.22 
 
 
385 aa  204  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.509405 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5057  lipid-transfer protein  35.18 
 
 
385 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4758  lipid-transfer protein  34.7 
 
 
385 aa  202  7e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5694  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4672  lipid-transfer protein  34.7 
 
 
385 aa  202  7e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.495157  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4055  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.53 
 
 
397 aa  202  8e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0205444  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1513  lipid-transfer protein  34.96 
 
 
385 aa  202  8e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3321  lipid-transfer protein  34.69 
 
 
389 aa  202  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0828492  hitchhiker  0.000989049 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2016  lipid-transfer protein  35.2 
 
 
388 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.314529  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5302  putative nonspecific lipid-transfer protein  36.97 
 
 
388 aa  194  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.739228 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1803  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.75 
 
 
389 aa  193  4e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.851643 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2819  lipid-transfer protein  36.29 
 
 
389 aa  192  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1835  lipid-transfer protein  33.06 
 
 
381 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.722448  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1978  hypothetical protein  33.5 
 
 
379 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960116  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3588  thiolase  33.76 
 
 
379 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1879  putative lipid transfer protein  32.74 
 
 
379 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0403443 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3512  thiolase  34.91 
 
 
390 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3651  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  35.47 
 
 
387 aa  179  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.48348  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0899  lipid-transfer protein  33.16 
 
 
389 aa  176  5e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2103  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  32.1 
 
 
384 aa  176  8e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.655505  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2093  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  36.43 
 
 
385 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773617  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0891  thiolase  31.91 
 
 
405 aa  170  3e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.849216  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1686  Acetyl-CoA acetyltransferase-like  32.9 
 
 
379 aa  170  5e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0569144  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2931  hypothetical protein  32.99 
 
 
379 aa  168  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5279  thiolase  34.41 
 
 
385 aa  167  2.9999999999999998e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0147  thiolase  35.5 
 
 
402 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4266  hypothetical protein  32.99 
 
 
381 aa  164  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.804759  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  33.25 
 
 
380 aa  163  4.0000000000000004e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0177  thiolase  35.66 
 
 
403 aa  163  6e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0129  thiolase  35 
 
 
402 aa  159  6e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3401  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  34.26 
 
 
380 aa  158  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0771846 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2277  thiolase  31.81 
 
 
383 aa  157  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.573629 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4021  putative nonspecific lipid-transfer protein  32.89 
 
 
378 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5776  thiolase  34.09 
 
 
393 aa  156  5.0000000000000005e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5643  putative nonspecific lipid-transfer protein  33.42 
 
 
388 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0636  putative nonspecific lipid-transfer protein  33.42 
 
 
388 aa  154  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.962067  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0554  putative nonspecific lipid-transfer protein  33.42 
 
 
388 aa  154  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3705  hypothetical protein  32.99 
 
 
550 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724372  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3692  hypothetical protein  32.99 
 
 
550 aa  153  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3765  hypothetical protein  32.99 
 
 
550 aa  153  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1643  putative nonspecific lipid-transfer protein  33.15 
 
 
388 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1670  putative nonspecific lipid-transfer protein  33.15 
 
 
388 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51190  thiolase  32.07 
 
 
383 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000113364 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1694  putative nonspecific lipid-transfer protein  33.15 
 
 
388 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1902  hypothetical protein  32.68 
 
 
396 aa  150  5e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.986081  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5454  putative nonspecific lipid-transfer protein  32.6 
 
 
388 aa  149  6e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.839799  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5851  putative nonspecific lipid-transfer protein  32.6 
 
 
388 aa  149  6e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0314395  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2581  thiolase  31.3 
 
 
385 aa  149  7e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4368  thiolase  32.41 
 
 
383 aa  149  8e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.739547  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2935  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  33.84 
 
 
383 aa  148  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.220087  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4625  thiolase  30.95 
 
 
390 aa  147  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0529  putative nonspecific lipid-transfer protein  33.7 
 
 
388 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.384509  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4311  hypothetical protein  31.56 
 
 
389 aa  146  6e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6845  thiolase  29.93 
 
 
383 aa  146  6e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0581  hypothetical protein  29.43 
 
 
395 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0835832  normal  0.505436 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2839  hypothetical protein  31.57 
 
 
388 aa  142  9e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00983373  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3310  hypothetical protein  32.27 
 
 
393 aa  141  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.408434 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2044  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  31.64 
 
 
360 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6832  DitF protein  34.4 
 
 
396 aa  140  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4171  hypothetical protein  30.27 
 
 
548 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6629  thiolase  32.47 
 
 
381 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5255  thiolase  31.65 
 
 
389 aa  138  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2483  hypothetical protein  31.13 
 
 
548 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.207424 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4071  thiolase  33.33 
 
 
382 aa  135  8e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5111  thiolase  31.92 
 
 
390 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000299159  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5006  acetyl-CoA acetyltransferase  30 
 
 
382 aa  134  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  0.11432 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3829  acetyl-CoA acetyltransferase  30.91 
 
 
388 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.401188  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  31.98 
 
 
383 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1074  thiolase  31.08 
 
 
384 aa  133  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4108  diterpenoid dioxygenase  29.83 
 
 
397 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.742638  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  32.9 
 
 
388 aa  132  7.999999999999999e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0352  hypothetical protein  29.85 
 
 
386 aa  132  9e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000477716  decreased coverage  0.0000013738 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4716  DitF protein  30.83 
 
 
453 aa  132  9e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.23 
 
 
382 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0342  thiolase  32.31 
 
 
381 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3607  acetyl-CoA acetyltransferase  30.97 
 
 
382 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.241671  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3805  acetyl-CoA acetyltransferase  31.17 
 
 
388 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0859  thiolase  32.92 
 
 
389 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.823302  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4632  acetyl-CoA acetyltransferase  29.1 
 
 
402 aa  130  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0617  DitF protein  29.35 
 
 
400 aa  129  6e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206422  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3115  acetyl-CoA acetyltransferase  30.73 
 
 
382 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119662  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1484  hypothetical protein  31.55 
 
 
389 aa  125  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185234  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2350  acetyl-CoA acetyltransferase  29.1 
 
 
382 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.731467  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5499  acetyl-CoA acetyltransferase  30.27 
 
 
391 aa  124  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>