More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2016 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2016  lipid-transfer protein  100 
 
 		 388 aa  787    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.314529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2141  lipid-transfer protein  54.76 
 
 		 392 aa  429  1e-119  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2786  lipid-transfer protein  57.63 
 
 		 394 aa  421  1e-117  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13573  lipid-transfer protein  56.4 
 
 		 386 aa  414  1e-114  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000077821 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8194  lipid-transfer protein  57.89 
 
 		 390 aa  411  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3479  lipid-transfer protein  56.99 
 
 		 391 aa  410  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0887  lipid-transfer protein  55.67 
 
 		 390 aa  406  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3321  lipid-transfer protein  58.14 
 
 		 389 aa  401  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0828492  hitchhiker  0.000989049 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5253  lipid-transfer protein  57.48 
 
 		 385 aa  392  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509405 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2621  lipid-transfer protein  57.33 
 
 		 395 aa  390  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000528338  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5057  lipid-transfer protein  56.69 
 
 		 385 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1513  lipid-transfer protein  57.22 
 
 		 385 aa  390  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4672  lipid-transfer protein  57.22 
 
 		 385 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.495157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4758  lipid-transfer protein  57.22 
 
 		 385 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0063  lipid-transfer protein  54.52 
 
 		 390 aa  382  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2819  lipid-transfer protein  56.22 
 
 		 389 aa  378  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3858  hypothetical protein  54.45 
 
 		 390 aa  381  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.198117  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0511  lipid-transfer protein  52.43 
 
 		 389 aa  381  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8761  lipid-transfer protein  44.76 
 
 		 385 aa  306  4.0000000000000004e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.134204 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1835  lipid-transfer protein  40.53 
 
 		 381 aa  261  1e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.722448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3651  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  44.56 
 
 		 387 aa  258  2e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.48348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4055  putative nonspecific lipid-transfer protein  43.88 
 
 		 397 aa  257  3e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0205444  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2103  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  41.71 
 
 		 384 aa  255  9e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.655505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2361  lipid-transfer protein  42.17 
 
 		 394 aa  253  3e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0899  lipid-transfer protein  41.39 
 
 		 389 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2093  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  43.16 
 
 		 385 aa  241  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5302  putative nonspecific lipid-transfer protein  41.22 
 
 		 388 aa  236  6e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.739228 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0891  thiolase  37.07 
 
 		 405 aa  229  4e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.849216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1803  putative nonspecific lipid-transfer protein  39.36 
 
 		 389 aa  225  1e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.851643 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4021  putative nonspecific lipid-transfer protein  38.48 
 
 		 378 aa  220  3e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1971  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  39.64 
 
 		 387 aa  220  3.9999999999999997e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2044  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  39.57 
 
 		 360 aa  215  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3540  hypothetical protein  37.06 
 
 		 392 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1026  hypothetical protein  37.34 
 
 		 396 aa  210  4e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.651118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5553  hypothetical protein  36.27 
 
 		 383 aa  209  5e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4266  hypothetical protein  38.24 
 
 		 381 aa  201  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.804759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2839  hypothetical protein  37.76 
 
 		 388 aa  195  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00983373  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0352  hypothetical protein  34.69 
 
 		 386 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000477716  decreased coverage  0.0000013738 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4108  diterpenoid dioxygenase  31.76 
 
 		 397 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.742638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1902  hypothetical protein  31.79 
 
 		 396 aa  182  8.000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.986081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4492  hypothetical protein  33.67 
 
 		 385 aa  181  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2367  hypothetical protein  35.2 
 
 		 393 aa  180  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.351877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5454  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.54 
 
 		 388 aa  176  4e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.839799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5851  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.54 
 
 		 388 aa  176  4e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0314395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1484  hypothetical protein  37.17 
 
 		 389 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185234  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0554  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.81 
 
 		 388 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0636  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.81 
 
 		 388 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.962067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0617  DitF protein  31.71 
 
 		 400 aa  174  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6832  DitF protein  35.92 
 
 		 396 aa  173  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1643  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.81 
 
 		 388 aa  173  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1670  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.81 
 
 		 388 aa  173  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1694  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.81 
 
 		 388 aa  173  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0581  hypothetical protein  31.83 
 
 		 395 aa  172  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0835832  normal  0.505436 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  35.08 
 
 		 383 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  36.59 
 
 		 388 aa  171  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  34.16 
 
 		 380 aa  170  3e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5643  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.26 
 
 		 388 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2483  hypothetical protein  33.25 
 
 		 548 aa  166  4e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.207424 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3705  hypothetical protein  34.34 
 
 		 550 aa  166  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3765  hypothetical protein  34.09 
 
 		 550 aa  166  9e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3692  hypothetical protein  34.09 
 
 		 550 aa  166  9e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0906  hypothetical protein  32.08 
 
 		 394 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00747371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6629  thiolase  35.4 
 
 		 381 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0529  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.54 
 
 		 388 aa  164  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.384509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4323  hypothetical protein  31.16 
 
 		 541 aa  163  6e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.51495 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4632  acetyl-CoA acetyltransferase  33.42 
 
 		 402 aa  161  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2277  thiolase  33.83 
 
 		 383 aa  161  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.573629 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4171  hypothetical protein  33.25 
 
 		 548 aa  161  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5255  thiolase  33.88 
 
 		 389 aa  160  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3512  thiolase  33.33 
 
 		 390 aa  159  7e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2935  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  33.33 
 
 		 383 aa  157  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.220087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5279  thiolase  33.67 
 
 		 385 aa  158  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4071  thiolase  35.48 
 
 		 382 aa  157  4e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4368  thiolase  34.49 
 
 		 383 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.739547  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2581  thiolase  31.79 
 
 		 385 aa  156  8e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3310  hypothetical protein  32.73 
 
 		 393 aa  154  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.408434 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0900  hypothetical protein  32.37 
 
 		 389 aa  154  2e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.049177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51190  thiolase  34.22 
 
 		 383 aa  155  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113364 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4625  thiolase  33.86 
 
 		 390 aa  152  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0859  thiolase  32.03 
 
 		 389 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.823302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4716  DitF protein  32.54 
 
 		 453 aa  151  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4413  acetyl-CoA acetyltransferase  35.28 
 
 		 389 aa  151  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00900083  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3588  thiolase  31.51 
 
 		 379 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  34.72 
 
 		 386 aa  150  3e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5111  thiolase  34.6 
 
 		 390 aa  150  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000299159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4311  hypothetical protein  32.91 
 
 		 389 aa  149  5e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3829  acetyl-CoA acetyltransferase  34.58 
 
 		 388 aa  150  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.401188  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1978  hypothetical protein  31.23 
 
 		 379 aa  150  5e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960116  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5776  thiolase  33.88 
 
 		 393 aa  148  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2931  hypothetical protein  32.33 
 
 		 379 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0860  putative thiolase  35.16 
 
 		 384 aa  147  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016172  normal  0.461503 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4607  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  33.79 
 
 		 390 aa  147  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.864443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.7 
 
 		 382 aa  146  5e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4152  acetyl-CoA acetyltransferase  34.67 
 
 		 389 aa  146  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500938  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6845  thiolase  30.27 
 
 		 383 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  33.24 
 
 		 387 aa  145  1e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5006  acetyl-CoA acetyltransferase  33.33 
 
 		 382 aa  145  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  0.11432 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1879  putative lipid transfer protein  30.41 
 
 		 379 aa  143  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0403443 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3805  acetyl-CoA acetyltransferase  34.53 
 
 		 388 aa  142  8e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  33.06 
 
 		 387 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>