More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0899 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_0899  lipid-transfer protein  100 
 
 
389 aa  792    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8761  lipid-transfer protein  43.56 
 
 
385 aa  291  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.134204 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8194  lipid-transfer protein  42.6 
 
 
390 aa  280  3e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2093  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  44.73 
 
 
385 aa  272  6e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773617  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13573  lipid-transfer protein  41.16 
 
 
386 aa  272  6e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000077821 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3858  hypothetical protein  41.41 
 
 
390 aa  265  8.999999999999999e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.198117  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5253  lipid-transfer protein  41.39 
 
 
385 aa  265  1e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.509405 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2786  lipid-transfer protein  39.55 
 
 
394 aa  262  6e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0511  lipid-transfer protein  39.95 
 
 
389 aa  261  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5057  lipid-transfer protein  40.72 
 
 
385 aa  259  4e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0887  lipid-transfer protein  39.53 
 
 
390 aa  259  7e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1513  lipid-transfer protein  41.39 
 
 
385 aa  259  8e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2621  lipid-transfer protein  42.71 
 
 
395 aa  258  9e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000528338  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3479  lipid-transfer protein  40.73 
 
 
391 aa  258  1e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0063  lipid-transfer protein  41.1 
 
 
390 aa  256  6e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4758  lipid-transfer protein  40.21 
 
 
385 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5694  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4672  lipid-transfer protein  40.21 
 
 
385 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.495157  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2141  lipid-transfer protein  37.18 
 
 
392 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3651  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  40.81 
 
 
387 aa  252  8.000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.48348  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2016  lipid-transfer protein  41.39 
 
 
388 aa  250  2e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.314529  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2819  lipid-transfer protein  42.05 
 
 
389 aa  242  1e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2361  lipid-transfer protein  39.75 
 
 
394 aa  240  2e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1835  lipid-transfer protein  39.33 
 
 
381 aa  239  4e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.722448  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4055  putative nonspecific lipid-transfer protein  40.31 
 
 
397 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0205444  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5302  putative nonspecific lipid-transfer protein  40.31 
 
 
388 aa  231  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.739228 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0891  thiolase  37.1 
 
 
405 aa  226  4e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.849216  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  41.27 
 
 
388 aa  224  3e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2103  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  38.14 
 
 
384 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.655505  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3321  lipid-transfer protein  37.96 
 
 
389 aa  216  4e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0828492  hitchhiker  0.000989049 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1803  putative nonspecific lipid-transfer protein  37.4 
 
 
389 aa  216  5.9999999999999996e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.851643 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1971  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  37.82 
 
 
387 aa  212  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4266  hypothetical protein  38.31 
 
 
381 aa  211  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.804759  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4021  putative nonspecific lipid-transfer protein  36.56 
 
 
378 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2839  hypothetical protein  39.78 
 
 
388 aa  203  4e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00983373  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5553  hypothetical protein  37.28 
 
 
383 aa  200  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5454  putative nonspecific lipid-transfer protein  37.43 
 
 
388 aa  196  7e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.839799  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5851  putative nonspecific lipid-transfer protein  37.43 
 
 
388 aa  196  7e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0314395  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1902  hypothetical protein  34.83 
 
 
396 aa  194  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.986081  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0860  putative thiolase  38.56 
 
 
384 aa  192  6e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016172  normal  0.461503 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1026  hypothetical protein  36.99 
 
 
396 aa  191  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.651118  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4716  DitF protein  36.5 
 
 
453 aa  191  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3310  hypothetical protein  35.53 
 
 
393 aa  190  4e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.408434 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0581  hypothetical protein  34.41 
 
 
395 aa  190  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0835832  normal  0.505436 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3540  hypothetical protein  35.71 
 
 
392 aa  189  7e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  37.57 
 
 
383 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0352  hypothetical protein  36.81 
 
 
386 aa  187  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000477716  decreased coverage  0.0000013738 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4311  hypothetical protein  36.52 
 
 
389 aa  186  9e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1670  putative nonspecific lipid-transfer protein  37.53 
 
 
388 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1643  putative nonspecific lipid-transfer protein  37.53 
 
 
388 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1694  putative nonspecific lipid-transfer protein  37.53 
 
 
388 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2277  thiolase  36.16 
 
 
383 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.573629 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5643  putative nonspecific lipid-transfer protein  37.15 
 
 
388 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0636  putative nonspecific lipid-transfer protein  37.15 
 
 
388 aa  182  6e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.962067  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0554  putative nonspecific lipid-transfer protein  37.15 
 
 
388 aa  182  6e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5279  thiolase  36.11 
 
 
385 aa  181  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6629  thiolase  39.08 
 
 
381 aa  180  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0529  putative nonspecific lipid-transfer protein  37.15 
 
 
388 aa  176  5e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.384509  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1484  hypothetical protein  39.89 
 
 
389 aa  176  6e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185234  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  34.38 
 
 
380 aa  176  8e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6845  thiolase  36.44 
 
 
383 aa  176  9e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3512  thiolase  33.95 
 
 
390 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4492  hypothetical protein  35.98 
 
 
385 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.84 
 
 
382 aa  172  6.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2044  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  35.22 
 
 
360 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2483  hypothetical protein  35.86 
 
 
548 aa  170  4e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.207424 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2581  thiolase  36.12 
 
 
385 aa  169  9e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4625  thiolase  35.28 
 
 
390 aa  167  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51190  thiolase  35.64 
 
 
383 aa  166  9e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000113364 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4108  diterpenoid dioxygenase  32.34 
 
 
397 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.742638  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6832  DitF protein  36.01 
 
 
396 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5776  thiolase  39.66 
 
 
393 aa  164  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5006  acetyl-CoA acetyltransferase  36.59 
 
 
382 aa  162  7e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  0.11432 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  32.59 
 
 
390 aa  162  1e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5255  thiolase  34.64 
 
 
389 aa  162  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5111  thiolase  34.6 
 
 
390 aa  162  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000299159  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3705  hypothetical protein  35.61 
 
 
550 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724372  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3765  hypothetical protein  35.61 
 
 
550 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0129  thiolase  35.08 
 
 
402 aa  160  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3692  hypothetical protein  35.61 
 
 
550 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5499  acetyl-CoA acetyltransferase  35.99 
 
 
391 aa  160  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  31.19 
 
 
390 aa  160  4e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4368  thiolase  35.36 
 
 
383 aa  159  8e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.739547  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0147  thiolase  34.89 
 
 
402 aa  159  9e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4171  hypothetical protein  36.52 
 
 
548 aa  158  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0906  hypothetical protein  33.33 
 
 
394 aa  158  1e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00747371  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2935  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  35.43 
 
 
383 aa  158  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.220087  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  32.65 
 
 
387 aa  155  8e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0177  thiolase  34.25 
 
 
403 aa  155  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3829  acetyl-CoA acetyltransferase  34.73 
 
 
388 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.401188  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7411  acetyl-CoA acetyltransferase  42.45 
 
 
383 aa  154  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  33.6 
 
 
386 aa  153  4e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2367  hypothetical protein  34.23 
 
 
393 aa  153  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.351877  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3607  acetyl-CoA acetyltransferase  36.57 
 
 
382 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.241671  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4152  acetyl-CoA acetyltransferase  35.7 
 
 
389 aa  152  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500938  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0342  thiolase  42.36 
 
 
381 aa  152  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2931  hypothetical protein  32.13 
 
 
379 aa  149  6e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0617  DitF protein  30.4 
 
 
400 aa  149  7e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206422  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  32.05 
 
 
388 aa  149  9e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4413  acetyl-CoA acetyltransferase  36.24 
 
 
389 aa  149  9e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00900083  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4071  thiolase  37.19 
 
 
382 aa  149  9e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>