More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1513 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_5057  lipid-transfer protein  95.06 
 
 
385 aa  704    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5253  lipid-transfer protein  95.32 
 
 
385 aa  702    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.509405 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1513  lipid-transfer protein  100 
 
 
385 aa  787    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13573  lipid-transfer protein  84.72 
 
 
386 aa  660    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000077821 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4672  lipid-transfer protein  95.84 
 
 
385 aa  697    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.495157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4758  lipid-transfer protein  95.84 
 
 
385 aa  697    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5694  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0887  lipid-transfer protein  75.58 
 
 
390 aa  583  1.0000000000000001e-165  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2786  lipid-transfer protein  69.71 
 
 
394 aa  561  1.0000000000000001e-159  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3858  hypothetical protein  71.09 
 
 
390 aa  544  1e-154  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.198117  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3479  lipid-transfer protein  71.31 
 
 
391 aa  539  9.999999999999999e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8194  lipid-transfer protein  70.57 
 
 
390 aa  537  1e-151  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2621  lipid-transfer protein  68.05 
 
 
395 aa  528  1e-149  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000528338  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2819  lipid-transfer protein  68.05 
 
 
389 aa  503  1e-141  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2141  lipid-transfer protein  63.28 
 
 
392 aa  496  1e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0511  lipid-transfer protein  64.05 
 
 
389 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0063  lipid-transfer protein  65.97 
 
 
390 aa  486  1e-136  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3321  lipid-transfer protein  66.23 
 
 
389 aa  459  9.999999999999999e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0828492  hitchhiker  0.000989049 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2016  lipid-transfer protein  57.22 
 
 
388 aa  412  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.314529  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8761  lipid-transfer protein  43.34 
 
 
385 aa  318  7e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.134204 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3651  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  45.36 
 
 
387 aa  278  9e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.48348  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1835  lipid-transfer protein  39.64 
 
 
381 aa  273  3e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.722448  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4055  putative nonspecific lipid-transfer protein  42.32 
 
 
397 aa  271  1e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0205444  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0899  lipid-transfer protein  41.24 
 
 
389 aa  269  5e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2093  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  45.97 
 
 
385 aa  261  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773617  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2361  lipid-transfer protein  39.64 
 
 
394 aa  252  9.000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2103  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  40.51 
 
 
384 aa  251  2e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.655505  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1971  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  41.9 
 
 
387 aa  245  9.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4266  hypothetical protein  41.16 
 
 
381 aa  239  5.999999999999999e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.804759  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0891  thiolase  34.81 
 
 
405 aa  237  3e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.849216  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4021  putative nonspecific lipid-transfer protein  37.27 
 
 
378 aa  236  6e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5302  putative nonspecific lipid-transfer protein  38.32 
 
 
388 aa  231  1e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.739228 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1026  hypothetical protein  37.24 
 
 
396 aa  228  2e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.651118  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1803  putative nonspecific lipid-transfer protein  37.3 
 
 
389 aa  225  1e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.851643 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3540  hypothetical protein  36.15 
 
 
392 aa  224  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5553  hypothetical protein  36.05 
 
 
383 aa  222  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4492  hypothetical protein  36.27 
 
 
385 aa  213  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2839  hypothetical protein  37.47 
 
 
388 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00983373  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0352  hypothetical protein  34.65 
 
 
386 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000477716  decreased coverage  0.0000013738 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0581  hypothetical protein  33.97 
 
 
395 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0835832  normal  0.505436 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2044  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  35.11 
 
 
360 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  35.66 
 
 
388 aa  199  6e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2367  hypothetical protein  35.37 
 
 
393 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.351877  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3512  thiolase  33.59 
 
 
390 aa  195  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2483  hypothetical protein  38.29 
 
 
548 aa  194  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.207424 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5279  thiolase  36.86 
 
 
385 aa  193  5e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3705  hypothetical protein  37.72 
 
 
550 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724372  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3765  hypothetical protein  37.47 
 
 
550 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3692  hypothetical protein  37.47 
 
 
550 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4171  hypothetical protein  39.14 
 
 
548 aa  190  4e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  34.32 
 
 
380 aa  190  4e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1902  hypothetical protein  32.07 
 
 
396 aa  189  5e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.986081  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  34.39 
 
 
383 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6845  thiolase  35.71 
 
 
383 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3310  hypothetical protein  35.08 
 
 
393 aa  186  7e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.408434 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4108  diterpenoid dioxygenase  33.42 
 
 
397 aa  186  8e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.742638  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4716  DitF protein  35.68 
 
 
453 aa  184  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1484  hypothetical protein  38.42 
 
 
389 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185234  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0900  hypothetical protein  32.99 
 
 
389 aa  181  1e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.049177  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2277  thiolase  34.05 
 
 
383 aa  179  4.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.573629 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6832  DitF protein  36.48 
 
 
396 aa  179  5.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  36.55 
 
 
382 aa  179  5.999999999999999e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0860  putative thiolase  34.81 
 
 
384 aa  179  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016172  normal  0.461503 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5111  thiolase  35.34 
 
 
390 aa  178  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000299159  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6629  thiolase  37.5 
 
 
381 aa  178  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4311  hypothetical protein  34.61 
 
 
389 aa  177  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0906  hypothetical protein  33.42 
 
 
394 aa  175  9e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00747371  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2581  thiolase  33.98 
 
 
385 aa  175  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0147  thiolase  36.21 
 
 
402 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0129  thiolase  35.93 
 
 
402 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2935  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  36 
 
 
383 aa  173  5e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.220087  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0554  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.66 
 
 
388 aa  172  9e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0636  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.66 
 
 
388 aa  172  9e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.962067  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5776  thiolase  34.38 
 
 
393 aa  171  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5454  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.39 
 
 
388 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.839799  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5851  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.39 
 
 
388 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0314395  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1643  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.39 
 
 
388 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1670  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.39 
 
 
388 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5643  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.39 
 
 
388 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1694  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.39 
 
 
388 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1502  acetyl-CoA acetyltransferase  35.94 
 
 
390 aa  169  6e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0177  thiolase  35.83 
 
 
403 aa  169  8e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4071  thiolase  37.3 
 
 
382 aa  169  8e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0342  thiolase  33.5 
 
 
381 aa  169  9e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51190  thiolase  33.52 
 
 
383 aa  168  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000113364 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4323  hypothetical protein  32.48 
 
 
541 aa  167  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.51495 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4368  thiolase  33.52 
 
 
383 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.739547  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4632  acetyl-CoA acetyltransferase  32.23 
 
 
402 aa  167  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1978  hypothetical protein  31.67 
 
 
379 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960116  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5499  acetyl-CoA acetyltransferase  36.46 
 
 
391 aa  166  5e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4413  acetyl-CoA acetyltransferase  36.57 
 
 
389 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00900083  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3829  acetyl-CoA acetyltransferase  35.37 
 
 
388 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.401188  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0529  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.66 
 
 
388 aa  162  7e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.384509  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3588  thiolase  30.85 
 
 
379 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2931  hypothetical protein  31.21 
 
 
379 aa  162  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5255  thiolase  32.57 
 
 
389 aa  161  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5006  acetyl-CoA acetyltransferase  34.85 
 
 
382 aa  161  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  0.11432 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3607  acetyl-CoA acetyltransferase  35.43 
 
 
382 aa  159  8e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.241671  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  31.9 
 
 
386 aa  159  1e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1879  putative lipid transfer protein  31.41 
 
 
379 aa  157  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0403443 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0844  thiolase  34.31 
 
 
384 aa  155  8e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>