More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2361 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2361  lipid-transfer protein  100 
 
 		 394 aa  791    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4055  putative nonspecific lipid-transfer protein  46.12 
 
 		 397 aa  299  5e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0205444  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2786  lipid-transfer protein  41.86 
 
 		 394 aa  265  8.999999999999999e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13573  lipid-transfer protein  41.19 
 
 		 386 aa  261  2e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000077821 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0891  thiolase  39.66 
 
 		 405 aa  255  9e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.849216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5057  lipid-transfer protein  40.26 
 
 		 385 aa  255  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0887  lipid-transfer protein  39.36 
 
 		 390 aa  254  2.0000000000000002e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4758  lipid-transfer protein  40.26 
 
 		 385 aa  252  8.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4672  lipid-transfer protein  40.26 
 
 		 385 aa  252  8.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.495157  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2932  putative nonspecific lipid-transfer protein  81.76 
 
 		 151 aa  250  3e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8194  lipid-transfer protein  40.67 
 
 		 390 aa  250  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2016  lipid-transfer protein  42.07 
 
 		 388 aa  249  4e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.314529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1513  lipid-transfer protein  39.32 
 
 		 385 aa  248  2e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5253  lipid-transfer protein  39.32 
 
 		 385 aa  248  2e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509405 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3858  hypothetical protein  40.15 
 
 		 390 aa  246  6.999999999999999e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.198117  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0899  lipid-transfer protein  39.09 
 
 		 389 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2141  lipid-transfer protein  37.91 
 
 		 392 aa  241  1e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3540  hypothetical protein  39.23 
 
 		 392 aa  238  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0511  lipid-transfer protein  38.29 
 
 		 389 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0063  lipid-transfer protein  41.09 
 
 		 390 aa  233  5e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2621  lipid-transfer protein  40.61 
 
 		 395 aa  232  7.000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000528338  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5553  hypothetical protein  38.32 
 
 		 383 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1026  hypothetical protein  38.73 
 
 		 396 aa  232  1e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.651118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2093  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  43.42 
 
 		 385 aa  231  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8761  lipid-transfer protein  39.23 
 
 		 385 aa  230  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.134204 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3479  lipid-transfer protein  37.97 
 
 		 391 aa  226  7e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3651  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  40.1 
 
 		 387 aa  224  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.48348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4266  hypothetical protein  41.29 
 
 		 381 aa  222  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.804759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1971  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  40.71 
 
 		 387 aa  219  6e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3321  lipid-transfer protein  37.47 
 
 		 389 aa  209  5e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0828492  hitchhiker  0.000989049 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2819  lipid-transfer protein  38.83 
 
 		 389 aa  209  8e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3310  hypothetical protein  38.24 
 
 		 393 aa  207  3e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.408434 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2483  hypothetical protein  39.51 
 
 		 548 aa  206  8e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.207424 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0352  hypothetical protein  46.12 
 
 		 386 aa  205  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000477716  decreased coverage  0.0000013738 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1902  hypothetical protein  34.98 
 
 		 396 aa  204  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.986081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2839  hypothetical protein  36.87 
 
 		 388 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00983373  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4171  hypothetical protein  40.15 
 
 		 548 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4492  hypothetical protein  38.6 
 
 		 385 aa  199  5e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4716  DitF protein  36.95 
 
 		 453 aa  197  3e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2367  hypothetical protein  36.2 
 
 		 393 aa  197  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.351877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1835  lipid-transfer protein  35.9 
 
 		 381 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.722448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3705  hypothetical protein  38.46 
 
 		 550 aa  196  6e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0581  hypothetical protein  34.37 
 
 		 395 aa  196  6e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0835832  normal  0.505436 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4021  putative nonspecific lipid-transfer protein  36.1 
 
 		 378 aa  196  8.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6832  DitF protein  38.02 
 
 		 396 aa  195  9e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3765  hypothetical protein  38.21 
 
 		 550 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3692  hypothetical protein  38.21 
 
 		 550 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3512  thiolase  35.53 
 
 		 390 aa  194  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  37.92 
 
 		 388 aa  193  4e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2103  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  33.42 
 
 		 384 aa  193  6e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.655505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  40.18 
 
 		 383 aa  192  7e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2277  thiolase  36.39 
 
 		 383 aa  192  9e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.573629 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  35.2 
 
 		 380 aa  191  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5279  thiolase  37.3 
 
 		 385 aa  191  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5255  thiolase  34.56 
 
 		 389 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4108  diterpenoid dioxygenase  34.65 
 
 		 397 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.742638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  36.49 
 
 		 382 aa  182  1e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1484  hypothetical protein  38.93 
 
 		 389 aa  180  4.999999999999999e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185234  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2931  hypothetical protein  34.58 
 
 		 379 aa  179  7e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51190  thiolase  36.34 
 
 		 383 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113364 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5499  acetyl-CoA acetyltransferase  36.22 
 
 		 391 aa  177  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2581  thiolase  35.29 
 
 		 385 aa  176  7e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5302  putative nonspecific lipid-transfer protein  36.94 
 
 		 388 aa  176  7e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.739228 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0906  hypothetical protein  34.25 
 
 		 394 aa  176  7e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00747371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6845  thiolase  36.16 
 
 		 383 aa  176  9e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4625  thiolase  36 
 
 		 390 aa  175  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3829  acetyl-CoA acetyltransferase  37.71 
 
 		 388 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.401188  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4787  acetyl-CoA acetyltransferase  37.5 
 
 		 387 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0607631  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2935  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  34.06 
 
 		 383 aa  174  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.220087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1803  putative nonspecific lipid-transfer protein  36.18 
 
 		 389 aa  174  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.851643 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5776  thiolase  43.46 
 
 		 393 aa  174  3.9999999999999995e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4323  hypothetical protein  33.75 
 
 		 541 aa  173  5e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.51495 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0342  thiolase  39.75 
 
 		 381 aa  172  5.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0129  thiolase  43.42 
 
 		 402 aa  172  7.999999999999999e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4413  acetyl-CoA acetyltransferase  38.48 
 
 		 389 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00900083  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0147  thiolase  42.98 
 
 		 402 aa  170  3e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4071  thiolase  39.14 
 
 		 382 aa  171  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6629  thiolase  37.84 
 
 		 381 aa  170  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1502  acetyl-CoA acetyltransferase  34.55 
 
 		 390 aa  168  1e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5111  thiolase  36.18 
 
 		 390 aa  169  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000299159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4311  hypothetical protein  36.39 
 
 		 389 aa  167  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1757  acetyl-CoA acetyltransferase  34.46 
 
 		 391 aa  167  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439431  normal  0.143058 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0177  thiolase  42.98 
 
 		 403 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1879  putative lipid transfer protein  32.99 
 
 		 379 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0403443 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4632  acetyl-CoA acetyltransferase  32.49 
 
 		 402 aa  166  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5454  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.68 
 
 		 388 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.839799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5851  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.68 
 
 		 388 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0314395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5006  acetyl-CoA acetyltransferase  36.02 
 
 		 382 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  0.11432 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4152  acetyl-CoA acetyltransferase  37.43 
 
 		 389 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500938  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1978  hypothetical protein  32.38 
 
 		 379 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960116  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3588  thiolase  32.53 
 
 		 379 aa  162  9e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3805  acetyl-CoA acetyltransferase  36.86 
 
 		 388 aa  162  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4368  thiolase  34.4 
 
 		 383 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.739547  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4565  acetyl-CoA acetyltransferase  37.14 
 
 		 388 aa  161  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153409  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7411  acetyl-CoA acetyltransferase  36.26 
 
 		 383 aa  161  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4421  Thiolase  33.41 
 
 		 394 aa  159  6e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0806685  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0860  putative thiolase  36.23 
 
 		 384 aa  159  8e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016172  normal  0.461503 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1686  Acetyl-CoA acetyltransferase-like  34.5 
 
 		 379 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0569144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3607  acetyl-CoA acetyltransferase  35.06 
 
 		 382 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.241671  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3115  acetyl-CoA acetyltransferase  36.31 
 
 		 382 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119662  normal  0.439972 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>