More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6845 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6845  thiolase  100 
 
 		 383 aa  780    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2581  thiolase  66.93 
 
 		 385 aa  529  1e-149  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4368  thiolase  63.71 
 
 		 383 aa  496  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.739547  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2277  thiolase  65.34 
 
 		 383 aa  497  1e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.573629 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0342  thiolase  66.85 
 
 		 381 aa  493  9.999999999999999e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51190  thiolase  62.4 
 
 		 383 aa  488  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113364 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3512  thiolase  60.62 
 
 		 390 aa  479  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5776  thiolase  62.6 
 
 		 393 aa  468  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5279  thiolase  62.27 
 
 		 385 aa  469  1.0000000000000001e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0177  thiolase  60.52 
 
 		 403 aa  461  1e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0129  thiolase  59.74 
 
 		 402 aa  454  1e-127  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0147  thiolase  59.74 
 
 		 402 aa  453  1.0000000000000001e-126  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5111  thiolase  59.59 
 
 		 390 aa  415  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000299159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4625  thiolase  54.47 
 
 		 390 aa  387  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1074  thiolase  53.12 
 
 		 384 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5255  thiolase  49.32 
 
 		 389 aa  331  2e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6629  thiolase  50.41 
 
 		 381 aa  322  6e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  45.36 
 
 		 382 aa  320  1.9999999999999998e-86  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  47.14 
 
 		 383 aa  321  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4071  thiolase  48.76 
 
 		 382 aa  310  2e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0844  thiolase  48.78 
 
 		 384 aa  294  2e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  40.47 
 
 		 380 aa  291  2e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3588  thiolase  39.53 
 
 		 379 aa  276  6e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1978  hypothetical protein  39.06 
 
 		 379 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960116  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1879  putative lipid transfer protein  39.06 
 
 		 379 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0403443 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5499  acetyl-CoA acetyltransferase  43.26 
 
 		 391 aa  269  7e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2931  hypothetical protein  38.28 
 
 		 379 aa  265  8e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  40.52 
 
 		 388 aa  261  1e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3401  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  39.07 
 
 		 380 aa  257  2e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0771846 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1686  Acetyl-CoA acetyltransferase-like  38.7 
 
 		 379 aa  256  4e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0569144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2935  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  40 
 
 		 383 aa  254  2.0000000000000002e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.220087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1757  acetyl-CoA acetyltransferase  40.51 
 
 		 391 aa  248  2e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439431  normal  0.143058 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3829  acetyl-CoA acetyltransferase  38.68 
 
 		 388 aa  248  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.401188  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4413  acetyl-CoA acetyltransferase  39.13 
 
 		 389 aa  245  9e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00900083  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0860  putative thiolase  37.9 
 
 		 384 aa  241  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016172  normal  0.461503 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2663  acetyl-CoA acetyltransferase  41.3 
 
 		 385 aa  240  2.9999999999999997e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4565  acetyl-CoA acetyltransferase  38.68 
 
 		 388 aa  239  4e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153409  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7411  acetyl-CoA acetyltransferase  42.34 
 
 		 383 aa  239  9e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3805  acetyl-CoA acetyltransferase  37.69 
 
 		 388 aa  236  6e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5006  acetyl-CoA acetyltransferase  38.11 
 
 		 382 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  0.11432 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3607  acetyl-CoA acetyltransferase  38.92 
 
 		 382 aa  234  3e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.241671  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4152  acetyl-CoA acetyltransferase  37.08 
 
 		 389 aa  232  7.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500938  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2350  acetyl-CoA acetyltransferase  40 
 
 		 382 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.731467  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1502  acetyl-CoA acetyltransferase  39.14 
 
 		 390 aa  229  5e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4787  acetyl-CoA acetyltransferase  40.87 
 
 		 387 aa  229  8e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0607631  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4266  hypothetical protein  37.4 
 
 		 381 aa  228  1e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.804759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3115  acetyl-CoA acetyltransferase  38.65 
 
 		 382 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119662  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5095  acetyl-CoA acetyltransferase  41.76 
 
 		 395 aa  224  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.926475 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2839  hypothetical protein  37.53 
 
 		 388 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00983373  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2093  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  39.53 
 
 		 385 aa  204  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4311  hypothetical protein  36.65 
 
 		 389 aa  202  7e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5302  putative nonspecific lipid-transfer protein  37.89 
 
 		 388 aa  202  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.739228 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1484  hypothetical protein  49.16 
 
 		 389 aa  199  6e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185234  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  37.73 
 
 		 386 aa  199  7e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0352  hypothetical protein  34.95 
 
 		 386 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000477716  decreased coverage  0.0000013738 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3651  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  34.29 
 
 		 387 aa  193  4e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.48348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1803  putative nonspecific lipid-transfer protein  38.3 
 
 		 389 aa  191  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.851643 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  34.55 
 
 		 390 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3567  putative thiolase  35.68 
 
 		 378 aa  190  4e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13573  lipid-transfer protein  36.16 
 
 		 386 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000077821 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2786  lipid-transfer protein  34.62 
 
 		 394 aa  187  3e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1902  hypothetical protein  32.32 
 
 		 396 aa  187  3e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.986081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  34.92 
 
 		 390 aa  186  7e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8761  lipid-transfer protein  35.77 
 
 		 385 aa  185  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.134204 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0581  hypothetical protein  34.57 
 
 		 395 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0835832  normal  0.505436 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  34.78 
 
 		 387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  33.25 
 
 		 388 aa  183  4.0000000000000006e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  33.51 
 
 		 387 aa  182  9.000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  33.51 
 
 		 388 aa  181  2e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4716  DitF protein  36.94 
 
 		 453 aa  180  4e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2105  thiolase  35.23 
 
 		 404 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0715913  normal  0.0186682 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3479  lipid-transfer protein  35.55 
 
 		 391 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0887  lipid-transfer protein  34.36 
 
 		 390 aa  179  5.999999999999999e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8194  lipid-transfer protein  33.76 
 
 		 390 aa  177  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3310  hypothetical protein  35.66 
 
 		 393 aa  176  8e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.408434 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4758  lipid-transfer protein  35.31 
 
 		 385 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4672  lipid-transfer protein  35.31 
 
 		 385 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.495157  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5057  lipid-transfer protein  35.05 
 
 		 385 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  31.19 
 
 		 388 aa  173  3.9999999999999995e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4055  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.68 
 
 		 397 aa  172  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0205444  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0899  lipid-transfer protein  36.44 
 
 		 389 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4108  diterpenoid dioxygenase  32.9 
 
 		 397 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.742638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3322  thiolase  34.68 
 
 		 383 aa  172  9e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00152041  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2361  lipid-transfer protein  36.16 
 
 		 394 aa  172  9e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5253  lipid-transfer protein  35.44 
 
 		 385 aa  172  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509405 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3314  thiolase  34.05 
 
 		 404 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3972  thiolase  34.41 
 
 		 383 aa  170  3e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.330404 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1513  lipid-transfer protein  35.44 
 
 		 385 aa  170  4e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  32.56 
 
 		 387 aa  170  4e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1835  lipid-transfer protein  34.55 
 
 		 381 aa  168  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.722448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2103  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  35.29 
 
 		 384 aa  167  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.655505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2621  lipid-transfer protein  33.68 
 
 		 395 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000528338  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3277  hypothetical protein  34.11 
 
 		 388 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3226  hypothetical protein  34.11 
 
 		 388 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3215  hypothetical protein  34.11 
 
 		 388 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0063  lipid-transfer protein  33.96 
 
 		 390 aa  167  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3952  putative thiolase  34.59 
 
 		 378 aa  166  8e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.130005  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3858  hypothetical protein  33.68 
 
 		 390 aa  164  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.198117  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1008  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  32.18 
 
 		 385 aa  163  4.0000000000000004e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.011821 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4180  putative acetyl-CoA C-acetyltransferase  30 
 
 		 394 aa  163  5.0000000000000005e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.785914  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>