More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3321 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3321  lipid-transfer protein  100 
 
 		 389 aa  794    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0828492  hitchhiker  0.000989049 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2141  lipid-transfer protein  66.84 
 
 		 392 aa  531  1e-150  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8194  lipid-transfer protein  66.92 
 
 		 390 aa  505  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3479  lipid-transfer protein  67.65 
 
 		 391 aa  503  1e-141  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13573  lipid-transfer protein  66.49 
 
 		 386 aa  500  1e-140  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000077821 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0063  lipid-transfer protein  65.63 
 
 		 390 aa  483  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2786  lipid-transfer protein  64.86 
 
 		 394 aa  484  1e-135  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0887  lipid-transfer protein  64.36 
 
 		 390 aa  480  1e-134  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3858  hypothetical protein  64.18 
 
 		 390 aa  477  1e-133  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.198117  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2621  lipid-transfer protein  64.32 
 
 		 395 aa  474  1e-132  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000528338  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0511  lipid-transfer protein  61.02 
 
 		 389 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5057  lipid-transfer protein  65.71 
 
 		 385 aa  451  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2819  lipid-transfer protein  63.8 
 
 		 389 aa  449  1e-125  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5253  lipid-transfer protein  66.75 
 
 		 385 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509405 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4758  lipid-transfer protein  66.23 
 
 		 385 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1513  lipid-transfer protein  66.23 
 
 		 385 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4672  lipid-transfer protein  66.23 
 
 		 385 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.495157  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2016  lipid-transfer protein  58.14 
 
 		 388 aa  415  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.314529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8761  lipid-transfer protein  45.57 
 
 		 385 aa  313  1.9999999999999998e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.134204 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1835  lipid-transfer protein  43.9 
 
 		 381 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.722448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3651  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  46.52 
 
 		 387 aa  259  8e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.48348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2093  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  44.39 
 
 		 385 aa  248  9e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4055  putative nonspecific lipid-transfer protein  40.75 
 
 		 397 aa  236  4e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0205444  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1971  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  40.21 
 
 		 387 aa  232  9e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0899  lipid-transfer protein  37.96 
 
 		 389 aa  231  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2103  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  37.82 
 
 		 384 aa  224  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.655505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3540  hypothetical protein  36.48 
 
 		 392 aa  222  9e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5302  putative nonspecific lipid-transfer protein  39.9 
 
 		 388 aa  221  1.9999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.739228 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5553  hypothetical protein  35.42 
 
 		 383 aa  219  7.999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0900  hypothetical protein  39.78 
 
 		 389 aa  218  1e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.049177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1026  hypothetical protein  36.41 
 
 		 396 aa  218  2e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.651118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2044  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  37.24 
 
 		 360 aa  218  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4266  hypothetical protein  40.94 
 
 		 381 aa  218  2e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.804759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2361  lipid-transfer protein  36.88 
 
 		 394 aa  217  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4021  putative nonspecific lipid-transfer protein  36.17 
 
 		 378 aa  216  4e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2839  hypothetical protein  37.7 
 
 		 388 aa  211  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00983373  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4108  diterpenoid dioxygenase  34.24 
 
 		 397 aa  205  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.742638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1803  putative nonspecific lipid-transfer protein  36.65 
 
 		 389 aa  200  3e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.851643 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4492  hypothetical protein  35.2 
 
 		 385 aa  198  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0581  hypothetical protein  33.52 
 
 		 395 aa  194  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0835832  normal  0.505436 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2367  hypothetical protein  34.95 
 
 		 393 aa  189  7e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.351877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0891  thiolase  32.34 
 
 		 405 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.849216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3512  thiolase  32.32 
 
 		 390 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0352  hypothetical protein  32.21 
 
 		 386 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000477716  decreased coverage  0.0000013738 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1902  hypothetical protein  33.17 
 
 		 396 aa  181  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.986081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4323  hypothetical protein  32.74 
 
 		 541 aa  180  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.51495 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4171  hypothetical protein  36.2 
 
 		 548 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2483  hypothetical protein  34.63 
 
 		 548 aa  176  5e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.207424 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1484  hypothetical protein  37.31 
 
 		 389 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185234  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0860  putative thiolase  36.26 
 
 		 384 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016172  normal  0.461503 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6832  DitF protein  35.23 
 
 		 396 aa  172  6.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4311  hypothetical protein  34.19 
 
 		 389 aa  172  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0906  hypothetical protein  32.74 
 
 		 394 aa  169  7e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00747371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2581  thiolase  34.45 
 
 		 385 aa  167  4e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3705  hypothetical protein  34.18 
 
 		 550 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5255  thiolase  35.35 
 
 		 389 aa  166  6.9999999999999995e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3310  hypothetical protein  34.38 
 
 		 393 aa  165  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.408434 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3765  hypothetical protein  33.92 
 
 		 550 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3692  hypothetical protein  33.92 
 
 		 550 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2277  thiolase  32.52 
 
 		 383 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.573629 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4716  DitF protein  34.64 
 
 		 453 aa  164  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5279  thiolase  34.28 
 
 		 385 aa  164  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5454  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.46 
 
 		 388 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.839799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5851  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.46 
 
 		 388 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0314395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2935  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  33.59 
 
 		 383 aa  157  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.220087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  34.7 
 
 		 388 aa  156  6e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  32.15 
 
 		 380 aa  156  7e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6845  thiolase  31.96 
 
 		 383 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0636  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.18 
 
 		 388 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.962067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0554  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.18 
 
 		 388 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1670  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.18 
 
 		 388 aa  153  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1643  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.18 
 
 		 388 aa  153  4e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1694  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.18 
 
 		 388 aa  153  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0147  thiolase  32.89 
 
 		 402 aa  152  8.999999999999999e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  31.15 
 
 		 383 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0177  thiolase  31.52 
 
 		 403 aa  152  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0129  thiolase  32.63 
 
 		 402 aa  151  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.46 
 
 		 382 aa  150  3e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5776  thiolase  32.11 
 
 		 393 aa  150  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5643  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.63 
 
 		 388 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0859  thiolase  31.7 
 
 		 389 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.823302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51190  thiolase  32.59 
 
 		 383 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113364 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6629  thiolase  34.13 
 
 		 381 aa  146  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3829  acetyl-CoA acetyltransferase  33.43 
 
 		 388 aa  145  8.000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.401188  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4413  acetyl-CoA acetyltransferase  33.88 
 
 		 389 aa  145  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00900083  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4607  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  31.4 
 
 		 390 aa  144  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.864443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4632  acetyl-CoA acetyltransferase  31.39 
 
 		 402 aa  144  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5111  thiolase  31.62 
 
 		 390 aa  143  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000299159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4368  thiolase  31.75 
 
 		 383 aa  143  5e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.739547  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3805  acetyl-CoA acetyltransferase  32.79 
 
 		 388 aa  142  7e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4071  thiolase  33.25 
 
 		 382 aa  142  8e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0529  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.9 
 
 		 388 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.384509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5499  acetyl-CoA acetyltransferase  31.79 
 
 		 391 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2931  hypothetical protein  31.88 
 
 		 379 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4565  acetyl-CoA acetyltransferase  32.26 
 
 		 388 aa  140  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153409  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3567  putative thiolase  32.46 
 
 		 378 aa  139  7e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1496  hypothetical protein  30.29 
 
 		 390 aa  138  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0342  thiolase  33.15 
 
 		 381 aa  138  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  32.15 
 
 		 390 aa  138  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4625  thiolase  30.75 
 
 		 390 aa  138  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>