More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1074 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1074  thiolase  100 
 
 		 384 aa  777    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5776  thiolase  60.26 
 
 		 393 aa  432  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4368  thiolase  57.63 
 
 		 383 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.739547  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3512  thiolase  56.62 
 
 		 390 aa  425  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51190  thiolase  56.84 
 
 		 383 aa  427  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113364 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0129  thiolase  58.27 
 
 		 402 aa  422  1e-117  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0147  thiolase  58.27 
 
 		 402 aa  422  1e-117  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5279  thiolase  57.4 
 
 		 385 aa  417  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0177  thiolase  56.1 
 
 		 403 aa  412  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0342  thiolase  57.26 
 
 		 381 aa  404  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2277  thiolase  54.97 
 
 		 383 aa  403  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.573629 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6845  thiolase  53.12 
 
 		 383 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5111  thiolase  57.31 
 
 		 390 aa  384  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000299159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4625  thiolase  54.33 
 
 		 390 aa  384  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2581  thiolase  51.45 
 
 		 385 aa  377  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6629  thiolase  52.79 
 
 		 381 aa  344  2e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5255  thiolase  50.26 
 
 		 389 aa  339  4e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  48.66 
 
 		 382 aa  331  1e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4071  thiolase  48.94 
 
 		 382 aa  322  6e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  48.42 
 
 		 383 aa  313  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2931  hypothetical protein  43.83 
 
 		 379 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  43.04 
 
 		 380 aa  304  2.0000000000000002e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1978  hypothetical protein  42.22 
 
 		 379 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960116  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3588  thiolase  43.01 
 
 		 379 aa  297  2e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3401  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  46.83 
 
 		 380 aa  297  2e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0771846 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0844  thiolase  49.74 
 
 		 384 aa  296  4e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  46.51 
 
 		 388 aa  296  5e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1879  putative lipid transfer protein  42.22 
 
 		 379 aa  295  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0403443 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1686  Acetyl-CoA acetyltransferase-like  44.53 
 
 		 379 aa  290  4e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0569144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3829  acetyl-CoA acetyltransferase  44.83 
 
 		 388 aa  283  5.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.401188  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5499  acetyl-CoA acetyltransferase  45.26 
 
 		 391 aa  280  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3805  acetyl-CoA acetyltransferase  45.4 
 
 		 388 aa  280  3e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2935  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  41.25 
 
 		 383 aa  278  1e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.220087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4413  acetyl-CoA acetyltransferase  44.03 
 
 		 389 aa  276  4e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00900083  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4565  acetyl-CoA acetyltransferase  44.03 
 
 		 388 aa  272  6e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153409  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4152  acetyl-CoA acetyltransferase  43.5 
 
 		 389 aa  270  4e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500938  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1757  acetyl-CoA acetyltransferase  43.17 
 
 		 391 aa  267  2e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439431  normal  0.143058 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7411  acetyl-CoA acetyltransferase  45.87 
 
 		 383 aa  265  8e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1502  acetyl-CoA acetyltransferase  43.5 
 
 		 390 aa  261  2e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2663  acetyl-CoA acetyltransferase  44.7 
 
 		 385 aa  261  2e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5006  acetyl-CoA acetyltransferase  43.13 
 
 		 382 aa  259  6e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  0.11432 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4787  acetyl-CoA acetyltransferase  47.61 
 
 		 387 aa  259  7e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0607631  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3607  acetyl-CoA acetyltransferase  42.32 
 
 		 382 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.241671  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3115  acetyl-CoA acetyltransferase  42.32 
 
 		 382 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119662  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0860  putative thiolase  39.73 
 
 		 384 aa  241  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016172  normal  0.461503 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2350  acetyl-CoA acetyltransferase  42.32 
 
 		 382 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.731467  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5095  acetyl-CoA acetyltransferase  42.01 
 
 		 395 aa  238  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.926475 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2839  hypothetical protein  37.78 
 
 		 388 aa  224  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00983373  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4266  hypothetical protein  38.11 
 
 		 381 aa  209  5e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.804759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1484  hypothetical protein  38.7 
 
 		 389 aa  191  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185234  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4311  hypothetical protein  36.54 
 
 		 389 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5302  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.51 
 
 		 388 aa  186  5e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.739228 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3567  putative thiolase  33.8 
 
 		 378 aa  180  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3226  hypothetical protein  34.74 
 
 		 388 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3277  hypothetical protein  34.74 
 
 		 388 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3215  hypothetical protein  34.74 
 
 		 388 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8761  lipid-transfer protein  36.16 
 
 		 385 aa  177  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.134204 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2093  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.03 
 
 		 385 aa  176  6e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0352  hypothetical protein  33.69 
 
 		 386 aa  176  6e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000477716  decreased coverage  0.0000013738 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2744  putative thiolase/acetyl-CoA acetyltransferase, PaaJ-like  32.51 
 
 		 406 aa  176  8e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0906041 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  32.22 
 
 		 388 aa  174  1.9999999999999998e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0031  hypothetical protein  31.51 
 
 		 402 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.761011  normal  0.262129 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0041  hypothetical protein  31.51 
 
 		 402 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0050  hypothetical protein  31.51 
 
 		 402 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0851197  normal  0.0510911 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2151  nonspecific lipid-transfer protein  30.81 
 
 		 403 aa  172  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1803  putative nonspecific lipid-transfer protein  33.68 
 
 		 389 aa  171  3e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.851643 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  32.89 
 
 		 390 aa  170  3e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3651  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  33.16 
 
 		 387 aa  170  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.48348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2105  thiolase  35.47 
 
 		 404 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0715913  normal  0.0186682 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4021  putative nonspecific lipid-transfer protein  32.27 
 
 		 378 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4354  thiolase  33.59 
 
 		 387 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4180  putative acetyl-CoA C-acetyltransferase  30.16 
 
 		 394 aa  166  6.9999999999999995e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.785914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  33.33 
 
 		 387 aa  166  9e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1902  hypothetical protein  32.9 
 
 		 396 aa  165  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.986081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2361  lipid-transfer protein  35.9 
 
 		 394 aa  165  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0581  hypothetical protein  31.9 
 
 		 395 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0835832  normal  0.505436 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3314  thiolase  33.52 
 
 		 404 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  31.35 
 
 		 387 aa  164  3e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  31.59 
 
 		 388 aa  164  4.0000000000000004e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  30.91 
 
 		 390 aa  162  7e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3322  thiolase  34.35 
 
 		 383 aa  162  8.000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00152041  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3972  thiolase  34.35 
 
 		 383 aa  162  8.000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.330404 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  33.42 
 
 		 386 aa  160  3e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0435  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  30.97 
 
 		 387 aa  159  6e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3952  putative thiolase  34.35 
 
 		 378 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.130005  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13573  lipid-transfer protein  31.25 
 
 		 386 aa  159  6e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000077821 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1309  acetyl-CoA acetyltransferase  32.1 
 
 		 387 aa  159  9e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0879061 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0316  acetyl-CoA C-acetyltransferase (acetoacetyl-CoA thiolase) (AcaB-6)  31.44 
 
 		 380 aa  158  1e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4492  hypothetical protein  32.44 
 
 		 385 aa  157  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2786  lipid-transfer protein  31.94 
 
 		 394 aa  156  7e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0899  lipid-transfer protein  34.52 
 
 		 389 aa  155  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8194  lipid-transfer protein  30.29 
 
 		 390 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3705  hypothetical protein  33.77 
 
 		 550 aa  153  4e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4055  putative nonspecific lipid-transfer protein  37.35 
 
 		 397 aa  153  4e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0205444  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  30.6 
 
 		 388 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1008  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  31.73 
 
 		 385 aa  152  5.9999999999999996e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.011821 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0063  lipid-transfer protein  32.03 
 
 		 390 aa  152  8e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3765  hypothetical protein  33.51 
 
 		 550 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3692  hypothetical protein  33.51 
 
 		 550 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1833  putative thiolase  31.68 
 
 		 405 aa  152  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0913085  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>