More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2509 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  80.83 
 
 
386 aa  654    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  80.62 
 
 
388 aa  658    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 
388 aa  793    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  78.81 
 
 
387 aa  632  1e-180  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  75.84 
 
 
387 aa  610  1e-173  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  71.13 
 
 
390 aa  560  1e-158  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  70.1 
 
 
390 aa  551  1e-156  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  69.25 
 
 
387 aa  541  9.999999999999999e-153  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  56.1 
 
 
388 aa  436  1e-121  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0527  acetyl-CoA acetyltransferase  52.81 
 
 
392 aa  395  1e-109  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.191077  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0459  acetyl-CoA acetyltransferase  52.54 
 
 
392 aa  392  1e-108  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221902  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1460  acetyl-CoA acetyltransferase  52.55 
 
 
392 aa  392  1e-108  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0378  acetyl-CoA acetyltransferase  52.28 
 
 
392 aa  387  1e-106  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.855021  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0021  acetyl-CoA acetyltransferase  51.65 
 
 
394 aa  385  1e-106  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0765  acetyl-CoA acetyltransferase  46.13 
 
 
388 aa  344  2e-93  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.155191  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4421  Thiolase  46.39 
 
 
394 aa  340  2e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0806685  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4354  thiolase  47.41 
 
 
387 aa  336  5e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1926  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  45.1 
 
 
392 aa  335  7.999999999999999e-91  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0597  Thiolase  49.21 
 
 
387 aa  330  3e-89  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0596  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  43.62 
 
 
392 aa  325  1e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4020  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  43.81 
 
 
392 aa  320  1.9999999999999998e-86  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.469452  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0837  acetyl-CoA acetyltransferase  46.43 
 
 
390 aa  315  9.999999999999999e-85  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0457  acetyl-CoA acetyltransferase  45.41 
 
 
391 aa  311  1e-83  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3781  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  44.96 
 
 
388 aa  311  2e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000395838  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4195  Thiolase  45.36 
 
 
390 aa  309  4e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0815171  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1631  propanoyl-CoA C-acyltransferase  43.9 
 
 
387 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0896  Thiolase  43.41 
 
 
388 aa  301  1e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0675  Beta-ketoacyl synthase  43.37 
 
 
395 aa  300  3e-80  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1437  acetyl-CoA acetyltransferase  45.93 
 
 
392 aa  298  1e-79  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0544817  normal  0.0152215 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2477  3-ketoacyl-CoA thiolase  42.64 
 
 
388 aa  296  3e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3319  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  44.07 
 
 
384 aa  295  8e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.16037  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1006  Thiolase  43.67 
 
 
388 aa  295  1e-78  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.63654  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0396  acetyl-CoA acetyltransferase  43.4 
 
 
396 aa  295  1e-78  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3523  3-ketoacyl-CoA thiolase  43.23 
 
 
384 aa  292  6e-78  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2284  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  42.71 
 
 
383 aa  285  8e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0131646  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1711  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  42.64 
 
 
386 aa  284  2.0000000000000002e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2242  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  41.82 
 
 
389 aa  283  5.000000000000001e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1309  acetyl-CoA acetyltransferase  44.02 
 
 
387 aa  282  9e-75  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0879061 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1277  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  42.04 
 
 
397 aa  281  1e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2810  Thiolase  43.15 
 
 
388 aa  276  4e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0349733  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0628  putative nonspecific lipid-transfer protein (sterol carrier protein)  43.44 
 
 
386 aa  276  5e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0435  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  42.16 
 
 
387 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0510  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  39.69 
 
 
376 aa  265  1e-69  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0558  thiolase  39.9 
 
 
407 aa  263  4e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0429  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  40.52 
 
 
386 aa  259  7e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413343  normal  0.160769 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0386  acetyl-CoA acetyltransferase  40.87 
 
 
387 aa  259  8e-68  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4151  thiolase  38.92 
 
 
386 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0423188  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2505  thiolase  38.36 
 
 
387 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.675059 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4153  thiolase family protein  38.87 
 
 
387 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526384  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2713  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  39.6 
 
 
394 aa  252  8.000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00447624  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1290  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  37.6 
 
 
378 aa  245  9e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0983  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  39.48 
 
 
384 aa  244  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3870  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  39.74 
 
 
384 aa  238  1e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2721  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  40.36 
 
 
395 aa  236  4e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3272  acetyl-CoA acetyltransferase  40.31 
 
 
386 aa  236  4e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1551  acetyl-CoA acetyltransferase  35.32 
 
 
404 aa  236  6e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1472  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  36.36 
 
 
417 aa  236  7e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3070  acetyl-CoA acetyltransferase  37.17 
 
 
400 aa  232  1e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.430335 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3505  acetyl-CoA acetyltransferase  39.03 
 
 
389 aa  231  1e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3077  acetyl-CoA acetyltransferase  37.34 
 
 
389 aa  230  3e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1384  acetyl-CoA acetyltransferase  38.24 
 
 
395 aa  229  6e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.657708  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0689  acetyl-CoA acetyltransferase  38.01 
 
 
389 aa  228  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.453794 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18950  acetyl-CoA acetyltransferase  37.56 
 
 
395 aa  227  2e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0500553  normal  0.490702 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0489  acetyl-CoA acetyltransferase  37.78 
 
 
394 aa  224  2e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.201568  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2056  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  36.13 
 
 
398 aa  224  3e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0124165  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0646  acetyl-CoA acetyltransferase  37.94 
 
 
397 aa  223  4e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1143  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  37.63 
 
 
388 aa  223  4e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.525995  hitchhiker  0.000104524 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2462  acetyl-CoA acetyltransferase  36.25 
 
 
388 aa  220  3e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4819  acetyl-CoA acetyltransferase  36.46 
 
 
389 aa  216  4e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.098551  normal  0.333333 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3283  acetyl-CoA acetyltransferase  37.37 
 
 
388 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5352  acetyl-CoA acetyltransferase  37.28 
 
 
398 aa  216  7e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57271  normal  0.485306 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2560  acetyl-CoA acetyltransferase  36.01 
 
 
389 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.800348  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4922  acetyl-CoA acetyltransferase  35.58 
 
 
386 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0040  thiolase  35.68 
 
 
421 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2160  acetyl-CoA acetyltransferase  36.27 
 
 
389 aa  213  5.999999999999999e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6295  thiolase  36.32 
 
 
392 aa  212  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5033  thiolase  34.69 
 
 
413 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0302064  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5827  thiolase  34.69 
 
 
413 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1838  thiolase  33.97 
 
 
413 aa  211  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3956  acetyl-CoA acetyltransferase  34.72 
 
 
389 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.358639  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4352  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.69 
 
 
413 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3483  Thiolase  38.32 
 
 
383 aa  211  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6077  acetyl-CoA acetyltransferase  35.2 
 
 
390 aa  210  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4309  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.19 
 
 
378 aa  210  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3558  acetyl-CoA acetyltransferase  36.27 
 
 
389 aa  210  4e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22240  acetyl-CoA acetyltransferase  36.87 
 
 
392 aa  209  5e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.392978  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2397  acetyl-CoA acetyltransferase  36.57 
 
 
389 aa  209  5e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6598  acetyl-CoA acetyltransferase  35.23 
 
 
388 aa  208  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.611085  normal  0.124058 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12803  lipid-transfer protein  34.1 
 
 
401 aa  208  1e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00155026  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1335  acetyl-CoA acetyltransferase  35.92 
 
 
460 aa  207  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3512  thiolase  36.52 
 
 
390 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3318  acetyl-CoA acetyltransferase  34.97 
 
 
389 aa  207  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2025  lipid-transfer protein  33.25 
 
 
395 aa  205  9e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.957629  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6744  acetyl-CoA acetyltransferase  35.22 
 
 
388 aa  204  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.207207  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1855  acetyl-CoA acetyltransferase  34.63 
 
 
401 aa  203  4e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0446253  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5101  Thiolase  34.24 
 
 
413 aa  203  4e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6746  thiolase  36.8 
 
 
383 aa  202  7e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00174625  normal  0.755533 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2101  acetyl-CoA acetyltransferase  34.72 
 
 
389 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0474037  hitchhiker  0.00217907 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2602  thiolase  36.57 
 
 
382 aa  201  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.263214 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2370  acetyl-CoA acetyltransferase  33.85 
 
 
392 aa  202  9.999999999999999e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>