More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2105 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2105  thiolase  100 
 
 		 404 aa  816    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0715913  normal  0.0186682 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3314  thiolase  87.13 
 
 		 404 aa  693    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3952  putative thiolase  91.01 
 
 		 378 aa  642    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.130005  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3567  putative thiolase  77.25 
 
 		 378 aa  580  1e-164  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3322  thiolase  59.09 
 
 		 383 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00152041  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3972  thiolase  59.09 
 
 		 383 aa  404  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.330404 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0860  putative thiolase  53.32 
 
 		 384 aa  372  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016172  normal  0.461503 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3886  thiolase  56.68 
 
 		 381 aa  364  1e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.266996  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  44.03 
 
 		 388 aa  295  1e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5279  thiolase  39.1 
 
 		 385 aa  230  3e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3512  thiolase  35.01 
 
 		 390 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2581  thiolase  36.64 
 
 		 385 aa  208  1e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0147  thiolase  37.53 
 
 		 402 aa  200  5e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0129  thiolase  37.27 
 
 		 402 aa  199  1.0000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6845  thiolase  35.68 
 
 		 383 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51190  thiolase  34.48 
 
 		 383 aa  196  7e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113364 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6629  thiolase  37.5 
 
 		 381 aa  194  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2277  thiolase  33.95 
 
 		 383 aa  193  4e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.573629 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4368  thiolase  34.56 
 
 		 383 aa  192  6e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.739547  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0177  thiolase  36.48 
 
 		 403 aa  191  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5255  thiolase  36.36 
 
 		 389 aa  191  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4625  thiolase  34.03 
 
 		 390 aa  191  2.9999999999999997e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5776  thiolase  36.87 
 
 		 393 aa  190  4e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.23 
 
 		 382 aa  187  3e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3226  hypothetical protein  34.69 
 
 		 388 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3215  hypothetical protein  34.69 
 
 		 388 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3277  hypothetical protein  34.69 
 
 		 388 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  36.58 
 
 		 383 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5111  thiolase  33.53 
 
 		 390 aa  182  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000299159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3829  acetyl-CoA acetyltransferase  33.76 
 
 		 388 aa  178  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.401188  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0342  thiolase  34.83 
 
 		 381 aa  176  7e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  35.92 
 
 		 380 aa  175  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4787  acetyl-CoA acetyltransferase  34.37 
 
 		 387 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0607631  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3805  acetyl-CoA acetyltransferase  32.99 
 
 		 388 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4152  acetyl-CoA acetyltransferase  33.77 
 
 		 389 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500938  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4413  acetyl-CoA acetyltransferase  32.99 
 
 		 389 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00900083  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1277  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.53 
 
 		 397 aa  171  3e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7411  acetyl-CoA acetyltransferase  36.54 
 
 		 383 aa  169  8e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4565  acetyl-CoA acetyltransferase  32.99 
 
 		 388 aa  169  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153409  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1757  acetyl-CoA acetyltransferase  34.11 
 
 		 391 aa  167  2.9999999999999998e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439431  normal  0.143058 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  31.79 
 
 		 387 aa  167  4e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4071  thiolase  33.87 
 
 		 382 aa  167  4e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1074  thiolase  34.92 
 
 		 384 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2242  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.02 
 
 		 389 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3319  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.51 
 
 		 384 aa  164  2.0000000000000002e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.16037  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5006  acetyl-CoA acetyltransferase  32.74 
 
 		 382 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  0.11432 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0896  Thiolase  30.59 
 
 		 388 aa  163  5.0000000000000005e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4180  putative acetyl-CoA C-acetyltransferase  31.93 
 
 		 394 aa  162  7e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.785914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0597  Thiolase  33.16 
 
 		 387 aa  162  8.000000000000001e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2284  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.37 
 
 		 383 aa  162  9e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0131646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2151  nonspecific lipid-transfer protein  30.47 
 
 		 403 aa  162  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3483  Thiolase  32.98 
 
 		 383 aa  161  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0457  acetyl-CoA acetyltransferase  30.93 
 
 		 391 aa  160  4e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1711  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.16 
 
 		 386 aa  160  5e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5499  acetyl-CoA acetyltransferase  33.68 
 
 		 391 aa  160  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3523  3-ketoacyl-CoA thiolase  33.07 
 
 		 384 aa  157  3e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1008  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  28.42 
 
 		 385 aa  157  4e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.011821 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4266  hypothetical protein  32.9 
 
 		 381 aa  156  5.0000000000000005e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.804759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0063  lipid-transfer protein  35.57 
 
 		 390 aa  156  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3607  acetyl-CoA acetyltransferase  31.39 
 
 		 382 aa  156  7e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.241671  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2477  3-ketoacyl-CoA thiolase  30.85 
 
 		 388 aa  156  8e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2721  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.38 
 
 		 395 aa  155  9e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  29.5 
 
 		 388 aa  155  9e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5095  acetyl-CoA acetyltransferase  34.76 
 
 		 395 aa  155  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.926475 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  31.12 
 
 		 388 aa  153  4e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2744  putative thiolase/acetyl-CoA acetyltransferase, PaaJ-like  30.89 
 
 		 406 aa  153  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0906041 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1978  hypothetical protein  32.43 
 
 		 379 aa  153  4e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960116  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0435  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.07 
 
 		 387 aa  153  5e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2839  hypothetical protein  34.28 
 
 		 388 aa  153  5e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00983373  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  29.31 
 
 		 388 aa  153  5e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3115  acetyl-CoA acetyltransferase  30.89 
 
 		 382 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119662  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2350  acetyl-CoA acetyltransferase  31.65 
 
 		 382 aa  152  7e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.731467  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0396  acetyl-CoA acetyltransferase  30.85 
 
 		 396 aa  152  7e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2141  lipid-transfer protein  33.93 
 
 		 392 aa  152  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3588  thiolase  32.43 
 
 		 379 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1879  putative lipid transfer protein  31.89 
 
 		 379 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0403443 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3401  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  34.39 
 
 		 380 aa  151  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0771846 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0837  acetyl-CoA acetyltransferase  30.34 
 
 		 390 aa  151  2e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2931  hypothetical protein  31.22 
 
 		 379 aa  151  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1437  acetyl-CoA acetyltransferase  30.83 
 
 		 392 aa  150  4e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0544817  normal  0.0152215 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4309  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.97 
 
 		 378 aa  150  5e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1460  acetyl-CoA acetyltransferase  28.54 
 
 		 392 aa  149  7e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1309  acetyl-CoA acetyltransferase  32.23 
 
 		 387 aa  149  9e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0879061 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3651  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  32.06 
 
 		 387 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.48348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0844  thiolase  36.18 
 
 		 384 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  31.55 
 
 		 387 aa  147  3e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0352  hypothetical protein  31.17 
 
 		 386 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000477716  decreased coverage  0.0000013738 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0459  acetyl-CoA acetyltransferase  28.28 
 
 		 392 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  31.76 
 
 		 387 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  29.79 
 
 		 386 aa  146  5e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0675  Beta-ketoacyl synthase  32.13 
 
 		 395 aa  147  5e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3781  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.2 
 
 		 388 aa  146  5e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000395838  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4354  thiolase  30.83 
 
 		 387 aa  146  5e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0378  acetyl-CoA acetyltransferase  29.26 
 
 		 392 aa  145  1e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.855021  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8194  lipid-transfer protein  33.16 
 
 		 390 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2663  acetyl-CoA acetyltransferase  33.24 
 
 		 385 aa  144  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1926  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.89 
 
 		 392 aa  144  3e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0021  acetyl-CoA acetyltransferase  28.54 
 
 		 394 aa  143  4e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2786  lipid-transfer protein  35.94 
 
 		 394 aa  143  5e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5302  putative nonspecific lipid-transfer protein  32.1 
 
 		 388 aa  143  5e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.739228 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>