More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_5033 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007336  Reut_C6395  thiolase  85.44 
 
 
413 aa  726    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0582995  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2744  thiolase  80.83 
 
 
412 aa  671    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569153  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1838  thiolase  75.54 
 
 
413 aa  664    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5033  thiolase  100 
 
 
413 aa  840    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0302064  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5827  thiolase  100 
 
 
413 aa  840    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4352  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  99.03 
 
 
413 aa  831    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4205  thiolase  60.1 
 
 
413 aa  474  1e-132  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5101  Thiolase  55.83 
 
 
413 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0790  thiolase  55.11 
 
 
414 aa  433  1e-120  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1472  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  50.95 
 
 
417 aa  404  1e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0113  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  41.99 
 
 
465 aa  345  7e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0040  thiolase  45.13 
 
 
421 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0558  thiolase  40.48 
 
 
407 aa  295  7e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6295  thiolase  41.99 
 
 
392 aa  279  6e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3483  Thiolase  38.94 
 
 
383 aa  245  9e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2025  lipid-transfer protein  36.82 
 
 
395 aa  232  7.000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.957629  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2338  lipid-transfer protein  38.37 
 
 
396 aa  231  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00544781 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12803  lipid-transfer protein  36.27 
 
 
401 aa  229  6e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00155026  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  38.19 
 
 
387 aa  229  8e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4309  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  36.39 
 
 
378 aa  228  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  37.08 
 
 
387 aa  228  2e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  36.52 
 
 
390 aa  227  4e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4119  lipid-transfer protein  39.36 
 
 
401 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0765  acetyl-CoA acetyltransferase  34.59 
 
 
388 aa  225  9e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.155191  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  36.69 
 
 
390 aa  225  1e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4396  lipid-transfer protein  36.41 
 
 
397 aa  224  3e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.46375  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4174  lipid-transfer protein  36.41 
 
 
397 aa  224  3e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.942812  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4240  lipid-transfer protein  36.41 
 
 
397 aa  224  3e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.256435  normal  0.231931 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1309  acetyl-CoA acetyltransferase  36.63 
 
 
387 aa  221  9.999999999999999e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0879061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4694  lipid-transfer protein  35.51 
 
 
406 aa  219  6e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2740  lipid-transfer protein  36.82 
 
 
395 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.527886  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1926  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.34 
 
 
392 aa  216  4e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0450  lipid-transfer protein  39.6 
 
 
396 aa  216  4e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.607099  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0669  lipid-transfer protein  37.56 
 
 
389 aa  216  7e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0596  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.01 
 
 
392 aa  216  7e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2532  lipid-transfer protein  36.07 
 
 
395 aa  215  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.101901  normal  0.217151 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  36.06 
 
 
386 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  36.14 
 
 
388 aa  214  2.9999999999999995e-54  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2149  lipid-transfer protein  39.36 
 
 
397 aa  213  4.9999999999999996e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1611  lipid-transfer protein  37.06 
 
 
394 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  34.52 
 
 
388 aa  212  9e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  34.69 
 
 
388 aa  211  1e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4020  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.53 
 
 
392 aa  211  2e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.469452  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0155  lipid-transfer protein  34.98 
 
 
395 aa  211  2e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4757  lipid-transfer protein  41.06 
 
 
395 aa  210  5e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5768  lipid-transfer protein  35.01 
 
 
397 aa  210  5e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5826  lipid-transfer protein  40.88 
 
 
394 aa  209  5e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4078  lipid-transfer protein  36.83 
 
 
394 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0932  lipid-transfer protein  34.83 
 
 
393 aa  208  1e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0435  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.03 
 
 
387 aa  206  7e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4151  thiolase  36.06 
 
 
386 aa  206  7e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0423188  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4071  lipid-transfer protein  36.86 
 
 
395 aa  205  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3870  thiolase  35.19 
 
 
384 aa  205  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.28834 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0178  lipid-transfer protein  39.37 
 
 
395 aa  205  1e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.925449 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4421  Thiolase  35.63 
 
 
394 aa  204  2e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0806685  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  33.97 
 
 
387 aa  204  3e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0378  acetyl-CoA acetyltransferase  35.71 
 
 
392 aa  203  4e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.855021  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3814  lipid-transfer protein  38.46 
 
 
394 aa  203  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0363497  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1512  lipid-transfer protein  37.66 
 
 
409 aa  203  5e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.427208  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1541  lipid-transfer protein  37.66 
 
 
395 aa  202  6e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1564  lipid-transfer protein  37.66 
 
 
395 aa  202  6e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0459  acetyl-CoA acetyltransferase  35.24 
 
 
392 aa  202  7e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221902  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2529  lipid-transfer protein  35.07 
 
 
397 aa  202  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.46014  normal  0.613077 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3832  lipid-transfer protein  36.43 
 
 
394 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3986  lipid-transfer protein  35.28 
 
 
394 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4354  thiolase  34.16 
 
 
387 aa  199  5e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4167  lipid-transfer protein  35.48 
 
 
396 aa  199  7e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5103  lipid-transfer protein  36.32 
 
 
393 aa  199  7e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2725  lipid-transfer protein  36.32 
 
 
394 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1460  acetyl-CoA acetyltransferase  34.52 
 
 
392 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1529  thiolase  31.18 
 
 
390 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.380974 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1631  propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.95 
 
 
387 aa  196  6e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3722  lipid-transfer protein  36.01 
 
 
394 aa  196  7e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408823  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2602  thiolase  32.82 
 
 
382 aa  195  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.263214 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2505  thiolase  34.74 
 
 
387 aa  194  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.675059 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0527  acetyl-CoA acetyltransferase  33.49 
 
 
392 aa  195  2e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.191077  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0457  acetyl-CoA acetyltransferase  32.42 
 
 
391 aa  193  4e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2474  lipid-transfer protein  35.15 
 
 
394 aa  192  9e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.093907 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4153  thiolase family protein  34.31 
 
 
387 aa  192  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526384  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0837  acetyl-CoA acetyltransferase  32.55 
 
 
390 aa  191  2e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4195  Thiolase  34.41 
 
 
390 aa  190  4e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0815171  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0743  lipid-transfer protein  34.65 
 
 
389 aa  190  4e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1814  thiolase  32.54 
 
 
417 aa  189  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1437  acetyl-CoA acetyltransferase  32.73 
 
 
392 aa  186  5e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0544817  normal  0.0152215 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0675  Beta-ketoacyl synthase  30.69 
 
 
395 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5025  lipid-transfer protein  35.25 
 
 
395 aa  184  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000479532  normal  0.301328 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04353  sterol carrier protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06380)  32.24 
 
 
458 aa  183  6e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.784343  normal  0.238789 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0021  acetyl-CoA acetyltransferase  33.02 
 
 
394 aa  182  9.000000000000001e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3523  3-ketoacyl-CoA thiolase  33.16 
 
 
384 aa  181  2e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17880  acetyl-CoA acetyltransferase  31.55 
 
 
382 aa  179  8e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.241643  normal  0.751852 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01840  conserved hypothetical protein  33.5 
 
 
466 aa  178  1e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.680862  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0386  acetyl-CoA acetyltransferase  33.33 
 
 
387 aa  175  9.999999999999999e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0396  acetyl-CoA acetyltransferase  30.97 
 
 
396 aa  175  1.9999999999999998e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3907  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.18 
 
 
381 aa  174  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114937  normal  0.102476 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3319  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.52 
 
 
384 aa  174  2.9999999999999996e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.16037  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2242  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.78 
 
 
389 aa  174  3.9999999999999995e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1711  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.62 
 
 
386 aa  172  6.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0597  Thiolase  32.84 
 
 
387 aa  172  1e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0896  Thiolase  32.2 
 
 
388 aa  171  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3781  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.45 
 
 
388 aa  171  3e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000395838  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>