More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3870 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3870  thiolase  100 
 
 		 384 aa  763    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.28834 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2602  thiolase  70.53 
 
 		 382 aa  540  9.999999999999999e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.263214 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1814  thiolase  63.39 
 
 		 417 aa  479  1e-134  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3857  thiolase  54.69 
 
 		 383 aa  380  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6746  thiolase  54.05 
 
 		 383 aa  377  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00174625  normal  0.755533 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2025  lipid-transfer protein  36.16 
 
 		 395 aa  228  1e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.957629  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1472  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  36.63 
 
 		 417 aa  222  7e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4167  lipid-transfer protein  37.53 
 
 		 396 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4694  lipid-transfer protein  35.45 
 
 		 406 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2725  lipid-transfer protein  38.99 
 
 		 394 aa  218  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12803  lipid-transfer protein  35.53 
 
 		 401 aa  218  1e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00155026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1838  thiolase  37.29 
 
 		 413 aa  215  9e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4396  lipid-transfer protein  34.51 
 
 		 397 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.46375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4174  lipid-transfer protein  34.51 
 
 		 397 aa  213  7e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.942812  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4240  lipid-transfer protein  34.51 
 
 		 397 aa  213  7e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.256435  normal  0.231931 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2338  lipid-transfer protein  37.31 
 
 		 396 aa  212  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544781 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4205  thiolase  37.82 
 
 		 413 aa  212  1e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5768  lipid-transfer protein  37.78 
 
 		 397 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2532  lipid-transfer protein  36.96 
 
 		 395 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.101901  normal  0.217151 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4309  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  37.92 
 
 		 378 aa  206  7e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5033  thiolase  35.19 
 
 		 413 aa  205  9e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0302064  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5827  thiolase  35.19 
 
 		 413 aa  205  9e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2474  lipid-transfer protein  38.07 
 
 		 394 aa  204  2e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.093907 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3483  Thiolase  37.96 
 
 		 383 aa  204  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1529  thiolase  34.73 
 
 		 390 aa  204  3e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.380974 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0932  lipid-transfer protein  32.91 
 
 		 393 aa  203  4e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3986  lipid-transfer protein  35.89 
 
 		 394 aa  203  4e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5101  Thiolase  35.46 
 
 		 413 aa  202  5e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6295  thiolase  37.83 
 
 		 392 aa  202  7e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6395  thiolase  36.57 
 
 		 413 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0582995  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4352  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.71 
 
 		 413 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1512  lipid-transfer protein  36.55 
 
 		 409 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.427208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2740  lipid-transfer protein  35.11 
 
 		 395 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.527886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1541  lipid-transfer protein  36.55 
 
 		 395 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1564  lipid-transfer protein  36.55 
 
 		 395 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0178  lipid-transfer protein  37.56 
 
 		 395 aa  200  3e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.925449 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4078  lipid-transfer protein  35.97 
 
 		 394 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  35.79 
 
 		 387 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0155  lipid-transfer protein  35.03 
 
 		 395 aa  199  6e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5826  lipid-transfer protein  36.92 
 
 		 394 aa  196  7e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  34.59 
 
 		 388 aa  196  7e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  38.01 
 
 		 386 aa  196  7e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2149  lipid-transfer protein  36.84 
 
 		 397 aa  196  8.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1611  lipid-transfer protein  33.25 
 
 		 394 aa  194  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3814  lipid-transfer protein  35.81 
 
 		 394 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0363497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5025  lipid-transfer protein  36.43 
 
 		 395 aa  194  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000479532  normal  0.301328 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3832  lipid-transfer protein  34.77 
 
 		 394 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4757  lipid-transfer protein  35.64 
 
 		 395 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0596  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  36.22 
 
 		 392 aa  191  2e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1309  acetyl-CoA acetyltransferase  36.25 
 
 		 387 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0879061 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  36.55 
 
 		 388 aa  190  4e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2744  thiolase  35.59 
 
 		 412 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3722  lipid-transfer protein  35.55 
 
 		 394 aa  189  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408823  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  34.34 
 
 		 387 aa  188  1e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0558  thiolase  32.85 
 
 		 407 aa  188  2e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4071  lipid-transfer protein  35.84 
 
 		 395 aa  187  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4119  lipid-transfer protein  35.31 
 
 		 401 aa  187  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0765  acetyl-CoA acetyltransferase  35.68 
 
 		 388 aa  186  5e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.155191  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4020  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  36.34 
 
 		 392 aa  185  9e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.469452  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04353  sterol carrier protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06380)  32.99 
 
 		 458 aa  185  1.0000000000000001e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.784343  normal  0.238789 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  33.67 
 
 		 388 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0450  lipid-transfer protein  35.22 
 
 		 396 aa  184  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.607099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1926  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.04 
 
 		 392 aa  183  4.0000000000000006e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0669  lipid-transfer protein  32.65 
 
 		 389 aa  183  5.0000000000000004e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0790  thiolase  35.64 
 
 		 414 aa  182  9.000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01840  conserved hypothetical protein  32.59 
 
 		 466 aa  181  2e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.680862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2529  lipid-transfer protein  33.58 
 
 		 397 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.46014  normal  0.613077 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5103  lipid-transfer protein  34.17 
 
 		 393 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4421  Thiolase  34.54 
 
 		 394 aa  179  9e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0806685  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11643  lipid-transfer protein  33.42 
 
 		 402 aa  179  1e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.018312  normal  0.865142 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  35.28 
 
 		 387 aa  176  6e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4195  Thiolase  36.29 
 
 		 390 aa  176  9e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0815171  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3907  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.76 
 
 		 381 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114937  normal  0.102476 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0457  acetyl-CoA acetyltransferase  33.33 
 
 		 391 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0837  acetyl-CoA acetyltransferase  34.02 
 
 		 390 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0378  acetyl-CoA acetyltransferase  31.74 
 
 		 392 aa  173  5e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.855021  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17880  acetyl-CoA acetyltransferase  33.94 
 
 		 382 aa  172  5.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.241643  normal  0.751852 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4151  thiolase  37.18 
 
 		 386 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0423188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1631  propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.83 
 
 		 387 aa  172  1e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1779  thiolase  32.72 
 
 		 381 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.187266  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1761  thiolase  32.72 
 
 		 381 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0585987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1826  thiolase  32.72 
 
 		 381 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0743  lipid-transfer protein  32.55 
 
 		 389 aa  171  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2505  thiolase  37.25 
 
 		 387 aa  169  5e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.675059 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3015  lipid-transfer protein  34.51 
 
 		 399 aa  169  6e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.630367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3061  lipid-transfer protein  34.51 
 
 		 399 aa  169  6e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.860453 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3030  lipid-transfer protein  34.51 
 
 		 399 aa  169  7e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.463243  normal  0.246741 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2713  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  38.15 
 
 		 394 aa  167  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00447624  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  33.33 
 
 		 390 aa  166  4e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3673  thiolase  32.3 
 
 		 380 aa  166  4e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.217678  normal  0.677274 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3660  thiolase  32.3 
 
 		 380 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.277113  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0527  acetyl-CoA acetyltransferase  31.14 
 
 		 392 aa  167  4e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.191077  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3733  thiolase  32.3 
 
 		 380 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.454317  normal  0.374229 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1460  acetyl-CoA acetyltransferase  31.23 
 
 		 392 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0459  acetyl-CoA acetyltransferase  30.98 
 
 		 392 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221902  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0435  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  30.15 
 
 		 387 aa  166  8e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3366  lipid-transfer protein  33.5 
 
 		 399 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190277 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1437  acetyl-CoA acetyltransferase  33.88 
 
 		 392 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0544817  normal  0.0152215 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2862  lipid-transfer protein  33.5 
 
 		 399 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0040  thiolase  34.55 
 
 		 421 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>