More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1814 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1814  thiolase  100 
 
 
417 aa  836    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2602  thiolase  63.14 
 
 
382 aa  506  9.999999999999999e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.263214 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3870  thiolase  63.39 
 
 
384 aa  479  1e-134  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.28834 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3857  thiolase  49.14 
 
 
383 aa  357  1.9999999999999998e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6746  thiolase  48.28 
 
 
383 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00174625  normal  0.755533 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3483  Thiolase  35.58 
 
 
383 aa  210  4e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2025  lipid-transfer protein  31.25 
 
 
395 aa  199  7e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.957629  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4205  thiolase  34.82 
 
 
413 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4694  lipid-transfer protein  30.91 
 
 
406 aa  196  9e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12803  lipid-transfer protein  30.77 
 
 
401 aa  194  2e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00155026  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2725  lipid-transfer protein  33.18 
 
 
394 aa  192  8e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2338  lipid-transfer protein  31.97 
 
 
396 aa  192  9e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00544781 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  32.39 
 
 
387 aa  192  1e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1838  thiolase  34.08 
 
 
413 aa  191  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  31.68 
 
 
388 aa  189  8e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  34.35 
 
 
386 aa  189  8e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5033  thiolase  32.54 
 
 
413 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0302064  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5827  thiolase  32.54 
 
 
413 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5101  Thiolase  33.02 
 
 
413 aa  188  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2532  lipid-transfer protein  33.97 
 
 
395 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.101901  normal  0.217151 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4240  lipid-transfer protein  29.81 
 
 
397 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.256435  normal  0.231931 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0596  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.1 
 
 
392 aa  187  2e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4174  lipid-transfer protein  29.81 
 
 
397 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.942812  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4396  lipid-transfer protein  29.81 
 
 
397 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.46375  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3986  lipid-transfer protein  32.13 
 
 
394 aa  187  4e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1472  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.41 
 
 
417 aa  187  4e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4020  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.1 
 
 
392 aa  187  4e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.469452  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4352  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.3 
 
 
413 aa  186  6e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0178  lipid-transfer protein  33.65 
 
 
395 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.925449 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  32.54 
 
 
387 aa  184  3e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5768  lipid-transfer protein  31.97 
 
 
397 aa  183  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6395  thiolase  32.54 
 
 
413 aa  180  4e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0582995  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1611  lipid-transfer protein  32.61 
 
 
394 aa  180  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4167  lipid-transfer protein  32.14 
 
 
396 aa  180  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2744  thiolase  32.3 
 
 
412 aa  179  9e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569153  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1529  thiolase  29.85 
 
 
390 aa  179  9e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.380974 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4309  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.9 
 
 
378 aa  179  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1926  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.82 
 
 
392 aa  179  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2474  lipid-transfer protein  32.46 
 
 
394 aa  177  3e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.093907 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4757  lipid-transfer protein  31.73 
 
 
395 aa  176  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4078  lipid-transfer protein  31.97 
 
 
394 aa  176  5e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1512  lipid-transfer protein  32.7 
 
 
409 aa  176  8e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.427208  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1631  propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.03 
 
 
387 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1541  lipid-transfer protein  32.93 
 
 
395 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1564  lipid-transfer protein  32.93 
 
 
395 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3814  lipid-transfer protein  31.25 
 
 
394 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0363497  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5826  lipid-transfer protein  31.73 
 
 
394 aa  172  7.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2740  lipid-transfer protein  32.13 
 
 
395 aa  172  9e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.527886  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4421  Thiolase  32.62 
 
 
394 aa  172  9e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0806685  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  30.73 
 
 
388 aa  172  9e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0155  lipid-transfer protein  30.77 
 
 
395 aa  171  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5025  lipid-transfer protein  32.61 
 
 
395 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000479532  normal  0.301328 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0790  thiolase  32.46 
 
 
414 aa  171  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4195  Thiolase  33.91 
 
 
390 aa  170  5e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0815171  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3722  lipid-transfer protein  31.73 
 
 
394 aa  170  5e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408823  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5103  lipid-transfer protein  31.5 
 
 
393 aa  169  6e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0932  lipid-transfer protein  29.5 
 
 
393 aa  169  7e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4071  lipid-transfer protein  30.4 
 
 
395 aa  167  4e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0669  lipid-transfer protein  30.53 
 
 
389 aa  165  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  31.06 
 
 
390 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0558  thiolase  30.13 
 
 
407 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  33.33 
 
 
388 aa  162  8.000000000000001e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6295  thiolase  32.02 
 
 
392 aa  161  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3832  lipid-transfer protein  31.25 
 
 
394 aa  161  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  30.52 
 
 
390 aa  160  3e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0765  acetyl-CoA acetyltransferase  30.94 
 
 
388 aa  160  3e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.155191  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17880  acetyl-CoA acetyltransferase  31.07 
 
 
382 aa  161  3e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.241643  normal  0.751852 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  31.6 
 
 
387 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2529  lipid-transfer protein  30.24 
 
 
397 aa  156  6e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.46014  normal  0.613077 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4119  lipid-transfer protein  30.79 
 
 
401 aa  156  6e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04353  sterol carrier protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06380)  28.67 
 
 
458 aa  154  2e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.784343  normal  0.238789 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0450  lipid-transfer protein  32.31 
 
 
396 aa  154  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.607099  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4354  thiolase  32.6 
 
 
387 aa  154  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3907  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.28 
 
 
381 aa  152  8.999999999999999e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114937  normal  0.102476 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2505  thiolase  33.77 
 
 
387 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.675059 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1761  thiolase  30.75 
 
 
381 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0585987  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1779  thiolase  30.75 
 
 
381 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.187266  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1826  thiolase  30.75 
 
 
381 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20856  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3673  thiolase  29.68 
 
 
380 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.217678  normal  0.677274 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3660  thiolase  29.68 
 
 
380 aa  152  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.277113  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3733  thiolase  29.68 
 
 
380 aa  152  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.454317  normal  0.374229 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1309  acetyl-CoA acetyltransferase  31.35 
 
 
387 aa  150  4e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0879061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4151  thiolase  32.98 
 
 
386 aa  149  9e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0423188  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2149  lipid-transfer protein  31.44 
 
 
397 aa  148  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0743  lipid-transfer protein  29.09 
 
 
389 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3588  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.5 
 
 
380 aa  146  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.193067  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11643  lipid-transfer protein  32.13 
 
 
402 aa  146  8.000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.018312  normal  0.865142 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0435  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  26.72 
 
 
387 aa  145  2e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0378  acetyl-CoA acetyltransferase  27.27 
 
 
392 aa  144  2e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.855021  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1999  thiolase  29.71 
 
 
381 aa  144  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.915594  normal  0.405565 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3119  lipid-transfer protein  33.66 
 
 
398 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1460  acetyl-CoA acetyltransferase  27.12 
 
 
392 aa  145  2e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0457  acetyl-CoA acetyltransferase  29.18 
 
 
391 aa  144  3e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0459  acetyl-CoA acetyltransferase  26.89 
 
 
392 aa  142  8e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221902  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0527  acetyl-CoA acetyltransferase  27.12 
 
 
392 aa  142  9e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.191077  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0597  Thiolase  30.22 
 
 
387 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4139  thiolase  28.81 
 
 
388 aa  141  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.948206  normal  0.281398 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4130  hypothetical protein  29.37 
 
 
384 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.468644 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0837  acetyl-CoA acetyltransferase  29.81 
 
 
390 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8928  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.76 
 
 
394 aa  140  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>