More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3814 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4078  lipid-transfer protein  92.39 
 
 		 394 aa  747    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0178  lipid-transfer protein  78.83 
 
 		 395 aa  649    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.925449 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3814  lipid-transfer protein  100 
 
 		 394 aa  805    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0363497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3722  lipid-transfer protein  91.37 
 
 		 394 aa  736    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408823  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3832  lipid-transfer protein  73.28 
 
 		 394 aa  598  1e-170  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2740  lipid-transfer protein  72.45 
 
 		 395 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.527886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4167  lipid-transfer protein  67.59 
 
 		 396 aa  562  1.0000000000000001e-159  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2532  lipid-transfer protein  70.13 
 
 		 395 aa  562  1.0000000000000001e-159  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.101901  normal  0.217151 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5103  lipid-transfer protein  69.82 
 
 		 393 aa  559  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4119  lipid-transfer protein  70.62 
 
 		 401 aa  560  1e-158  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2725  lipid-transfer protein  67.77 
 
 		 394 aa  559  1e-158  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2529  lipid-transfer protein  67.25 
 
 		 397 aa  546  1e-154  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.46014  normal  0.613077 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5025  lipid-transfer protein  65.48 
 
 		 395 aa  544  1e-154  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000479532  normal  0.301328 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0450  lipid-transfer protein  70.47 
 
 		 396 aa  536  1e-151  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.607099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0155  lipid-transfer protein  66.5 
 
 		 395 aa  535  1e-151  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3986  lipid-transfer protein  67.01 
 
 		 394 aa  519  1e-146  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5768  lipid-transfer protein  64.12 
 
 		 397 aa  516  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2474  lipid-transfer protein  64.47 
 
 		 394 aa  501  1e-141  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.093907 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4071  lipid-transfer protein  65.37 
 
 		 395 aa  492  9.999999999999999e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1512  lipid-transfer protein  64.56 
 
 		 409 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.427208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1541  lipid-transfer protein  64.56 
 
 		 395 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1564  lipid-transfer protein  64.56 
 
 		 395 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4757  lipid-transfer protein  63.73 
 
 		 395 aa  488  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5826  lipid-transfer protein  63.73 
 
 		 394 aa  489  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1611  lipid-transfer protein  60.15 
 
 		 394 aa  482  1e-135  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0669  lipid-transfer protein  60.61 
 
 		 389 aa  474  1e-132  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0932  lipid-transfer protein  61.03 
 
 		 393 aa  473  1e-132  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0743  lipid-transfer protein  58.61 
 
 		 389 aa  456  1e-127  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12803  lipid-transfer protein  56.82 
 
 		 401 aa  421  1e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00155026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2025  lipid-transfer protein  56.23 
 
 		 395 aa  414  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.957629  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4174  lipid-transfer protein  54.71 
 
 		 397 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.942812  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4396  lipid-transfer protein  54.71 
 
 		 397 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.46375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4240  lipid-transfer protein  54.71 
 
 		 397 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.256435  normal  0.231931 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4694  lipid-transfer protein  53.96 
 
 		 406 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2338  lipid-transfer protein  55.16 
 
 		 396 aa  398  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544781 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04353  sterol carrier protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06380)  48.86 
 
 		 458 aa  357  1.9999999999999998e-97  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.784343  normal  0.238789 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2149  lipid-transfer protein  51.87 
 
 		 397 aa  346  5e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01840  conserved hypothetical protein  45.89 
 
 		 466 aa  326  4.0000000000000003e-88  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.680862  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4690  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  69.1 
 
 		 234 aa  323  3e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1472  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  38.04 
 
 		 417 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3483  Thiolase  38.92 
 
 		 383 aa  210  4e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5033  thiolase  38.46 
 
 		 413 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0302064  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5827  thiolase  38.46 
 
 		 413 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4352  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  38.46 
 
 		 413 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0558  thiolase  36.25 
 
 		 407 aa  203  5e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6395  thiolase  37.38 
 
 		 413 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0582995  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4205  thiolase  35.8 
 
 		 413 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3870  thiolase  35.81 
 
 		 384 aa  194  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.28834 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1838  thiolase  37.07 
 
 		 413 aa  193  6e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1529  thiolase  33.51 
 
 		 390 aa  190  4e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.380974 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2744  thiolase  36.88 
 
 		 412 aa  189  5e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17880  acetyl-CoA acetyltransferase  36.46 
 
 		 382 aa  188  1e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.241643  normal  0.751852 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2602  thiolase  34.2 
 
 		 382 aa  189  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.263214 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6295  thiolase  34.35 
 
 		 392 aa  187  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4309  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  36.1 
 
 		 378 aa  183  6e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3857  thiolase  34.42 
 
 		 383 aa  181  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6746  thiolase  34.08 
 
 		 383 aa  180  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00174625  normal  0.755533 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0790  thiolase  36.87 
 
 		 414 aa  179  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0113  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.62 
 
 		 465 aa  178  1e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1309  acetyl-CoA acetyltransferase  36.67 
 
 		 387 aa  178  2e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0879061 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  33.42 
 
 		 387 aa  178  2e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11643  lipid-transfer protein  35.07 
 
 		 402 aa  176  6e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.018312  normal  0.865142 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3119  lipid-transfer protein  37.03 
 
 		 398 aa  176  6e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5101  Thiolase  33.83 
 
 		 413 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3907  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.5 
 
 		 381 aa  175  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114937  normal  0.102476 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  33.08 
 
 		 388 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  33.75 
 
 		 387 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1926  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.22 
 
 		 392 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0596  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.11 
 
 		 392 aa  174  2.9999999999999996e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4020  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.23 
 
 		 392 aa  174  2.9999999999999996e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.469452  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0040  thiolase  35.73 
 
 		 421 aa  173  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1814  thiolase  31.25 
 
 		 417 aa  172  7.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  34.44 
 
 		 386 aa  171  2e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3556  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  32.59 
 
 		 383 aa  169  7e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  31.42 
 
 		 387 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3660  thiolase  32.62 
 
 		 380 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.277113  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3733  thiolase  32.62 
 
 		 380 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.454317  normal  0.374229 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3673  thiolase  32.62 
 
 		 380 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.217678  normal  0.677274 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  31.55 
 
 		 390 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  30.81 
 
 		 388 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3015  lipid-transfer protein  33.33 
 
 		 399 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.630367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3061  lipid-transfer protein  33.33 
 
 		 399 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.860453 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0435  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.42 
 
 		 387 aa  161  2e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3030  lipid-transfer protein  33.33 
 
 		 399 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.463243  normal  0.246741 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  30.98 
 
 		 390 aa  160  5e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3588  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  36.26 
 
 		 380 aa  158  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.193067  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0765  acetyl-CoA acetyltransferase  30.67 
 
 		 388 aa  157  2e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.155191  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0941  lipid-transfer protein  35.43 
 
 		 398 aa  158  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.303203  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4151  thiolase  34.03 
 
 		 386 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0423188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1779  thiolase  32.46 
 
 		 381 aa  156  7e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.187266  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1761  thiolase  32.46 
 
 		 381 aa  156  7e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0585987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1826  thiolase  32.46 
 
 		 381 aa  156  7e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0457  acetyl-CoA acetyltransferase  31.51 
 
 		 391 aa  155  9e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2862  lipid-transfer protein  33.83 
 
 		 399 aa  154  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4421  Thiolase  31.91 
 
 		 394 aa  154  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0806685  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4131  putative lipid-transfer protein  31.13 
 
 		 382 aa  155  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.386123  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1437  acetyl-CoA acetyltransferase  32.34 
 
 		 392 aa  154  2e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0544817  normal  0.0152215 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  32.6 
 
 		 388 aa  152  8.999999999999999e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3568  lipid-transfer protein  34.58 
 
 		 399 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0803413 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3366  lipid-transfer protein  33.91 
 
 		 399 aa  152  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190277 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>