More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4131 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_4131  putative lipid-transfer protein  100 
 
 
382 aa  781    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.386123  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17880  acetyl-CoA acetyltransferase  64.72 
 
 
382 aa  501  1e-141  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.241643  normal  0.751852 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3556  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  57.44 
 
 
383 aa  444  1e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4345  thiolase  53.56 
 
 
381 aa  433  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.46112  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3588  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  59.42 
 
 
380 aa  432  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.193067  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1779  thiolase  52.51 
 
 
381 aa  432  1e-120  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.187266  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1826  thiolase  52.51 
 
 
381 aa  432  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20856  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1761  thiolase  52.51 
 
 
381 aa  432  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0585987  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1999  thiolase  53.03 
 
 
381 aa  432  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.915594  normal  0.405565 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3907  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  53.17 
 
 
381 aa  430  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114937  normal  0.102476 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3673  thiolase  51.72 
 
 
380 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.217678  normal  0.677274 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3660  thiolase  51.72 
 
 
380 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.277113  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3733  thiolase  51.72 
 
 
380 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.454317  normal  0.374229 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3389  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  54.62 
 
 
380 aa  409  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0952002  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2519  thiolase  50.53 
 
 
384 aa  398  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.236528  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4139  thiolase  51.32 
 
 
388 aa  398  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.948206  normal  0.281398 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4130  hypothetical protein  49.22 
 
 
384 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.468644 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0558  thiolase  34.26 
 
 
407 aa  192  9e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6295  thiolase  34.04 
 
 
392 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  33.24 
 
 
388 aa  176  5e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4757  lipid-transfer protein  34.04 
 
 
395 aa  176  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4309  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.78 
 
 
378 aa  176  6e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2725  lipid-transfer protein  32.5 
 
 
394 aa  176  8e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0435  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  30.69 
 
 
387 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0155  lipid-transfer protein  30.9 
 
 
395 aa  173  5e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5025  lipid-transfer protein  35.19 
 
 
395 aa  172  5.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000479532  normal  0.301328 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  33.78 
 
 
386 aa  172  1e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2025  lipid-transfer protein  32.35 
 
 
395 aa  171  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.957629  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1512  lipid-transfer protein  32.47 
 
 
409 aa  169  7e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.427208  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  31.49 
 
 
387 aa  169  9e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1541  lipid-transfer protein  32.47 
 
 
395 aa  169  9e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1564  lipid-transfer protein  32.47 
 
 
395 aa  169  9e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2474  lipid-transfer protein  32.89 
 
 
394 aa  168  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.093907 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0932  lipid-transfer protein  30.42 
 
 
393 aa  168  1e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3625  lipid-transfer protein  33.33 
 
 
393 aa  168  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.595778  normal  0.739146 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5826  lipid-transfer protein  32.81 
 
 
394 aa  168  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  32.66 
 
 
388 aa  168  2e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4167  lipid-transfer protein  32.72 
 
 
396 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5768  lipid-transfer protein  31.48 
 
 
397 aa  165  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1309  acetyl-CoA acetyltransferase  33.33 
 
 
387 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0879061 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0178  lipid-transfer protein  32.11 
 
 
395 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.925449 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2740  lipid-transfer protein  31.3 
 
 
395 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.527886  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4153  thiolase family protein  34.18 
 
 
387 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526384  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4119  lipid-transfer protein  31.27 
 
 
401 aa  162  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  31.97 
 
 
390 aa  162  1e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12803  lipid-transfer protein  31.37 
 
 
401 aa  162  1e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00155026  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0941  lipid-transfer protein  33 
 
 
398 aa  160  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.303203  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3119  lipid-transfer protein  32.89 
 
 
398 aa  160  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  31.91 
 
 
388 aa  160  3e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3483  Thiolase  32.98 
 
 
383 aa  160  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3832  lipid-transfer protein  30.4 
 
 
394 aa  159  5e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2505  thiolase  34.27 
 
 
387 aa  159  7e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.675059 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0386  acetyl-CoA acetyltransferase  32.57 
 
 
387 aa  158  1e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  30.98 
 
 
390 aa  159  1e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2532  lipid-transfer protein  31.75 
 
 
395 aa  159  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.101901  normal  0.217151 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4174  lipid-transfer protein  31.45 
 
 
397 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.942812  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4396  lipid-transfer protein  31.45 
 
 
397 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.46375  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4240  lipid-transfer protein  31.45 
 
 
397 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.256435  normal  0.231931 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4421  Thiolase  33.25 
 
 
394 aa  158  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0806685  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5103  lipid-transfer protein  32.04 
 
 
393 aa  158  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4694  lipid-transfer protein  30.71 
 
 
406 aa  157  4e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3814  lipid-transfer protein  31.13 
 
 
394 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0363497  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2338  lipid-transfer protein  32.47 
 
 
396 aa  154  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00544781 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3986  lipid-transfer protein  31.66 
 
 
394 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4071  lipid-transfer protein  32.01 
 
 
395 aa  153  5e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0457  acetyl-CoA acetyltransferase  32.28 
 
 
391 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1838  thiolase  28.81 
 
 
413 aa  152  7e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0837  acetyl-CoA acetyltransferase  32.1 
 
 
390 aa  152  8e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3870  thiolase  32.21 
 
 
384 aa  152  8.999999999999999e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.28834 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4078  lipid-transfer protein  30.61 
 
 
394 aa  150  4e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8928  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.18 
 
 
394 aa  150  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4020  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.07 
 
 
392 aa  149  5e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.469452  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0596  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.07 
 
 
392 aa  150  5e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0450  lipid-transfer protein  30.81 
 
 
396 aa  150  5e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.607099  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2713  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.65 
 
 
394 aa  149  6e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00447624  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1611  lipid-transfer protein  29.74 
 
 
394 aa  149  8e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1529  thiolase  29 
 
 
390 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.380974 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0743  lipid-transfer protein  30.65 
 
 
389 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1277  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  30.33 
 
 
397 aa  147  3e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1926  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  30.57 
 
 
392 aa  147  3e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1437  acetyl-CoA acetyltransferase  32.98 
 
 
392 aa  147  3e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0544817  normal  0.0152215 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4205  thiolase  30.02 
 
 
413 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3722  lipid-transfer protein  30.08 
 
 
394 aa  146  5e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408823  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  30.83 
 
 
387 aa  146  5e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6746  thiolase  29.08 
 
 
383 aa  146  6e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00174625  normal  0.755533 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2529  lipid-transfer protein  31.09 
 
 
397 aa  146  6e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.46014  normal  0.613077 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0765  acetyl-CoA acetyltransferase  30.16 
 
 
388 aa  146  8.000000000000001e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.155191  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  29.9 
 
 
387 aa  145  9e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0669  lipid-transfer protein  30.4 
 
 
389 aa  145  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4151  thiolase  30.81 
 
 
386 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0423188  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2242  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  30.41 
 
 
389 aa  144  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11643  lipid-transfer protein  31.83 
 
 
402 aa  144  3e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.018312  normal  0.865142 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3568  lipid-transfer protein  32.67 
 
 
399 aa  144  4e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0803413 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2744  thiolase  27.64 
 
 
412 aa  143  5e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569153  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0510  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  29.82 
 
 
376 aa  142  9e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3523  3-ketoacyl-CoA thiolase  30.27 
 
 
384 aa  142  9.999999999999999e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3015  lipid-transfer protein  32.33 
 
 
399 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.630367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3061  lipid-transfer protein  32.33 
 
 
399 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.860453 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4527  lipid-transfer protein  32.08 
 
 
399 aa  140  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0591575  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1551  acetyl-CoA acetyltransferase  29.32 
 
 
404 aa  140  3e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>