More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0386 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0386  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 
387 aa  796    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0435  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  70.28 
 
 
387 aa  594  1e-169  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1309  acetyl-CoA acetyltransferase  64.77 
 
 
387 aa  506  9.999999999999999e-143  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0879061 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0837  acetyl-CoA acetyltransferase  54.5 
 
 
390 aa  421  1e-117  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0457  acetyl-CoA acetyltransferase  53.21 
 
 
391 aa  416  9.999999999999999e-116  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1437  acetyl-CoA acetyltransferase  53.3 
 
 
392 aa  401  9.999999999999999e-111  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0544817  normal  0.0152215 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0396  acetyl-CoA acetyltransferase  50.52 
 
 
396 aa  388  1e-106  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0675  Beta-ketoacyl synthase  48.46 
 
 
395 aa  370  1e-101  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  43.33 
 
 
390 aa  292  9e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  41.65 
 
 
387 aa  287  2e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  42.05 
 
 
390 aa  288  2e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  42.67 
 
 
387 aa  287  2e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  43.15 
 
 
386 aa  286  5.999999999999999e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  40.66 
 
 
387 aa  281  2e-74  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  40.87 
 
 
388 aa  270  2e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  39.13 
 
 
388 aa  268  8.999999999999999e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  39.18 
 
 
388 aa  268  1e-70  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4020  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  39.74 
 
 
392 aa  262  6.999999999999999e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.469452  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4421  Thiolase  40.73 
 
 
394 aa  261  1e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0806685  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1926  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  39.32 
 
 
392 aa  258  1e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0596  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  38.82 
 
 
392 aa  256  3e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4354  thiolase  39.12 
 
 
387 aa  256  7e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0765  acetyl-CoA acetyltransferase  39.22 
 
 
388 aa  245  9e-64  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.155191  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0527  acetyl-CoA acetyltransferase  38.93 
 
 
392 aa  233  6e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.191077  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6295  thiolase  39.85 
 
 
392 aa  232  7.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0597  Thiolase  39.74 
 
 
387 aa  232  7.000000000000001e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3781  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  37.86 
 
 
388 aa  232  1e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000395838  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0459  acetyl-CoA acetyltransferase  38.42 
 
 
392 aa  231  2e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221902  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1631  propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.14 
 
 
387 aa  231  2e-59  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4153  thiolase family protein  36.9 
 
 
387 aa  230  3e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526384  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0896  Thiolase  37.21 
 
 
388 aa  229  5e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1460  acetyl-CoA acetyltransferase  38.42 
 
 
392 aa  229  6e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4151  thiolase  37.98 
 
 
386 aa  229  6e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0423188  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2477  3-ketoacyl-CoA thiolase  37.08 
 
 
388 aa  229  9e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1006  Thiolase  39.33 
 
 
388 aa  228  9e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.63654  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0378  acetyl-CoA acetyltransferase  37.66 
 
 
392 aa  226  4e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.855021  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0021  acetyl-CoA acetyltransferase  37.97 
 
 
394 aa  224  2e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2505  thiolase  35.53 
 
 
387 aa  223  4e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.675059 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4195  Thiolase  38.07 
 
 
390 aa  223  6e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0815171  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3523  3-ketoacyl-CoA thiolase  34.02 
 
 
384 aa  209  5e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1838  thiolase  36.46 
 
 
413 aa  209  5e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3272  acetyl-CoA acetyltransferase  37.95 
 
 
386 aa  209  8e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2242  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.88 
 
 
389 aa  207  3e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2810  Thiolase  35.75 
 
 
388 aa  205  1e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0349733  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1277  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.46 
 
 
397 aa  205  1e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2721  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  37.24 
 
 
395 aa  203  5e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3319  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.5 
 
 
384 aa  201  9.999999999999999e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.16037  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2782  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  36.66 
 
 
392 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.133795  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1711  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.99 
 
 
386 aa  199  6e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0628  putative nonspecific lipid-transfer protein (sterol carrier protein)  35.31 
 
 
386 aa  199  9e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1529  thiolase  33.16 
 
 
390 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.380974 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2284  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.59 
 
 
383 aa  197  4.0000000000000005e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0131646  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3070  acetyl-CoA acetyltransferase  33.99 
 
 
400 aa  196  6e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.430335 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2744  thiolase  33.92 
 
 
412 aa  193  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569153  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4352  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.59 
 
 
413 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5033  thiolase  33.33 
 
 
413 aa  189  7e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0302064  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5827  thiolase  33.33 
 
 
413 aa  189  7e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0270  acetyl-CoA acetyltransferase  34.69 
 
 
391 aa  187  3e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00178908  normal  0.140204 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0558  thiolase  33.67 
 
 
407 aa  186  5e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3483  Thiolase  35.25 
 
 
383 aa  186  5e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1384  acetyl-CoA acetyltransferase  34.61 
 
 
395 aa  186  6e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.657708  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1855  acetyl-CoA acetyltransferase  34.41 
 
 
401 aa  185  9e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0446253  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2713  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.68 
 
 
394 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00447624  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3239  acetyl-CoA acetyltransferase  33.25 
 
 
398 aa  184  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.672752  normal  0.733298 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0932  lipid-transfer protein  32.15 
 
 
393 aa  184  3e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6077  acetyl-CoA acetyltransferase  34.52 
 
 
390 aa  184  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2160  acetyl-CoA acetyltransferase  34.28 
 
 
389 aa  183  5.0000000000000004e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1472  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.5 
 
 
417 aa  182  6e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6395  thiolase  33.5 
 
 
413 aa  182  7e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0582995  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1551  acetyl-CoA acetyltransferase  32.23 
 
 
404 aa  182  8.000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0841  propanoyl-CoA C-acyltransferase  28.94 
 
 
371 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000470716 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12803  lipid-transfer protein  34.26 
 
 
401 aa  180  4e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00155026  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0489  acetyl-CoA acetyltransferase  33.5 
 
 
394 aa  180  4e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.201568  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22240  acetyl-CoA acetyltransferase  34.45 
 
 
392 aa  180  4e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.392978  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1335  acetyl-CoA acetyltransferase  35.14 
 
 
460 aa  179  4.999999999999999e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3505  acetyl-CoA acetyltransferase  34.7 
 
 
389 aa  179  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2462  acetyl-CoA acetyltransferase  33.92 
 
 
388 aa  177  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2560  acetyl-CoA acetyltransferase  33.07 
 
 
389 aa  177  2e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.800348  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0941  lipid-transfer protein  36.96 
 
 
398 aa  176  5e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.303203  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2025  lipid-transfer protein  33.25 
 
 
395 aa  176  8e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.957629  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  32.8 
 
 
388 aa  175  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6744  acetyl-CoA acetyltransferase  33.07 
 
 
388 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.207207  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0510  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.22 
 
 
376 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0040  thiolase  33.65 
 
 
421 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3077  acetyl-CoA acetyltransferase  34.34 
 
 
389 aa  173  5e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4205  thiolase  31.03 
 
 
413 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3956  acetyl-CoA acetyltransferase  32.38 
 
 
389 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.358639  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18950  acetyl-CoA acetyltransferase  33.75 
 
 
395 aa  172  7.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0500553  normal  0.490702 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4167  lipid-transfer protein  34.1 
 
 
396 aa  172  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0646  acetyl-CoA acetyltransferase  33.76 
 
 
397 aa  172  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4309  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.89 
 
 
378 aa  171  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6598  acetyl-CoA acetyltransferase  33.07 
 
 
388 aa  171  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.611085  normal  0.124058 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2338  lipid-transfer protein  33.08 
 
 
396 aa  171  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00544781 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5101  Thiolase  32.41 
 
 
413 aa  171  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  31.35 
 
 
380 aa  170  3e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0689  acetyl-CoA acetyltransferase  33.25 
 
 
389 aa  170  4e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.453794 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2056  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.43 
 
 
398 aa  170  4e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0124165  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4922  acetyl-CoA acetyltransferase  32.13 
 
 
386 aa  169  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4131  putative lipid-transfer protein  32.57 
 
 
382 aa  168  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.386123  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4240  lipid-transfer protein  33.16 
 
 
397 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.256435  normal  0.231931 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>